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正文內(nèi)容

清華大學分子動力學-文庫吧資料

2024-12-14 10:46本頁面
  

【正文】 ? Fortran90+ MPI ? C+++ MPI ? 可單機運行,也可并行計算 ? 可以模擬氣體、液體、固體 Samples MD Program ? ? 生成粒子 ? 生成數(shù)據(jù)文件 ? ? MD模擬 。 平衡態(tài)時,系統(tǒng)溫度不變,因此 dEk/dt=0 i i if ma mv???0iiiva ??2iiiiifvmv? ???宏觀性質(zhì)的統(tǒng)計 ? 系統(tǒng)的勢能 ? 系統(tǒng)的內(nèi)能 ? 系統(tǒng)的總能 E = Ep+Ek ? 系統(tǒng)的溫度 1()p i ji j NE V r? ? ?? ?22k i ipEm? ?21iiiBT m vd N k? ?模擬 ? 熱容 定義熱容 計算系統(tǒng)在溫度 T和 T+?T時的總能 ET、 ET +?T, Vv TEC ?????????E:系統(tǒng)總能 TEEC TTTv ??? ??模擬 ? 壓強 ?對壁面的壓強 ?t時間里作用在單位面積壁上的壓力 tiv??時刻,速度為 tt ?? iv??時刻,速度為 ? ? ?????iiii tvvmdAp??1剛性壁 模擬 ? 粒子速度分布 選速度間隔 ?v,模擬 nt個時間步,記錄在每個速度間隔中的粒子數(shù),最后歸一化。一般 T?Teq。 方向 (按球坐標給法 ): 分量 : xyz??)) a n d o m(2a r c c o s ( ???)] a n d o m(2[a r c c o s)0 . 5r a n d o m(s i g n ????????????? 180180。 ? 通過統(tǒng)計方法得到系統(tǒng)的平衡參數(shù)或輸運性質(zhì) ? 計算程序較為復雜,占用較多內(nèi)存 MD的主要步驟 ? 選取要研究的系統(tǒng)及其邊界,選取系統(tǒng)內(nèi)粒子間的作用勢能模型 ? 設(shè)定系統(tǒng)中粒子的初始位置和初始動量 ? 建立模擬算法,計算粒子間作用力及各粒子的速度和位置 ? 當體系達到平衡后,依據(jù)相關(guān)的統(tǒng)計公式,獲得各宏觀參數(shù)和輸運性質(zhì) 分子間勢能及相互作用 ? N個粒子系統(tǒng)的總勢能 ??????????????NjiijNNNNrVrVrVrVrVrVrVV11,22311312)()()()()()()(???dVrVr剛球模型 () 0 rdVr rd???? ? ?? ( ) ( )dVr r ??斥力力心點模型 d r V ?()()rdVr drdr??????? ?????Southerland模型 分子間勢能及相互作用 ? Lennard
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