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理學(xué)]3-1-蛋白質(zhì)分子設(shè)計(jì)-展示頁(yè)

2025-01-28 02:36本頁(yè)面
  

【正文】 ,親水 )。 ?根據(jù)模建的人 干擾素 ?的三維結(jié)構(gòu),計(jì)算分子表面,確定了表面暴露的殘基。 設(shè)計(jì)方案 : 將 Tyr24與 Asn84突變 為 Cys 實(shí)驗(yàn)結(jié)果: 突變體的穩(wěn)定性大大提高 突變體 : 55℃ 70%活性 野生型 : 55℃ 10%活性 蛋白質(zhì)分子設(shè)計(jì)的實(shí)例之二 可溶的 ?干擾素突變體的設(shè)計(jì) 面臨的問(wèn)題 ? ?干擾素 是一種重要的治療藥物。 ?二者附近沒(méi)有干擾形成二硫鍵的基團(tuán)。 蛋白質(zhì)分子設(shè)計(jì)的原則 ?活性設(shè)計(jì) : 活性中心 ,催化部位 ?對(duì)專(zhuān)一性的設(shè)計(jì) : 底物結(jié)合部位 ?框架設(shè)計(jì) : 蛋白質(zhì)分子的立體結(jié)構(gòu)設(shè)計(jì) ?疏水基團(tuán)與親水基團(tuán)的合理分布 ?氨基酸側(cè)鏈幾何排列 ?為提高一種性能而進(jìn)行的 結(jié)構(gòu)改造 對(duì)其他結(jié)構(gòu) /性能的影響最小 蛋白質(zhì)分子設(shè)計(jì)的實(shí)例之一 目標(biāo) : 核糖核酸酶的熱穩(wěn)定性的提高 已知條件 : ?核糖核酸酶三維結(jié)構(gòu)已由晶體衍射方法測(cè)定。消除鼠源性抗體的免疫原性,使其人源化,是目前抗體工程領(lǐng)域重要的研究方向。 蛋白質(zhì)分子的模擬肽設(shè)計(jì) ?骨架殘基設(shè)計(jì),肽庫(kù)篩選 ?以結(jié)構(gòu)為模板的分子設(shè)計(jì) 。 ?第三種情況是蛋白質(zhì)大分子的藥物設(shè)計(jì),主要是設(shè)計(jì)能夠改變蛋白質(zhì)天然性能的新型突變體。 藥物設(shè)計(jì) ?三個(gè)層次: ?一是小分子化合物的藥物設(shè)計(jì)。之內(nèi)(疏水作用) 蛋白質(zhì)分子設(shè)計(jì)的應(yīng)用 1. 酶穩(wěn)定性的改善 2. 藥物設(shè)計(jì) 3. 抗體分子的人源化設(shè)計(jì) 4. 蛋白質(zhì)分子的模擬肽設(shè)計(jì) 5. 蛋白質(zhì)分子改造 6. 蛋白質(zhì)的從頭設(shè)計(jì) 酶穩(wěn)定性的改善 ?酶的穩(wěn)定性。為弱靜電作用 靜電作用 異性帶電基團(tuán)的作用 范德華作用 ?所有距離在 4197。 Arg的胍基、 Lys的 氨基 Asp、 Glu的 羧基 4197。 ?作用距離一般在 3197。 ? 先講理論 ? 后面舉幾個(gè)例子 蛋白質(zhì)分子設(shè)計(jì)策略 ? 理性設(shè)計(jì)策略 – 前提 :充分了解結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系 ? 隨機(jī)突變 +功能篩選 – 前提 :不了解結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系 ? 理性設(shè)計(jì) +隨機(jī)突變 +功能篩選 – 前提 :不完全了解結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系 分子設(shè)計(jì)的種類(lèi) ?小改: 少數(shù)殘基的替換,突變或修飾 ?中改: 分子拼接,肽段或結(jié)構(gòu)域的替換 ?大改: 從頭設(shè)計(jì),全新蛋白質(zhì)的設(shè)計(jì) 蛋白質(zhì)分子設(shè)計(jì)考慮的因素 1. 氨基酸 2. 肽鏈特性 3. 蛋白質(zhì)構(gòu)象的特點(diǎn) 4. 蛋白質(zhì)分子間的作用 5. 蛋白質(zhì)分子內(nèi)的作用 氨基酸的性質(zhì) ?電荷 ?酸堿性 ?親水性、疏水性 ?多肽鏈的酰胺平面是剛性的,但酰胺平面之間的相對(duì)位置可以變化。 ?蛋白質(zhì)工程是在深入了解 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能關(guān)系 的基礎(chǔ)上,利用 化學(xué) 和 分子生物學(xué)方法 有目的地改造蛋白質(zhì),使之性能得到改善。第三章 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)改造 主要內(nèi)容 ? 第一節(jié) 蛋白質(zhì)分子設(shè)計(jì) ? 第二節(jié) 蛋白質(zhì)的化學(xué)修飾 ? 第三節(jié) 蛋白質(zhì)的分子生物學(xué)改造 第一節(jié) 蛋白質(zhì)的分子設(shè)計(jì) ?分子生物學(xué)最激動(dòng)人心的進(jìn)展之一是能夠設(shè)計(jì)和生產(chǎn) 新 型 的蛋白質(zhì)分子 。 ?重組 DNA技術(shù) 使人們能夠定向改變蛋白質(zhì)中的氨基酸序列,包括氨基酸的取代、插入或缺失,甚至包括蛋白質(zhì)的融合等。 ?作為蛋白質(zhì)工程的組成部分, 蛋白質(zhì)分子設(shè)計(jì) 在其中起著十分重要的作用。 ?? CNCaC ?? NCaCN 肽鏈的特性 蛋白質(zhì)分子的相互作用 蛋白質(zhì) 蛋白質(zhì)相互作用類(lèi)別 ?酶 底物相互作用 ?受體 配體相互作用 ?抗原 抗體相互作用
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