高通量測(cè)序服務(wù)簡(jiǎn)介(2)(精品ppt)-資料下載頁(yè)
2024-11-19 22:21本頁(yè)面
【正文】 n 2024年被羅氏收購(gòu)， 2024年推出 Genome Sequencer FLX System，性能進(jìn)一步提高第二十七 頁(yè) ，共三十二 頁(yè) 。454 測(cè)序簡(jiǎn)要 (jiǎny224。o)原理n 大規(guī)模的并行測(cè)序 , “邊合成邊測(cè)序〞 :n 每次反響都依次參加 ATGC四種核酸，從而產(chǎn)生焦磷酸n 焦磷酸在硫酸 (li suān)化酶作用下生成 ATP,熒光素酶那么利用其作為能量單位作用底物激發(fā)熒光n 三磷酸腺苷雙磷酸酶將每步剩余的 dNTP降解n 熒光信號(hào)被檢測(cè)并轉(zhuǎn)換為序列信息 第二十八 頁(yè) ，共三十二 頁(yè) 。454 測(cè)序流程 (lich233。ng)n 文庫(kù)制備：根據(jù)樣品的種類(lèi)和實(shí)驗(yàn)?zāi)康?，將基因組 DNA/cDNA片段化處理至 400800bp間，進(jìn)行生物素修飾及加接頭n Emulsion PCR：特定比例的單鏈DNA文庫(kù)被固定在特別設(shè)計(jì)的 DNA捕獲磁珠上，使大局部磁珠磁珠攜帶了一個(gè) (yī ɡ232。)獨(dú)特的單鏈 DNA片斷磁珠結(jié)合的文庫(kù)被擴(kuò)增試劑乳化，形成油包水的混合物，每個(gè)獨(dú)特的片斷在自己的微反響器里進(jìn)行獨(dú)立的擴(kuò)增，而不受其他的競(jìng)爭(zhēng)性或者污染性序列的影響。整個(gè)片段文庫(kù)的擴(kuò)增平行進(jìn)行。第二十九 頁(yè) ，共三十二 頁(yè) 。454 測(cè)序流程 (lich233。ng)n 測(cè)序反響：乳液混合物被打破，擴(kuò)增后產(chǎn)生的幾百萬(wàn)個(gè)相同的拷貝，被回收純化。攜帶DNA的珠子與其他反響物混合物，隨后放入 PTP板中進(jìn)行后繼的測(cè)序。 PTP孔的直徑〔29um〕只能容納一個(gè)珠子〔20um〕。然后將 PTP板放置在GS FLX中，焦磷酸測(cè)序開(kāi)始。每一個(gè)與模板 (mbǎn)鏈互補(bǔ)的核苷酸的添加都會(huì)產(chǎn)生化學(xué)發(fā)光的信號(hào)，并被 CCD照相機(jī)所捕獲n 數(shù)據(jù)分析： GS FLX系統(tǒng)在 10小時(shí)的運(yùn)行當(dāng)中可獲得 100多萬(wàn)個(gè)讀長(zhǎng)，讀取超過(guò) 46億個(gè)堿基信息，通過(guò) GS FLX系統(tǒng)提供兩種不同的生物信息學(xué)工具對(duì)測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行分析第三十 頁(yè) ，共三十二 頁(yè) 。Roche / 454 : GS FLX適用于新物種基因組測(cè)序?qū)τ谥販y(cè)序而言本錢(qián)過(guò)高尤其 (y243。uq237。)適合用于基因組未知的微生物測(cè)序最大到 1000,000個(gè)讀長(zhǎng)每輪每個(gè)讀長(zhǎng) 400bp 總測(cè)序量 400 Mbp 每輪，可根據(jù)客戶(hù)測(cè)序需求進(jìn)行靈活調(diào)整簡(jiǎn)便高效，不需要進(jìn)行建庫(kù)、克隆挑取、質(zhì)粒提取等工作，一個(gè)人可以在一天內(nèi)完成一個(gè)微生物物種的測(cè)序工作 第三十一 頁(yè) ，共三十二 頁(yè) 。內(nèi)容 (n232。ir243。ng)總結(jié)高通量 測(cè) 序效 勞 與數(shù)據(jù)分析效 勞簡(jiǎn) 介。基因功能注 釋 〔包括同源注 釋 和蛋白 結(jié)構(gòu)域 識(shí)別 〕。基因功能分 類(lèi) (fēn l232。i)，參照 Gene Ontology或 COG標(biāo) 準(zhǔn)〔由用 戶(hù) 指定標(biāo) 準(zhǔn)〕。基 團(tuán) 與 熒 光基 團(tuán) 。革命性的理念 邊 合成 邊測(cè) 序。焦磷酸在硫酸化 酶 作用下生成 ATP,熒 光素 酶 那么利用其作 為 能量 單 位作用底物激 發(fā)熒 光。每個(gè) 讀長(zhǎng) 400bp第三十二 頁(yè) ，共三十二 頁(yè)
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