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艾滋病抗病毒治療的耐藥檢測方法-文庫吧資料

2025-06-01 18:19本頁面
  

【正文】 (序列測定法) 檢 測 流 程 病人血漿標本 HIV RNA 病毒 cDNA HIV RT和 PR基因片段 序列測定 結(jié)果解釋 RNA提取 逆轉(zhuǎn)錄 PCR擴增 特定的解釋系統(tǒng) 標本 新鮮 EDTA抗凝血漿,或 80℃ 保存,避免反復凍融 病毒 RNA提取( Qiagen公司試劑盒 ) 裂解標本,滅活 RNA酶 加到離心柱中, RNA與硅膠膜結(jié)合 洗兩次,去除雜質(zhì) 用無 RNA酶的緩沖液洗脫 RNA 收集 RNA備用 優(yōu)點:操作簡便、快速、得率高 逆轉(zhuǎn)錄 RNA cDNA 反應體系: 10XBuffer 1?l dNTP ?l 外側(cè)反向引物 1?l RNase inhibitor ?l MMuLV RT ?l DEPC水 2?l RNA模板 5?l 42℃ 水浴 1小時, 95℃ 5 分鐘滅活 RT 巢式 PCR擴增病毒蛋白酶和逆轉(zhuǎn)錄酶基因 第一輪擴增反應體系 : 10XBuffer 5?l MgCl2 3?l dNTP 1?l 外側(cè)正向引物 1?l 外側(cè)反向引物 1?l Taq酶 ?l 水 ?l cDNA模板 10?l 94℃ 5min, 94℃ 30sec, 55℃ 30sec, 72℃ 30循環(huán) 巢式 PCR擴增病毒蛋白酶和逆轉(zhuǎn)錄酶基因 第二輪擴增反應體系 : 10XBuffer 5?l MgCl2 3?l dNTP 1?l 內(nèi)側(cè)正向引物 1?l 內(nèi)側(cè)反向引物 1?l Taq酶 ?l 水 ?l 第一輪擴增產(chǎn)物 10?l 94℃ 5min, 94℃ 30sec, 55℃ 30sec, 72℃ 30循環(huán) 擴增產(chǎn)物鑒定:瓊脂糖凝膠電泳 擴增產(chǎn)物純化 QIAquick Gel extraction試劑盒 核酸序列測定 雙脫氧鏈末端終止法 : Protease: CCTCAAATCACTCTTTGGCAACGACCCCTCGTCACAGTAAAGATAGGGGGGCAATTAAAGGAAGCTCTATTAGATACAGGAGCAGATGATACAGTATTAGAAGAAATGAATTTGCCAGGAAAATGGAAACCAAAAATGATAGGGGGAATTGGAGGTTTTATCAAAGTAAGACAGTATGATCAGGTATCCATAGAAATCTGTGGACATAAGGCTGTAGGTACAGTATTAATAGGACCTACACCAGTCAACATAATTGGGAGAAATCTGTTGACTCAGATTGGTTGCACTTT RT: AAATTTTCCCATTAGTCCTATTGAAACTGTACCAGTAAAATTAAAGCCAGGAATGGATGGCCCAAAAGTTAAACAATGGCCATTGACAGAAGAAAAAATAAAAGCATTAGTAGAAATTTGTACAGAAATGGGAAAGGAAGGAAAAATTTCAAAAATTGGGCCTGAAAATCCATACAATACTCCAGTATTTGCCATAAAGAAAAAAGACAGTACTAAATGGAGAAAATTAGTAGATTTCAGAGAACTCAATAAAAGAACTCAAGACTTTTGGGAAGTTCAATTAGGAATACCACATCCCGCAGGATTAAAACAGAAAAAATCTGTAACAGTCCTGGATGTGGGTGATGCATATTTCTCAGTCCCTTTAGATAAAGACTTCAGGAAGTACACTGCATTTACCATACCTAGTGTAAACAATGAGACACCAGGGATTAGATATCAGTACAA
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