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g418篩選穩(wěn)定表達(dá)細(xì)胞系經(jīng)驗(yàn)總結(jié)-資料下載頁(yè)

2025-07-14 14:31本頁(yè)面
  

【正文】 00ug/ml范圍內(nèi)確定幾個(gè)梯度,比如先做個(gè)100ug/ml、400ug/ml、800ug/ml、1000ug/ml,按梯度濃度用培養(yǎng)基稀釋G418制成篩選培養(yǎng)基。: 吸除培養(yǎng)孔中培養(yǎng)基,PBS洗滌一次,每孔中加入不同濃度的篩選培養(yǎng)基。:根據(jù)培養(yǎng)基的顏色和細(xì)胞生長(zhǎng)情況,每3~5天更換一次篩選培養(yǎng)基。方法同4。:在篩選10~14天內(nèi)能夠殺死所有細(xì)胞的最小G418濃度即為最佳篩選濃度。在第一輪就篩選出最佳G418濃度的可能性不大,最有可能的是出現(xiàn)這種情況:用某一濃度G418的量在篩選14天后還不能殺死細(xì)胞,而用下一個(gè)梯度的 G418的量在10天前就看不到活細(xì)胞了。假如是400ug/ml不能殺死細(xì)胞,而800ug/ml在第5天就把所有細(xì)胞都?xì)⑺懒?,則可以再用500ug/ml、600ug/ml、700ug/ml進(jìn)一步篩選,以確定最佳篩選濃度!心得:由于特性明確的細(xì)胞系G418的最佳用量還是比較穩(wěn)定的,所以有時(shí)候不需要在這么大范圍內(nèi)進(jìn)行篩選。比如說你要轉(zhuǎn)染NIH3T3細(xì)胞,現(xiàn)在我告訴你我測(cè)試過NIH3T3細(xì)胞對(duì)G418的敏感性,我用的篩選濃度是200 ug/ml。這時(shí)你就可以做150ug/ml、200ug/ml、 300ug/ml三個(gè)濃度進(jìn)行篩選。通過預(yù)實(shí)驗(yàn)確定了最佳篩選濃度后,就可以做穩(wěn)定轉(zhuǎn)染了。a 轉(zhuǎn)染:轉(zhuǎn)染后培養(yǎng)24小時(shí)或者更長(zhǎng),到細(xì)胞增長(zhǎng)接近匯合時(shí)按1:4密度傳代,繼續(xù)培養(yǎng),待細(xì)胞密度增至50%~70%匯合時(shí);b 加G418:去掉培養(yǎng)液,PBS洗一次,加入按最佳篩選濃度配制好的G418篩選培養(yǎng)基。c 換液:根據(jù)培養(yǎng)基的顏色和細(xì)胞生長(zhǎng)情況,每3~5天更換一次篩選培養(yǎng)基。當(dāng)有大量細(xì)胞死亡時(shí),可以把G418濃度減半維持篩選。篩選10~14天后,可見有抗性的克隆出現(xiàn),停藥培養(yǎng),待其逐漸增大后;d 挑單克?。褐苽浼?xì)胞懸液,細(xì)胞計(jì)數(shù),用培養(yǎng)基稀釋細(xì)胞到1個(gè)/10ul。在96孔板中加入培養(yǎng)基150ul/孔,再加入細(xì)胞懸液10ul/孔。待其逐漸增大后轉(zhuǎn)入到48孔中增殖。e 單克隆鑒定:細(xì)胞大量擴(kuò)增后,提取總RNA,做RTPCR檢測(cè)目的基因是否存在。常見問題:?無怪乎兩種形式:整合在染色體中和存在于細(xì)胞質(zhì)中。沒有經(jīng)過篩選前大部分轉(zhuǎn)染進(jìn)細(xì)胞的質(zhì)粒是存在于胞質(zhì)中的,但是這種質(zhì)粒是不穩(wěn)定的,基本上篩選不出這種單克隆,只有穩(wěn)定整合入染色體的才是我們想要的穩(wěn)定細(xì)胞系。?