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生物化學(xué)王鏡巖(第三版)課后習(xí)題解答-文庫(kù)吧資料

2025-06-21 21:14本頁(yè)面
  

【正文】 了兩個(gè)四肽和有利的Lys,說(shuō)明十肽中含Lys…或Arg…LysLys…或ArgLys…Lys…ArgLys…四種可能的肽段,且水解位置在4與5與6或4與8與9與10之間; (3)梭菌蛋白酶專一裂解Arg殘基的羧基端肽鍵,處理該十肽后,產(chǎn)生一個(gè)四肽和一個(gè)六肽,則可知該十肽第四位為Arg; (4)溴化氰只斷裂由Met殘基的羧基參加形成的肽鍵,處理該十肽后產(chǎn)生一個(gè)八肽和一個(gè)二肽,說(shuō)明該十肽第八位或第二位為Met;用單字母表示二肽為NP,即AsnPro,故該十肽第八位為Met; (5)胰凝乳蛋白酶斷裂Phe、Trp和Tyr等疏水氨基酸殘基的羧基端肽鍵,處理該十肽后,產(chǎn)生兩個(gè)三肽和一個(gè)四肽,說(shuō)明該十肽第三位、第六位或第七位為T(mén)rp或Phe; (6)一輪Edman降解分析N末端,根據(jù)其反應(yīng)規(guī)律,可得N末端氨基酸殘疾結(jié)構(gòu)式為:NHCH(CH2OH)C(=O),還原為NHCH(CH2OH)COOH,可知此為Ser; 結(jié)合(1)、(2)、(3)、(4)、(5)、(6)可知該十肽的氨基酸序列為:SerGluTyrArgLysLysPheMetAsnPro一個(gè)四肽,經(jīng)胰蛋白酶水解得兩個(gè)片段,一個(gè)片段在280nm附近有強(qiáng)的光吸收,并且Pauly反應(yīng)和坂口反應(yīng)(檢測(cè)胍基的)呈陽(yáng)性。綜合(1)、(2)、(3)、(4)可得結(jié)果。試指出在該天然多肽中二硫鍵的位置。試問(wèn)此七肽的一級(jí)結(jié)構(gòu)怎樣?[它是一個(gè)環(huán)肽,序列為:PheSerAlaTyrLysProArg]解:(1)此肽未經(jīng)糜蛋白酶處理時(shí),與FDNB反應(yīng)不產(chǎn)生αDNP氨基酸,說(shuō)明此肽不含游離末端NH2,即此肽為一環(huán)肽; (2)糜蛋白酶斷裂Phe、Trp和Tyr等疏水氨基酸殘基的羧基端肽鍵,由已知兩肽段氨基酸組成(Ala、Tyr、Ser和Pro、Phe、Lys、Arg)可得:( )( )Tyr和( )( )( )Phe; (3)由(2)得的兩肽段分別與FDNB反應(yīng),分別產(chǎn)生DNPSer和DNPLys可知該兩肽段的N末端分別為Ser和Lys,結(jié)合(2)可得:SerAlaTyr和Lys( )( )Phe; (4)胰蛋白酶專一斷裂Arg或Lys殘基的羧基參與形成的肽鍵,由題生成的兩肽段氨基酸組成(Arg、Pro和Phe、Tyr、Lys、Ser、Ala)可得:ProArg和( )( )( )( )Lys; 綜合(2)、(3)、(4)可得此肽一級(jí)結(jié)構(gòu)為:LysProArgPheSerAlaTyr三肽Lys Lys Lys的pI值必定大于它的任何一個(gè)個(gè)別基團(tuán)的pKa值,這種說(shuō)法是否正確?為什么?[正確,因?yàn)榇巳奶幱诘入婞c(diǎn)時(shí),七解離集團(tuán)所處的狀態(tài)是C末端COO(pKa=),N末端NH2(pKa≌),3個(gè)側(cè)鏈3(1/3ε NH3+)(pKa=),因此pI最大的pKa值()]一個(gè)多肽可還原為兩個(gè)肽段,它們的序列如下:鏈1為AlaCysPheProLysArgTrpCysArg ArgValCys;鏈2為CysTyrCysPheCys。這兩個(gè)肽段分別與FDNB反應(yīng),可分別產(chǎn)生DNPSer和DNPLys。此肽未經(jīng)糜蛋白酶處理時(shí),與FDNB反應(yīng)不產(chǎn)生αDNP氨基酸。