【正文】 登錄號(hào) 54 55 56 所選序列 下載序列 。 ? Blast（比對） 網(wǎng)頁版 具體步驟 blast主頁 ，選擇合適的程序 blast主頁BLAST/ 組裝的基因組序列庫 基本 blast 特定的 BLAST 所有的 BLAST基 因數(shù)據(jù)庫 18 19 20 核酸數(shù)據(jù)庫中 比對核酸序列 蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫中 比對蛋白質(zhì)序列 BLASTN BLASTP 蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫中 比對核酸序列 蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫中 比對核酸序列 核酸數(shù)據(jù)庫中 比對蛋白質(zhì)序列 21 標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫 組裝的基因序列庫 快速搜索 基本操作 特定的 BLAST 所有的 BLAST基 因數(shù)據(jù)庫 23 特定的 BLAST 24 ，選擇合適的程序 ，選擇合適的程序 ?blastn (nucleotide BLAST)： 將一個(gè)核酸的查詢序列與一個(gè)核酸序列數(shù)據(jù)庫相比較。但是缺點(diǎn)是不利于操作大批量的數(shù)據(jù)，同時(shí)也不能自己定義搜索的數(shù)據(jù)庫。這是個(gè)量化的關(guān)系。 我們在獲得一個(gè) Blast結(jié)果時(shí)需要看這兩個(gè)指標(biāo)。 ?發(fā)現(xiàn)新基因 ?確定 一個(gè)特定基因或蛋白質(zhì)有哪些已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了的變種。 nr數(shù)據(jù)庫是在要搜索現(xiàn)有的絕大多數(shù)序列時(shí)典型和常用的數(shù)據(jù)庫。 ，選擇合適的程序 ?tblastx (translated BLAST)： 將一個(gè)核酸查詢序列的 6種框架的翻譯結(jié)果與一個(gè)核酸序列數(shù)據(jù)庫的 6種框架翻譯產(chǎn)物進(jìn)行比較。 ? 尋找對于一個(gè)蛋白質(zhì)的功能和 /或結(jié)構(gòu)起關(guān)鍵作用的氨基酸殘基。所以有出現(xiàn) A序列和 B序列的同源性為 80％一說。而說 A和 B的同源性為 80％都是不科學(xué)的。 兩種版本的 BLAST比較（二） Why use BLAST? ? BLAST 是 NCBI中用來將一個(gè)蛋白質(zhì)或DNA序列和各種數(shù)據(jù)庫中的其他序列進(jìn)行比對的主要工具。如若有一個(gè) DNA序列，想知道它編碼什么蛋白質(zhì)，用此程序進(jìn)行搜索。如下圖： 分析過程 40 41 在網(wǎng)頁的 Enter accession FASTA sequence對話框中輸入待查詢序列，下面 Choose search set→ dat