第九章數(shù)據(jù)挖掘與基因表達調控信息分析2-資料下載頁
2025-08-01 12:59本頁面
【正文】 合模型 線性組合模型是一種連續(xù)網絡模型，在這種模型中，一個基因的表達值是若干個其它基因表達值的加權和?；颈硎拘问綖椋? ????jjiji tXwttX )()(加權矩陣模型 加權矩陣模型與線性組合模型相似，在該模型中，一個基因的表達值是其它基因表達值的函數(shù)。 ??jjiji tuWtr )()(互信息關聯(lián)網絡 可以用距離或相關系數(shù)作為基因表達模式之間的相似性度量，還可以用另外一種度量形式，即用熵和互信息描述基因與基因的關聯(lián)。 一個基因表達模式的熵是該模式所含信息量的度量。設 X是一個基因表達模式，用下式計算熵： ????niii xPxPXH12 ))((l o g)()(基因調控網絡實例 真核生物生理過程的調控網絡 GeneNet GeneNet展示了協(xié)調方式下基因的整體功能，良好的調控功能和對外界刺激的反應。該基因網具有以下基本功能： (a) 描述執(zhí)行特定生物功能時所涉及到的整體基因交互作用 (b) 描述基因的蛋白質編碼 (c) 描述基因對外界刺激的傳感途徑 (d) 通過一組反饋自動地穩(wěn)定網絡參數(shù)或者使網絡轉換到新的功能狀態(tài) (e) 利用外部信號、激素和代謝產物作為生理學參數(shù)激發(fā)基因網糾正其作用 該基因網描述了 四類實體 ： (a) 細胞 (組織，器官 ) (b) 蛋白質 (c) 基因 (d) 物質 該基因網還描述了實體間 兩種關系 ： (a) 反應（ reaction） , 即通過交互作用產生新的實體或過程 (b) 調控（ regulatory）事件 , 特定反應對實體的作用。 GeneNet網絡
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