利用生物信息學方法開發(fā)鵪鶉微衛(wèi)星標記-閱讀頁
2024-08-23 14:37本頁面
【正文】 重復次數最多的是重復5次，有53條SSR，%；其次是重復次數為6次的，有36條SSR，占30%；其次是7次和8次的，而重復次數為9次和22次的為最少，只有1條SSR。并且SSR的重復次數都在5以上，由此可以推測利用鵪鶉核苷酸序列和EST序列中的SSR序列將有可能開發(fā)一批有價值的SSR分子標記供各種研究所用。盡管SSR具有廣泛的用途，但是其開發(fā)過程卻是相當費時費力，目前SSR標記的開發(fā)有4種方法：文庫篩選法，基于錨定PCR技術的方法，生物信息學方法，轉移擴增法。Hayden 和Sharp [11]在錨定PCR的基礎上發(fā)明了SAM法。參考文獻：[1] Kayang B B, Vignal A, InoueMurayama M A et al. Firstgeneration microsatellite linkage map of the Japanese quail. Anim Genet. 2004, 35(3): 195200.[2] Kayang B B, Vignal A, InoueMurayama M A et al. Integrated maps in quail (Coturnix japonica) confirm the high degree of synteny conservation with chicken (Gallus gallus) despite 35 million years of divergence. BMC Genomics, 2006, 7:118.[3] Fisher P J, Richardson T E, Gardner R C, et al. Characteristics of single and multicopy microsatellites from Pinus radiata. Theor Appl Genet, 1998, 96: 969－979[4] Varghese J P, Rudolph B, Uzunova M I, et al. Use of 518
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