第九章數(shù)據(jù)挖掘與基因表達(dá)調(diào)控信息分析2-資料下載頁
2025-08-01 12:59本頁面
【正文】 合模型 線性組合模型是一種連續(xù)網(wǎng)絡(luò)模型，在這種模型中，一個(gè)基因的表達(dá)值是若干個(gè)其它基因表達(dá)值的加權(quán)和?；颈硎拘问綖椋? ????jjiji tXwttX )()(加權(quán)矩陣模型 加權(quán)矩陣模型與線性組合模型相似，在該模型中，一個(gè)基因的表達(dá)值是其它基因表達(dá)值的函數(shù)。 ??jjiji tuWtr )()(互信息關(guān)聯(lián)網(wǎng)絡(luò) 可以用距離或相關(guān)系數(shù)作為基因表達(dá)模式之間的相似性度量，還可以用另外一種度量形式，即用熵和互信息描述基因與基因的關(guān)聯(lián)。 一個(gè)基因表達(dá)模式的熵是該模式所含信息量的度量。設(shè) X是一個(gè)基因表達(dá)模式，用下式計(jì)算熵： ????niii xPxPXH12 ))((l o g)()(基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)實(shí)例 真核生物生理過程的調(diào)控網(wǎng)絡(luò) GeneNet GeneNet展示了協(xié)調(diào)方式下基因的整體功能，良好的調(diào)控功能和對(duì)外界刺激的反應(yīng)。該基因網(wǎng)具有以下基本功能： (a) 描述執(zhí)行特定生物功能時(shí)所涉及到的整體基因交互作用 (b) 描述基因的蛋白質(zhì)編碼 (c) 描述基因?qū)ν饨绱碳さ膫鞲型緩? (d) 通過一組反饋?zhàn)詣?dòng)地穩(wěn)定網(wǎng)絡(luò)參數(shù)或者使網(wǎng)絡(luò)轉(zhuǎn)換到新的功能狀態(tài) (e) 利用外部信號(hào)、激素和代謝產(chǎn)物作為生理學(xué)參數(shù)激發(fā)基因網(wǎng)糾正其作用 該基因網(wǎng)描述了 四類實(shí)體 ： (a) 細(xì)胞 (組織，器官 ) (b) 蛋白質(zhì) (c) 基因 (d) 物質(zhì) 該基因網(wǎng)還描述了實(shí)體間 兩種關(guān)系 ： (a) 反應(yīng)（ reaction） , 即通過交互作用產(chǎn)生新的實(shí)體或過程 (b) 調(diào)控（ regulatory）事件 , 特定反應(yīng)對(duì)實(shí)體的作用。 GeneNet網(wǎng)絡(luò)
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