【正文】 登錄號 54 55 56 所選序列 下載序列 。 ? Blast（比對） 網頁版 具體步驟 blast主頁 ，選擇合適的程序 blast主頁BLAST/ 組裝的基因組序列庫 基本 blast 特定的 BLAST 所有的 BLAST基 因數據庫 18 19 20 核酸數據庫中 比對核酸序列 蛋白質數據庫中 比對蛋白質序列 BLASTN BLASTP 蛋白質數據庫中 比對核酸序列 蛋白質數據庫中 比對核酸序列 核酸數據庫中 比對蛋白質序列 21 標準蛋白質數據庫 組裝的基因序列庫 快速搜索 基本操作 特定的 BLAST 所有的 BLAST基 因數據庫 23 特定的 BLAST 24 ，選擇合適的程序 ，選擇合適的程序 ?blastn (nucleotide BLAST)： 將一個核酸的查詢序列與一個核酸序列數據庫相比較。但是缺點是不利于操作大批量的數據，同時也不能自己定義搜索的數據庫。這是個量化的關系。 我們在獲得一個 Blast結果時需要看這兩個指標。 ?發(fā)現新基因 ?確定 一個特定基因或蛋白質有哪些已經發(fā)現了的變種。 nr數據庫是在要搜索現有的絕大多數序列時典型和常用的數據庫。 ，選擇合適的程序 ?tblastx (translated BLAST)： 將一個核酸查詢序列的 6種框架的翻譯結果與一個核酸序列數據庫的 6種框架翻譯產物進行比較。 ? 尋找對于一個蛋白質的功能和 /或結構起關鍵作用的氨基酸殘基。所以有出現 A序列和 B序列的同源性為 80％一說。而說 A和 B的同源性為 80％都是不科學的。 兩種版本的 BLAST比較（二） Why use BLAST? ? BLAST 是 NCBI中用來將一個蛋白質或DNA序列和各種數據庫中的其他序列進行比對的主要工具。如若有一個 DNA序列，想知道它編碼什么蛋白質，用此程序進行搜索。如下圖： 分析過程 40 41 在網頁的 Enter accession FASTA sequence對話框中輸入待查詢序列，下面 Choose search set→ dat