【正文】 (allosterism)：一個(gè)亞基的構(gòu)象改變而引起其余亞基和整個(gè)分子構(gòu)象、性質(zhì)和功能發(fā)生改變。 ? 維持蛋白質(zhì)構(gòu)象的作用力：氫鍵、鹽鍵、疏水鍵、范德華力、二硫鍵 ? 一級結(jié)構(gòu)決定空間結(jié)構(gòu) ,空間結(jié)構(gòu)是功能的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)，功能是空間結(jié)構(gòu)的外在表現(xiàn)，空間結(jié)構(gòu)尤其活性中心構(gòu)象變化，功能變化。 不規(guī)則卷曲 (randomcoil)：沒有確定規(guī)律性的松散肽鏈結(jié)構(gòu)。 β轉(zhuǎn)角 :多肽鏈 180。 ψ＝＋ 135176。；重復(fù)單位 。 平行 (Parallel)： φ＝－ 119176。上升 ；第 N個(gè)氨基酸殘基的羰基氧與第 N＋ 4個(gè)氨基酸殘基的氨基氫形成氫鍵，走向平行于螺旋軸； R側(cè)鏈基團(tuán)伸向螺旋的外側(cè)，其大小、形狀及電荷等影響此結(jié)構(gòu)形成。 ψ＝－ 47176。 ? 測定每條小肽片段中的氨基酸排列順序（通常用 Edman降解法） ? 推斷蛋白質(zhì)的氨基酸排列順序（重疊肽拼湊） ? 確定二硫鍵和酰胺基的位置。 堿水解法： 6mol/LNaOH煮沸 6h,完全水解，消旋， Ser、 Thr、 Arg、 Lys和 Cys破壞。 ? 氨基酸組成分析：水解樣品，氨基酸自動(dòng)分析儀測定。 ? 拆分二硫鍵。 ？ 一級結(jié)構(gòu)測定步驟： ? 純化樣品， N端或 C端末端分析，測定由幾條肽鏈組成。 凱氏定氮法： 100g樣品中蛋白質(zhì)含量 (g%)=每克樣品含氮克數(shù) 100 20種基本氨基酸的名稱 、結(jié)構(gòu)及縮寫。 二 .簡答題 ? 生物學(xué)功能：生物催化 (酶 )；代謝調(diào)節(jié) (多肽激素等 )；免疫保護(hù) (免疫球蛋白 ,補(bǔ)體等 )；物質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)和貯存 (離子通道 ,轉(zhuǎn)運(yùn)載體等 )；運(yùn)動(dòng)與支持 (肌蛋白 )；生長、繁殖、遺傳和變異；生物膜的功能和受體等。 等電聚焦電泳：外加電場，蛋白質(zhì)混合物在具有 pH 梯度的介質(zhì)中移向并停留聚焦在等電點(diǎn) pH處，形成區(qū)帶而將具不同等電點(diǎn)的蛋白質(zhì)分離的一種技術(shù)。 親和層析：利用共價(jià)連接有特異配體的層析介質(zhì)，分離蛋白質(zhì)混合物中能特異結(jié)合配體的目的蛋白或其他分子的層析技術(shù)。 離子交換層析： IEC，依據(jù)流動(dòng)相中的組分離子與離子交換劑（固定相）上的平衡離子進(jìn)行可逆交換時(shí)的結(jié)合力大小的差別而進(jìn)行分離的一種層析技術(shù)。 層析：利用混合物中各組分物理化學(xué)性質(zhì)差異，使各組分以不同程度分布在兩相中（固定相，流過此固定相的流動(dòng)相 )，并使各組分以不同速度移動(dòng)，從而分離的方法。 電泳：通過帶電顆粒能在電場中移動(dòng)，其泳動(dòng)速率取決于荷質(zhì)比（凈電荷、大小、形狀）的原理，將具不同荷質(zhì)比的分子分開的一種分離純化方法。 但聚集沉淀析出。 血紅蛋白：由四個(gè)三級結(jié)構(gòu)幾乎與肌紅蛋白相同的亞基（ α2β2）和四個(gè)血紅素輔基組成的 能結(jié)合氧并使氧從肺轉(zhuǎn)運(yùn)到外周組織的球狀寡聚蛋白。 球蛋白：分子形狀似球形，較易溶于水一類活性蛋白，如肌紅蛋白、血紅蛋白和胰島素等。 蛋白質(zhì)復(fù)性：變性蛋白質(zhì)解除變性因素后，重新形成蛋白質(zhì)天然構(gòu)象。 別構(gòu)效應(yīng)：別 構(gòu)劑與蛋白質(zhì)別構(gòu)部位結(jié)合而引起其亞基和整個(gè)分子構(gòu)象、性質(zhì)和功能發(fā)生改變。 