由題,得到的一條肽(Asp、Ala、Tyr)結(jié)合(3)、(4)可得該肽的氨基酸序列為:AsnAlaTyrGluLysHisGlnVal某多肽的氨基酸序列如下:GluValLysAsnCysPheArgTrpAspLeuGlySerLeuGlu AlaThrCysArgHisMetAspGlnCysTyrProGlyGlu_GluLys。問(wèn)A肽的氨基酸序列如何?[AsnAlaTyrGluLysHisGlnVal]解:N末端分析:FDNB法得:Asp; C末端分析:羧肽酶法得:Val; 胰蛋白酶只斷裂賴氨酸或精氨酸殘基的羧基形成的肽鍵,得到的是以Arg和Lys為C末端殘基的肽斷。如果我們?cè)趯?shí)驗(yàn)中將A肽用胰蛋白酶降解時(shí),得到兩種肽,其中一種(Lys、Asp、Glu、Ala、Tyr),凈電荷為零,另一種(His、Glu以及Val)可給除DNPHis,帶正電荷。習(xí)題,含10種氨基酸,并假設(shè)每種氨基酸在該蛋白質(zhì)分子中的數(shù)目相等,問(wèn)這種蛋白質(zhì)有多少種可能的排列順序?[10100]解:1012000/120=10100 有一個(gè)A肽,經(jīng)酸解分析得知為L(zhǎng)ys、His、Asp、GluAla以及Val、Tyr和兩個(gè)NH3分子組成。近二、三十年發(fā)展起來(lái)的固相肽合成是控制合成技術(shù)上的一個(gè)巨大進(jìn)步,它對(duì)分子生物學(xué)和基因工程也就具有重要影響和意義。血纖蛋白蛋白原在凝血酶的作用下轉(zhuǎn)變?yōu)檠宓鞍啄龎K(血塊的主要成分)。血液凝固是涉及氨基酸序列斷裂的一系列酶原被激活的結(jié)果,酶促激活的級(jí)聯(lián)放大,使血凝塊迅速形成成為可能。同源蛋白質(zhì)具有共同的進(jìn)化起源。同源蛋白質(zhì)具有明顯的序列相似性(稱序列同源),兩個(gè)物種的同源蛋白質(zhì),其序列間的氨基酸差異數(shù)目與這些物種間的系統(tǒng)發(fā)生差異是成比例的。序列分析中的重要方法和技術(shù)有:測(cè)定N末端基的苯異硫氰酸酯(PITC)法,分析C末端基的羧肽酶法,用于多肽鏈局部斷裂的酶裂解和CNBr化學(xué)裂解,斷裂二硫橋的巰基乙醇處理,測(cè)定肽段氨基酸序列的Edman化學(xué)降解和電噴射串聯(lián)質(zhì)譜技術(shù),重建多肽鏈一級(jí)序列的重疊肽拼湊法以及用于二硫橋定位的對(duì)角線電泳等。小肽晶體的熔點(diǎn)都很高,這說(shuō)明短肽的晶體是離子晶格、在水溶液中也是以偶極離子存在的。多肽鏈或蛋白質(zhì)當(dāng)發(fā)生部分水解時(shí),可形成長(zhǎng)短不一的肽段。蛋白質(zhì)的生物功能決定于它的高級(jí)結(jié)構(gòu),高級(jí)結(jié)構(gòu)是由一級(jí)結(jié)構(gòu)即氨基酸序列決定的,二氨基酸序列是由遺傳物質(zhì)DNA的核苷酸序列規(guī)定的。一級(jí)結(jié)構(gòu)就是共價(jià)主鏈的氨基酸序列,有時(shí)也稱化學(xué)結(jié)構(gòu)。此外還可按蛋白質(zhì)的生物學(xué)功能分類。蛋白質(zhì)分為兩大類:?jiǎn)渭兊鞍踪|(zhì)和綴合蛋白質(zhì)。多肽鏈?zhǔn)怯砂被嵬ㄟ^(guò)肽鍵共價(jià)連接而成的,各種多肽鏈都有自己特定的氨基酸序列。因此氨基酸的洗出順序大體上是酸性氨基酸、中性氨基酸,最后是堿性氨基酸,由于氨基酸和樹(shù)脂之間還存在疏水相互作用,所以其洗脫順序?yàn)椋篈sp, Thr, Gly, Leu, Lys。 (6)Tyr, Ala, Ser, His.[Ile lys;Phe, Ser;Leu Val Ala,;Val Pro;GluAsp;Tyr AlaSer≌His]解:根據(jù)P151 圖325可得結(jié)果。 (2)Phe, Ser (3)Ala, Val, Leu。利用在溶劑A和B之間的逆流分溶方法將甘氨酸和苯丙氨酸分開(kāi)。[[a]=+]1標(biāo)出異亮氨酸的4個(gè)光學(xué)異構(gòu)體的(R,S)構(gòu)型名稱。