整合是隨機(jī)發(fā)生的非同源性重組,neo基因表達(dá)而目的基因不一定都表達(dá),所以在篩選之后還要用RTPCR的方法進(jìn)一步鑒定。培養(yǎng)基處理的個(gè)人技巧體內(nèi)的任何細(xì)胞被置于體外培養(yǎng)后,對(duì)環(huán)境都有一個(gè)適應(yīng)過程,期間細(xì)胞對(duì)培養(yǎng)液具有同化作用,即細(xì)胞從培養(yǎng)液中攝取營(yíng)養(yǎng)的同時(shí),也向培養(yǎng)液排出自己的代謝產(chǎn)物和其它一些物質(zhì),其中有排泄物也有促細(xì)胞生長(zhǎng)因子。這個(gè)過程也是細(xì)胞同化培養(yǎng)基的過程。細(xì)胞越多則其同化作用越強(qiáng),所以細(xì)胞數(shù)目多比數(shù)目少較易生長(zhǎng)。在篩選后期,大批細(xì)胞死亡,不換液沒有死亡的細(xì)胞就會(huì)受到死亡細(xì)胞的影響,換液后殘留的少量細(xì)胞對(duì)培養(yǎng)基的同化作用不強(qiáng),也不利于生長(zhǎng)。我是用適應(yīng)性培養(yǎng)基來解決這一問題的:適應(yīng)性培養(yǎng)基的配制a 培養(yǎng)同源細(xì)胞至半?yún)R合狀態(tài)時(shí),更換一次培養(yǎng)液,再繼續(xù)培養(yǎng)24~48小時(shí)后,吸出所有培養(yǎng)液b 離心:3000~4000rpm 10 min后,吸取上清液c 慮過:,再加入2倍體積的新鮮培養(yǎng)基,低溫凍存?zhèn)溆谩418篩選實(shí)驗(yàn)相關(guān)問題問:G418篩選預(yù)實(shí)驗(yàn)用未轉(zhuǎn)染的細(xì)胞做,選1014天內(nèi)細(xì)胞死亡的最小濃度,然后將更高一級(jí)別的濃度應(yīng)用于轉(zhuǎn)染的細(xì)胞,是這樣嗎?答:G418是一種細(xì)胞毒性藥物(氨基糖苷類抗生素),依不同濃度,對(duì)細(xì)胞有一定的抑制或殺傷作用,而擬轉(zhuǎn)染的質(zhì)粒上帶有G418的藥代酶,能降解G418,從而使細(xì)胞獲得對(duì)G418的耐藥性。也就是說轉(zhuǎn)染后的細(xì)胞可以耐受G418,而未轉(zhuǎn)染成功的細(xì)胞不能耐受G418,因而被殺滅或抑制。通過G418篩選體系,使得未轉(zhuǎn)染成功的細(xì)胞比例不斷減少,轉(zhuǎn)染成功的細(xì)胞比例不斷增高。如果G418濃度太高則會(huì)殺傷所有的細(xì)胞,如果G418濃度太低則沒有什么毒性,兩種情況都不能起到篩選作用。G418篩選預(yù)實(shí)驗(yàn)則是先用未轉(zhuǎn)染的細(xì)胞做,選14天內(nèi)細(xì)胞死亡的最小濃度應(yīng)用于轉(zhuǎn)染的細(xì)胞,因?yàn)椴煌募?xì)胞對(duì)G418的耐受性也不一樣,這樣的目的是找一個(gè)實(shí)驗(yàn)細(xì)胞能耐受G418的工作濃度,從而為篩選轉(zhuǎn)染的細(xì)胞打下基礎(chǔ),因?yàn)檫@種濃度只能抑制未轉(zhuǎn)染的細(xì)胞,而不抑制轉(zhuǎn)染成功的細(xì)胞的!從而起到篩選作用。建議你再多查找一下國(guó)內(nèi)外相關(guān)文獻(xiàn),實(shí)驗(yàn)動(dòng)手之前一定要明白其原理,要不然會(huì)很盲目,充分的準(zhǔn)備可以避免走很多不必要的彎路!問:第二次篩選要怎么做?