blast簡介及其應(yīng)用-文庫吧資料
2025-05-13 18:03本頁面
【正文】 TLLPAADMDDFSRQLQNSMSGASADSTQA 37 NCBI的 BLAST主頁 界面如圖所示： 分析過程 38 登陸 BLAST主頁 39 ，選擇合適的比對分析界面程序。這些數(shù)據(jù)庫中經(jīng)常包含有相同的序列，但 nr數(shù)據(jù)庫只收錄其中的一個序列 (即使在 nr數(shù)據(jù)庫中出現(xiàn)看上去一樣的序列，實際上還是具有一些細(xì)節(jié)上的區(qū)別 )。該程序不能使用BLAST網(wǎng)頁上提供的主要的去冗余 (nr)數(shù)據(jù)庫，因這一操作很消耗計算機(jī)資源。然后此程序就會將翻譯的 6個蛋白質(zhì)序列逐一與蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫中的各個成員進(jìn)行比較。如若有一個 DNA序列，想知道它編碼什么蛋白質(zhì)，用此程序進(jìn)行搜索。這類搜索有專門與蛋白質(zhì)搜索相關(guān)的可選參數(shù)，如對各種PAM和 BLOSUM打分矩陣的選擇。 ? Blast（比對） 網(wǎng)頁版 具體步驟 blast主頁 ，選擇合適的程序 blast主頁BLAST/ 組裝的基因組序列庫 基本 blast 特定的 BLAST 所有的 BLAST基 因數(shù)據(jù)庫 18 19 20 核酸數(shù)據(jù)庫中 比對核酸序列 蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫中 比對蛋白質(zhì)序列 BLASTN BLASTP 蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫中 比對核酸序列 蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫中 比對核酸序列 核酸數(shù)據(jù)庫中 比對蛋白質(zhì)序列 21 標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫 組裝的基因序列庫 快速搜索 基本操作 特定的 BLAST 所有的 BLAST基 因數(shù)據(jù)庫 23 特定的 BLAST 24 ，選擇合適的程序 ，選擇合適的程序 ?blastn (nucleotide BLAST)： 將一個核酸的查詢序列與一個核酸序列數(shù)據(jù)庫相比較。 ? 進(jìn)入 Blast界面選擇一種自己所需的功能進(jìn)行搜索比對。 Blast的使用 ? 首先在 NCBI的基因數(shù)據(jù)庫中找到一段基因核苷酸序列（或者是通過測序得到的核苷酸序列）。 ?確定 一個 DNA或蛋白質(zhì)序列身份。 ?確定 特定的蛋白質(zhì)或核酸序列有哪些已知的直系同源或旁系同源序列。 BLAST的使用 ? BLAST 具有非常廣泛的應(yīng)用： ? 研究可能存在多種剪切方式的表達(dá)序列標(biāo)簽。
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