1L亮氨酸溶液()在20cm旋光管中測(cè)得的旋光度為+。問(wèn)起始溶液中丙氨酸的含量為多少克?[](mol/L)。[pI:。[]解:pH = pKa + lg2/3 pKa = pH = + = :(a)亮氨酸鹽酸鹽;(b)亮氨酸鈉鹽;(c)等電亮氨酸。[見(jiàn)表31]表31 氨基酸的簡(jiǎn)寫(xiě)符號(hào)名稱三字母符號(hào)單字母符號(hào)名稱三字母符號(hào)單字母符號(hào)丙氨酸(alanine)AlaA亮氨酸(leucine)LeuL精氨酸(arginine)ArgR賴氨酸(lysine)LysK天冬酰氨(asparagines)AsnN甲硫氨酸(蛋氨酸)(methionine)Met M天冬氨酸(aspartic acid)AspD苯丙氨酸(phenylalanine)PheF半胱氨酸(cysteine)CysC脯氨酸(praline)ProP谷氨酰氨(glutamine)GlnQ絲氨酸(serine)SerS谷氨酸(glutamic acid)GluE蘇氨酸(threonine)ThrT甘氨酸(glycine)GlyG色氨酸(tryptophan)TrpW組氨酸(histidine)HisH酪氨酸(tyrosine)TyrY異亮氨酸(isoleucine)IleI纈氨酸(valine)ValVAsn和/或AspAsxBGln和/或GluGlsZ計(jì)算賴氨酸的εαNH3+20%被解離時(shí)的溶液PH。常用方法有離子交換柱層析、高效液相層析(HPLC)等。核磁共振(NMR)波譜技術(shù)在氨基酸和蛋白質(zhì)的化學(xué)表征方面起重要作用。比旋是α氨基酸的物理常數(shù)之一,它是鑒別各種氨基酸的一種根據(jù)。這幾個(gè)反應(yīng)在氨基酸荷蛋白質(zhì)化學(xué)中占有重要地位。胱氨酸中的二硫鍵可用氧化劑(如過(guò)甲酸)或還原劑(如巰基乙醇)斷裂。所有的α氨基酸都能與茚三酮發(fā)生顏色反應(yīng)。在這中間的某一pH(因不同氨基酸而異),氨基酸以等電的兼性離子(H3N+CHRCOO)狀態(tài)存在。氨基酸是兩性電解質(zhì)。此外還有若干種氨基酸在某些蛋白質(zhì)中存在,但它們都是在蛋白質(zhì)生物合成后由相應(yīng)是基本氨基酸(殘基)經(jīng)化學(xué)修飾而成。但堿水解得到的氨基酸是D型和L型的消旋混合物。第三章 氨基酸提要α氨基酸是蛋白質(zhì)的構(gòu)件分子,當(dāng)用酸、堿或蛋白酶水解蛋白質(zhì)時(shí)可獲得它們。問(wèn)該脂蛋白中載脂蛋白和脂質(zhì)的質(zhì)量分?jǐn)?shù)是多少?[%載脂蛋白,%脂質(zhì)]解:設(shè)載脂蛋白的體積分?jǐn)?shù)是x,+(1-x)=,解得x=于是質(zhì)量分?jǐn)?shù)為()/[ +(1-)]=14.一種低密度脂蛋白(LDL含apoB 100(M為500000)和總膽固醇(假設(shè)平均Mr為590)的質(zhì)量分?jǐn)?shù)分別為25%和50%。請(qǐng)按圖215所求椅式構(gòu)象畫(huà)出膽酸的構(gòu)象式,并以直立鍵或平伏鍵標(biāo)出 C3, C7和C12上3個(gè)羥基。 (b)動(dòng)物中從膽固醇衍生來(lái)的類固醇包括5類激素:雄激素、雌激素、孕酮、糖皮質(zhì)激素和鹽皮質(zhì)激素,維生素D和膽汁酸。②取代基的種類、數(shù)目、位置和取向(αβ)不同。(e)膽固醇。(c) 半乳糖基腦苷脂。(c)糖,長(zhǎng)鏈醇]10.指出下列膜脂的親水成分和疏水成分:(a) 磷脂酰乙醇胺。試問(wèn)(a)哪兩個(gè)成分在蠟和鞘脂脂中都存在?(b)哪兩個(gè)成分在脂肪和磷脂酰膽堿中都存在?(c)哪些(個(gè))成分只在神經(jīng)節(jié)苷脂而不在脂肪中存在?[(a)脂肪酸,長(zhǎng)鏈醇。答:(a)磷脂酰膽堿、磷脂酰乙醇胺;(b)磷脂酰絲氨酸、磷脂酰肌醇、磷脂酰甘油,1;雙磷脂酰甘油(心磷脂),2;(c) 磷脂酰膽堿、磷脂酰乙醇胺。