答:第二次篩選就是將轉(zhuǎn)染好的細(xì)胞接種培養(yǎng)后,向培養(yǎng)液中加入G418以殺傷或抑制其中的未轉(zhuǎn)染成功的細(xì)胞,因?yàn)椴还苻D(zhuǎn)染效率多么高,都不可能是100%,所以要通過G418篩選體系(或者其他篩選體系)來篩掉那些沒有成功轉(zhuǎn)染的細(xì)胞,此時(shí)加入G418的濃度可以略高于你第一次預(yù)實(shí)驗(yàn)時(shí)摸索出來的“最小有效濃度”,實(shí)驗(yàn)中可以再根據(jù)細(xì)胞生長(zhǎng)情況進(jìn)行濃度的調(diào)整!問:第二次篩選是經(jīng)過第一次篩選以后,已經(jīng)篩選出一部分轉(zhuǎn)染細(xì)胞了,但是因?yàn)橛行┘?xì)胞還是會(huì)丟失目的基因所以要得到穩(wěn)定表達(dá)的細(xì)胞還要進(jìn)行23次篩選,這時(shí)候還是用原來預(yù)實(shí)驗(yàn)的濃度,還是要再提高一個(gè)濃度?答:你要在熒光顯微鏡下觀察一下,判斷一下細(xì)胞轉(zhuǎn)染的效率,也就是轉(zhuǎn)染成功的細(xì)胞的比例,再根據(jù)情況選用或高或低的濃度!轉(zhuǎn)染成功的細(xì)胞的比例越高,則加入G418的濃度就可以越低。問:我的質(zhì)粒上沒有熒光標(biāo)記,要等到篩選完了以后打動(dòng)物的,那要怎么辦呢?答:可以用免疫細(xì)胞化學(xué)檢測(cè)! 問:做G418篩選預(yù)實(shí)驗(yàn)時(shí)每個(gè)濃度是不是要多弄幾個(gè)孔,還是一個(gè)孔就行了?篩選的培養(yǎng)液是不是要用沒有雙抗的,做穩(wěn)定轉(zhuǎn)染時(shí)必須用DMEM培養(yǎng)基嗎?答:用什么培養(yǎng)基視你培養(yǎng)的細(xì)胞特性而定吧 不見得非用DMEM,一般設(shè)三個(gè)復(fù)孔就足以 各濃度3復(fù)孔,設(shè)正常對(duì)照3復(fù)孔。以1014天細(xì)胞全部死亡的濃度為篩選濃度。由于基因轉(zhuǎn)染到細(xì)胞內(nèi)之后要一段時(shí)間才能表達(dá)出蛋白質(zhì)。所以篩選不能太早,但是也不能太晚,因?yàn)檗D(zhuǎn)染了外源基因的細(xì)胞代謝負(fù)荷較大,增殖較慢,時(shí)間長(zhǎng)了就會(huì)被沒有外源基因轉(zhuǎn)入的細(xì)胞所淹沒,最終導(dǎo)致篩選不出陽(yáng)性克隆,一般要在轉(zhuǎn)染24 h之后才開始加G418篩選 。答:每種細(xì)胞的生長(zhǎng)狀態(tài)和速度不同,在一些細(xì)節(jié)處理上可能也不同。我的是這樣做的:G418篩選實(shí)驗(yàn):轉(zhuǎn)染293細(xì)胞,生長(zhǎng)較快,所以在96孔板中加入100ul細(xì)胞(2000/ml),第二天就加入G418,從0,100,200…1000μg/ml,復(fù)3孔,每天觀察。前幾天,低濃度的孔中細(xì)胞生長(zhǎng),中濃度的細(xì)胞生長(zhǎng)緩慢,高濃度的不長(zhǎng),稀稀拉拉。約一周左右,中濃度的孔中出現(xiàn)死細(xì)胞,低濃度的死細(xì)胞較少,未加G418的孔長(zhǎng)得很密。 14天時(shí),觀察細(xì)胞全部死亡的最低濃度孔,在500 μg/ml,做穩(wěn)定轉(zhuǎn)染時(shí)選用的600 μg/ml。穩(wěn)定轉(zhuǎn)染:24孔板,細(xì)胞密度也較小,轉(zhuǎn)染后第二天1:10稀釋傳代,設(shè)立空白細(xì)胞對(duì)照組,第三天加G418(600μg/ml)。