高通量測序服務(wù)簡介(2)(精品ppt)-資料下載頁
2024-11-19 22:21本頁面
【正文】 n 2024年被羅氏收購， 2024年推出 Genome Sequencer FLX System，性能進一步提高第二十七 頁 ，共三十二 頁 。454 測序簡要 (jiǎny224。o)原理n 大規(guī)模的并行測序 , “邊合成邊測序〞 :n 每次反響都依次參加 ATGC四種核酸，從而產(chǎn)生焦磷酸n 焦磷酸在硫酸 (li suān)化酶作用下生成 ATP,熒光素酶那么利用其作為能量單位作用底物激發(fā)熒光n 三磷酸腺苷雙磷酸酶將每步剩余的 dNTP降解n 熒光信號被檢測并轉(zhuǎn)換為序列信息 第二十八 頁 ，共三十二 頁 。454 測序流程 (lich233。ng)n 文庫制備：根據(jù)樣品的種類和實驗?zāi)康模瑢⒒蚪M DNA/cDNA片段化處理至 400800bp間，進行生物素修飾及加接頭n Emulsion PCR：特定比例的單鏈DNA文庫被固定在特別設(shè)計的 DNA捕獲磁珠上，使大局部磁珠磁珠攜帶了一個 (yī ɡ232。)獨特的單鏈 DNA片斷磁珠結(jié)合的文庫被擴增試劑乳化，形成油包水的混合物，每個獨特的片斷在自己的微反響器里進行獨立的擴增，而不受其他的競爭性或者污染性序列的影響。整個片段文庫的擴增平行進行。第二十九 頁 ，共三十二 頁 。454 測序流程 (lich233。ng)n 測序反響：乳液混合物被打破，擴增后產(chǎn)生的幾百萬個相同的拷貝，被回收純化。攜帶DNA的珠子與其他反響物混合物，隨后放入 PTP板中進行后繼的測序。 PTP孔的直徑〔29um〕只能容納一個珠子〔20um〕。然后將 PTP板放置在GS FLX中，焦磷酸測序開始。每一個與模板 (mbǎn)鏈互補的核苷酸的添加都會產(chǎn)生化學(xué)發(fā)光的信號，并被 CCD照相機所捕獲n 數(shù)據(jù)分析： GS FLX系統(tǒng)在 10小時的運行當中可獲得 100多萬個讀長，讀取超過 46億個堿基信息，通過 GS FLX系統(tǒng)提供兩種不同的生物信息學(xué)工具對測序數(shù)據(jù)進行分析第三十 頁 ，共三十二 頁 。Roche / 454 : GS FLX適用于新物種基因組測序?qū)τ谥販y序而言本錢過高尤其 (y243。uq237。)適合用于基因組未知的微生物測序最大到 1000,000個讀長每輪每個讀長 400bp 總測序量 400 Mbp 每輪，可根據(jù)客戶測序需求進行靈活調(diào)整簡便高效，不需要進行建庫、克隆挑取、質(zhì)粒提取等工作，一個人可以在一天內(nèi)完成一個微生物物種的測序工作 第三十一 頁 ，共三十二 頁 。內(nèi)容 (n232。ir243。ng)總結(jié)高通量 測 序效 勞 與數(shù)據(jù)分析效 勞簡 介。基因功能注 釋 〔包括同源注 釋 和蛋白 結(jié)構(gòu)域 識別 〕。基因功能分 類 (fēn l232。i)，參照 Gene Ontology或 COG標 準〔由用 戶 指定標 準〕。基 團 與 熒 光基 團 。革命性的理念 邊 合成 邊測 序。焦磷酸在硫酸化 酶 作用下生成 ATP,熒 光素 酶 那么利用其作 為 能量 單 位作用底物激 發(fā)熒 光。每個 讀長 400bp第三十二 頁 ，共三十二 頁
公司管理相關(guān)推薦
鄂ICP備17016276號-1