(b)在中性pH時(shí)攜帶負(fù)凈電荷的甘油磷脂。試以磷酸甘油為例說(shuō)明此命名原則。(b)多不飽和脂肪酸(PUFA)中的雙鍵具有潛在的還原性,容易發(fā)生過(guò)氧化作用。自由基鏈反應(yīng):自由基化學(xué)性質(zhì)活潑,能發(fā)生抽氫、歧化、化合、取代、加成等多種反應(yīng),但是自由基反應(yīng)的最大特點(diǎn)是傾向于進(jìn)行鏈「式」反應(yīng)〔chain reaction ) ,鏈反應(yīng)一般包括3個(gè)階段:引發(fā)、增長(zhǎng)和終止?;钚匝酰貉趸蚝醯母叻磻?yīng)活性分子,如O[2個(gè)]解:100g油脂的物質(zhì)的量=(210100)/(3561000)=平均雙鍵數(shù)=(68/254)/≈2個(gè)6. (a)解釋與脂質(zhì)過(guò)氧化育關(guān)的幾個(gè)術(shù)語(yǔ):自由基、活性氧、自由基鏈反應(yīng)和抗氧化劑。102]解:Mr=(3561000)/(265)=1292I2 值=100/=102 (100g油脂鹵化時(shí)吸收I2的克數(shù))5.某油脂的碘值為68,皂化值為210。測(cè)定皂化值的一份樣品消耗KOH 65 mg,測(cè)定碘值的一份樣品消耗I2 510 。因?yàn)槿埸c(diǎn)隨鏈長(zhǎng)的增加而增加。(b) 10種]解:(a) 33=27種。不飽和脂肪酸的雙鍵位置,有一個(gè)雙鍵幾乎總是處于C9C10之間(△9),并且一般是順式的。習(xí)題1.天然脂肪酸在結(jié)構(gòu)上有哪些共同的特點(diǎn)?答:天然脂肪酸通常具有偶數(shù)碳原子,鏈長(zhǎng)一般為1222碳。 測(cè)定脂質(zhì)組成時(shí),脂質(zhì)可用有機(jī)溶劑從組織中提取,用薄層層析或氣液色譜進(jìn)行分離。血漿脂蛋白都是球形顆粒,有一個(gè)由三酰甘油和膽固醇脂組成的疏水核心和一個(gè)由磷脂、膽固醇和載脂蛋白參與的極性外殼。血漿脂蛋白是血漿中轉(zhuǎn)運(yùn)脂質(zhì)的脂蛋白顆粒。 脂蛋白是由脂質(zhì)和蛋白質(zhì)以非共價(jià)鍵結(jié)合而成的復(fù)合體。膽固醇與動(dòng)脈粥樣硬化有關(guān)。膽固醇是最常見(jiàn)的一種動(dòng)物固醇,參與動(dòng)物細(xì)胞膜的組成。固醇或甾醇是類固醇中的一大類,其結(jié)構(gòu)特點(diǎn)是在甾核的C3上有一個(gè)β羥基,C17上有一個(gè)含8~10個(gè)碳的烴鏈。許多植物精油、光合色素和甾類的前體鯊烯都是萜。 萜類可看成是異戊二烯(CS)的聚合物,有倍半萜、雙萜、三萜、四萜等。重要的鞘糖脂有腦苷脂和神經(jīng)節(jié)苷脂,后者含有唾液酸。磷脂是兩親分子,有一個(gè)極性頭基和一個(gè)非極性尾,在水介質(zhì)中能形成脂雙層;它們主要參與膜的組成。其2位氨基以酰胺鍵與脂肪酸連接形成神經(jīng)酰胺,這是這類磷脂的母體。鞘磷脂是由鞘氨醇代替甘油磷脂中的甘油形成的磷脂。甘油磷脂是由sn甘油3磷酸衍生而來(lái),最簡(jiǎn)單的甘油磷脂是3sn磷脂酸,它是其他甘油磷脂的母體。體內(nèi)的抗氧化劑如超氧化物歧化酶(SOD)、維生素E等是與脂質(zhì)過(guò)氧化坑衡的保護(hù)系統(tǒng)。OH、H2OˉO2等)使生物膜發(fā)生脂質(zhì)過(guò)氧化,造成膜的損傷、蛋白質(zhì)和核酸等大分子的異常。它是典型的活性氧參與的自由基鏈?zhǔn)椒磻?yīng)。蠟還有其他的生物功能如防水、防侵襲等。天然蠟如蜂蠟是多種蠟酯的混合物。三酰甘油主要作為貯存燃料,以油滴形式存在于細(xì)胞中。三酰甘油也和游離脂肪酸一樣,它的不飽和鍵能發(fā)生氫化、鹵化和過(guò)氧化作用。天然油脂是簡(jiǎn)單和混合三酰甘油的混合物。 三酰甘油或甘油三脂 (TG)是由脂肪酸與甘油形成的三脂。必需脂肪酸是指對(duì)人體的功能不可缺少
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