分子伴娘：幫助其他含多肽結(jié)構(gòu)的物質(zhì)在體內(nèi)進(jìn)行正確的非共價(jià)的組裝的蛋白質(zhì)。 蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu)：多肽鏈上的所有原子（包括主鏈和側(cè)鏈）在三維空間的分布。 模序：多肽鏈中在空間上靠近的一些二級結(jié)構(gòu)單元彼此相互作用，形成的有規(guī)則的，在空間上能辨認(rèn)的二級結(jié)構(gòu)組合（聚集）體。）旋轉(zhuǎn)的旋轉(zhuǎn)角度 ψ角。）旋轉(zhuǎn)的旋轉(zhuǎn)角度 φ角和 CaC 鍵在（－ 180176。 二面角 (φ， ψ)：決定了相鄰肽平面的相對空間位置的 NCa 鍵在（－ 180176。 蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)：蛋白質(zhì)分子中氨基酸殘基的排列順序。 結(jié)合蛋白質(zhì)：由單純蛋白質(zhì)和非蛋白輔基 ——核酸、糖、脂、磷、金屬和色素等結(jié)合構(gòu)成。 二硫鍵：兩個(gè)半胱氨酸側(cè)鏈巰基脫氫氧化形成的共價(jià)鍵，是維持某些蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)穩(wěn)定的重要因素。 N端：多肽鏈具游離的氨基的一端。 寡肽： 25個(gè)以下氨基酸殘基形成的肽。 肽鍵：一個(gè)氨基酸的 α羧基與另一氨基酸的 α氨基脫水縮合形成的鍵。 Sanger 反應(yīng)：堿性條件下氨基酸 αNH2 的 H 原子被 2,4二硝基氟苯的烴基二硝基苯基取代生成二硝基苯基氨基酸（黃色）的烴基化反應(yīng)。 Edman反應(yīng)：堿性條件下氨基酸 αNH2 的 H原子被異硫氰酸苯酯（ PITC）烴基苯氨基硫甲?；〈杀桨被蚣柞０被幔?PTC氨基酸），無水 HF 中生成苯乙內(nèi)酰硫脲衍生物（ PTH氨基酸：無色）的烴基化反應(yīng)。 茚三酮反應(yīng)：氨基酸與茚三酮在弱酸性溶液中加熱產(chǎn)生藍(lán)紫色（脯氨酸、羥脯氨酸黃色）有色化合物的反應(yīng)。 非蛋白質(zhì)氨基酸：不構(gòu)成蛋白質(zhì)氨基酸； 150 多種，多為標(biāo)準(zhǔn) AA 衍生物，還有 β， γ， δ氨基酸， D型氨基酸。 必需氨基酸：人體自身不能合成或合成的量不足 ,必須通過食物供應(yīng)的氨基酸。 蛋白質(zhì)化學(xué)習(xí)題 一 .名詞解釋 氨基酸：含有氨基的羧酸，是肽和蛋白質(zhì)的構(gòu)件分子。如建立 DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模型；興起重組 DNA技術(shù)；人類基因組研究 黃金時(shí)期（本世紀(jì)初 —）：后基因組時(shí)期。如脂類、糖類和氨基酸性質(zhì)的系統(tǒng)研究； 發(fā)現(xiàn)可溶性催化劑 (酶 ) 建立與發(fā)展階段 (20c 初 20c 中葉 )：重要分子的發(fā)現(xiàn)和物質(zhì)代謝途徑的確定。 2．生物化學(xué)經(jīng)歷了哪幾個(gè)發(fā)展階段？各個(gè)時(shí)期研究的主要內(nèi)容是什么？試舉各時(shí)期一二例重大成就。 動(dòng)態(tài)生物化學(xué)：構(gòu)成生物體的基本化學(xué)成分在生命活動(dòng)過程中的變化規(guī)律（物質(zhì)代謝和能量代謝）。1．什么是生物化學(xué)？它主要研究哪些內(nèi)容？ 研究活細(xì)胞和有機(jī)體中存在的各種化 學(xué)成分及其所參與的化學(xué)反應(yīng) —生命現(xiàn)象化學(xué)基礎(chǔ)的一門科學(xué)。 研究內(nèi)容： 靜態(tài)生物化學(xué)：構(gòu)成生物體的基本物質(zhì)的結(jié)構(gòu)、性質(zhì)及結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系。 信息生物化學(xué)：包括核酸的生物合成，蛋白質(zhì)的生物合成，物質(zhì)代謝與基因表達(dá)的調(diào)控等。 準(zhǔn)備和醞釀階段（ 18c中期 20c初）：研究生物體的化學(xué)組成。