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2025-01-13 11:18 本頁面
【正文】 如 Dot Plot (點陣序列比較 ) ? 同源性指從一些數據中推斷出的兩個基因或蛋白質序列具而共同祖先的結論，屬于質的判斷。 ? 引物二聚體及發(fā)夾結構的能量一般不要超過 ，否則容易產生引物二聚體帶而且會降低引物濃度從而導致 PCR正常反應不能進行 。 ? 引物所對應模板序列的 Tm值最好在 72℃ 左右，當然由于模板序列本身的組成決定其 Tm值可能偏低或偏高，可根據具體情況靈活運用。 引物設計 需要考慮的因素 引物設計要點 ? 一般引物的長度為 1623bp， 常用的長度為 1821bp， 過長或過短都不合適 。 DNASIS 蛋白二級結構預測 目前應用的蛋白質結構預測的算法 1. 同源預測 (一級結構決定高級結構 ) 2. 結構與結構相對比（ DALI算法） 3. 當前最先進的結構預測方法： 結構類識別（ fold recognition） 先建立一個已知的結構類數據庫 （ fold library)， 將待測序列 “ 穿過 ” 該數據庫構成的坐標 ， 并根據事先確定的物理限制 ， 逐個位置移動 （ t h r e a d i n g， s e q u e n c e s t r u c t u r e alignment) ， 由一個函數 （ sequencestructure fitness alignment) 判斷序列與結構類的符合程度 ， 找出未知序列在目標結構上的能量最優(yōu)和構象最穩(wěn)固的比對位置 。 ? X射線晶體學技術和多維核磁共振技術是當前人們認識蛋白高級結構的主要手段，但兩種技術都有不足之處。 Winplas 質粒構建 Atheprot 預測蛋白跨膜區(qū)域 Antheprot 預測信號肽斷裂點 功能 3. 用計算機管理實驗室數據及文獻資料 ? 實驗室結果的儲存、管理和申報工作 ? 從網絡數據庫獲得的序列文件（由 ENTREZ集成檢索系統(tǒng)所得的數據文件可以進入EndNote 或者 Reference Manager 儲存管理）或資料文獻的管理 ?軟件 : EndNote， Reference Manager Reference Manager 9 界面 功能
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