利用生物信息學(xué)方法開發(fā)鵪鶉微衛(wèi)星標(biāo)記(參考版)
2024-08-15 14:37本頁面
【正文】 anchored primers for the enhanced recovery of specific microsatellite markers in Brassica napus L. Theor Appl Genet, 2000, 101:115－119[5] 李明芳，, HEREDITAS,2004,26(5):769－776[6] Hayden M J, Stephenson P, Logojan A M, et al. A new approach to extending the wheat marker pool by anchored PCR amplification of pound SSRs. Theor Appl Genet, 2004, 108:733－742作者簡介：白俊艷（1975），女，博士，副教授，2005年畢業(yè)于中國農(nóng)業(yè)大學(xué)，現(xiàn)工作于河南科技大學(xué)動物科技學(xué)院，主要研究方向?yàn)閯游镞z傳育種，通訊地址：河南省洛陽市澗西區(qū)天津路70河南科技大學(xué)動物科技學(xué)院，郵編：471003，Email:junyanbaiｓｕｎｓｈｉｎｅ。隨著更多的動物基因組序列、mRNA序列不斷增加，生物信息學(xué)方法將會成為一種簡便、快速、實(shí)用的微衛(wèi)星開發(fā)方法。文庫篩選法是目前最常用的方法，雖然采用文庫富集法可以使SSR開發(fā)效率（功能引物數(shù)/測序克隆數(shù)）達(dá)到40%～60%，但是無論單引物延伸富集法[3，4]，還是選擇雜交富集法[5，6]，都存在過程煩瑣復(fù)雜、技術(shù)要求高等缺點(diǎn)。同時發(fā)現(xiàn)，利用生物信息學(xué)方法開發(fā)SSR有以下幾個特點(diǎn)：首先，生物信息學(xué)方法開發(fā)SSR簡便、快捷、可以節(jié)省人力財(cái)力；其次，生物信息學(xué)方法可以開發(fā)出更高核苷酸重復(fù)基元的SSR，如三、四、五、六核苷酸重復(fù)基元的SSR，而其他方法開發(fā)的SSR多為二核苷酸重復(fù)基元的SSR；最后，生物信息學(xué)方法開發(fā)的SSR的重復(fù)次數(shù)不是很高，多數(shù)在5～8次重復(fù)范圍，這也可能與這些SSR是位于基因內(nèi)部有關(guān)，其保守性可能比較好。3 討論本研究對已公布的鵪鶉核酸序列和EST序列中其1
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