如確定了生物體內(nèi)主要的物質(zhì)代謝途徑；發(fā)現(xiàn)了多種激素、必需氨基酸 ,必需脂肪酸和多種維生素 深入發(fā)展階段 (20c中葉 20c末 )：分子生物學(xué)時(shí)期。如功能基因組學(xué)、蛋白組學(xué)、藥物基因組學(xué)等研究。 蛋白質(zhì)的稀有氨基酸：非編碼 氨基酸，標(biāo)準(zhǔn)氨基酸的衍生物。 包括 Thr、 Lys、 Phe、 Met、 Trp、 Leu、 Ile、 Val八種。 氨基酸等電點(diǎn)（ pI）：解離成陰、陽離子的程度及趨勢相等，氨基酸主要為兼性離子，溶液凈電荷為零時(shí)溶液 pH。用于氨基酸定性 、定量分析。可重復(fù)測定多肽鏈 N端氨基酸排列順序，是氨基酸自動(dòng)測序的基礎(chǔ)?？捎糜?N端分析。 肽：氨基酸通過肽鍵相連而形成的化合物。 多肽：多于 25個(gè)氨基酸殘基形成的肽。 C端：多肽鏈具游離的羧基的一端。 蛋白質(zhì)：由不同的 α氨基酸按一定的序列通過肽鍵縮合而成的，具有較穩(wěn)定的構(gòu)象并具有一定生物功能的大分子。 寡聚蛋白：二條或二條以上肽鏈 非共價(jià)結(jié)合。 肽單位：與肽鍵相關(guān)的 6個(gè)原子形成的一個(gè)剛性平面?！?80176。—＋ 180176。 蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)：肽鏈的局部空間結(jié)構(gòu)，多肽鏈本身的折疊和盤繞形成的空間結(jié)構(gòu)單元。 結(jié)構(gòu)域：球狀蛋白質(zhì) 的折疊單位，多肽鏈上某些模體或模序相互聯(lián)系，進(jìn)一步形成可明顯區(qū)分空間結(jié)構(gòu)區(qū)域 ,并具有特定的生物學(xué)功能的緊密的近似球形的結(jié)構(gòu)。 蛋白質(zhì)四級結(jié)構(gòu)：蛋白質(zhì)分子內(nèi)非共價(jià)鍵連接的各自具有獨(dú)立三級結(jié)構(gòu)的多肽亞基的種類、數(shù)量以及各個(gè)亞基在蛋白質(zhì)分子內(nèi)的空間排布和相互作用。 同源蛋白質(zhì)：在不同生物體中行使相同或相似功能且具有明顯的氨基酸序列相似性的蛋白質(zhì)。 波爾效應(yīng)： CO2降低血紅蛋白對氧親和力（ CO2濃度的增加降低細(xì)胞內(nèi)的 pH，血紅蛋白結(jié)合 H＋和 CO2使得血紅蛋白對氧親和力下降） 蛋白質(zhì)變性：理化因素作用下 ,蛋白質(zhì)分子內(nèi)的二硫鍵和非共價(jià)鍵被破壞 ,分子內(nèi)部原有的高度規(guī)律性的空間排列發(fā)生變化，天然構(gòu)象發(fā)生變化 ,引起蛋白質(zhì)理化性質(zhì)和活性的改變（原有性質(zhì)發(fā)生部分或全部喪失）。 纖維蛋白：分子形狀似纖維，難溶于水、韌性大的一 類結(jié)構(gòu)蛋白，如角蛋白和膠原蛋白。 肌紅蛋白：由一條多肽鏈（ 153 個(gè)氨基酸殘基）和一個(gè)血紅素輔基（ hemeprostheticgroup）組成的能結(jié)合氧并使氧在肌肉內(nèi)迅速擴(kuò)散的球狀蛋白質(zhì)。 鹽析：高濃度中性鹽破壞蛋白質(zhì)分子水膜、中和其電荷 ,蛋白質(zhì)不變性。 鹽溶：稀濃度中 性鹽使蛋白質(zhì)表面同性電荷增加，增加蛋白質(zhì)分子間的排斥 ,同時(shí)增強(qiáng)蛋白質(zhì)分子與水分子間的作用 ,而使蛋白質(zhì)溶解性增加。 透析：通過小分子能透過半透膜擴(kuò)散到水或緩沖液的原理，將小分子與生物大分子分開的一種分離純化技術(shù)。 超濾：利用 壓力或離心力使小分子溶質(zhì)通過半透膜而蛋白質(zhì)被截留在膜上而分離的一種技術(shù)。 凝膠過濾層析：一種利用帶孔凝膠珠作基質(zhì)，按照分子大小分離蛋白質(zhì)或其他分子混合物的層析技術(shù)。 SDS聚丙烯酰胺凝膠電泳：通過變性劑十二烷基硫酸鈉（ SDS）作用使蛋白質(zhì)變性并與 SDS 結(jié) 合，形成均帶負(fù)電（ SDS 帶負(fù)電），荷質(zhì)比相同的 SDS蛋白質(zhì)復(fù)合物，利用帶孔凝膠珠作基