耐心等待2周,前一周細(xì)胞死亡較少,后一周死細(xì)胞較多,可3天換液,待對(duì)照組里的細(xì)胞全部死亡,就可以開始挑單克隆了G418篩選穩(wěn)定表達(dá)細(xì)胞系原理分析轉(zhuǎn)化的功能和表達(dá)需要DNA穩(wěn)定轉(zhuǎn)染至宿主細(xì)胞染色體。外源基因進(jìn)入細(xì)胞后,部分能夠通過細(xì)胞質(zhì)進(jìn)入細(xì)胞核內(nèi),根據(jù)細(xì)胞類型,至多80%的進(jìn)入核內(nèi)的外源DNA得到瞬時(shí)表達(dá)。極少數(shù)情況下,進(jìn)入細(xì)胞的外源DNA通過系列非同源性分子間重組核連接,形成巨大的***結(jié)構(gòu)最終整合進(jìn)細(xì)胞染色體。細(xì)胞基因組自由部分表達(dá),所以整合并不一定意味著表達(dá),只有整合到表達(dá)區(qū)的基因才會(huì)表達(dá),而且整合到不同的染色體區(qū)段的外源基因的表達(dá)的量也是不同的。由于攝取、整合、表達(dá)外源基因是小概率事件,通常根據(jù)新表型篩選穩(wěn)定轉(zhuǎn)染體。一般情況下這種新表型由共轉(zhuǎn)染的編碼抗生素抗性基因提供。細(xì)菌Tn5轉(zhuǎn)座子序列(neo抗性基因)攜帶的氨基糖苷磷酸轉(zhuǎn)移酶可以將G418轉(zhuǎn)變成無毒形式。G418是一種氨基糖類抗生素,其結(jié)構(gòu)與新霉素、慶大霉素、卡那霉素相似,它通過影響80S核糖體功能而阻斷蛋白質(zhì)合成,對(duì)原核和真核等細(xì)胞都有毒性 ,包括細(xì)菌、酵母、植物和哺乳動(dòng)物細(xì)胞 ,也包括原生動(dòng)物和蠕蟲。是穩(wěn)定轉(zhuǎn)染最常用的選擇試劑。當(dāng)neo基因被整合進(jìn)真核細(xì)胞基因組合適的地方后 ,則能啟動(dòng)neo基因編碼的序列轉(zhuǎn)錄為mRNA,從而獲得抗性產(chǎn)物氨基糖苷磷酸轉(zhuǎn)移酶的高效表達(dá) ,使細(xì)胞獲得抗性而能在含有G418的選擇性培養(yǎng)基中生長(zhǎng)。G418的這一選擇特性 ,已在基因轉(zhuǎn)移、基因敲除、抗性篩選以及轉(zhuǎn)基因動(dòng)物等方面得以廣泛應(yīng)用。在進(jìn)行轉(zhuǎn)染時(shí)細(xì)胞膜受到影響,抗生素可能對(duì)細(xì)胞產(chǎn)生較大影響,加上G418有殺菌作用,所以有人主張轉(zhuǎn)染時(shí)不加其它抗生素。其實(shí)G418本身有很好的殺菌效果,在用G418進(jìn)行篩選的過程中很少會(huì)發(fā)生污染。但有一點(diǎn),其實(shí)我覺得問題也不是很大,那就是:在老外的一本實(shí)驗(yàn)手冊(cè)中提到,在脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染時(shí)所用培養(yǎng)基中最好不加任何抗生素。我想他的想法可能是脂質(zhì)體對(duì)細(xì)胞膜有影響,可能此時(shí)加抗生素對(duì)細(xì)胞損傷較大。因?yàn)閼c大霉素、鏈霉素、G418均是氨基糖甙類藥物,其藥理作用完全一樣。所以沒有必要再用,而且由于另外抗生素的添加實(shí)際增加氨基糖甙類藥物的濃度,劑量有誤差,不利于各實(shí)驗(yàn)室之間的交流,在實(shí)際操作中,培養(yǎng)液中有抗生素對(duì)細(xì)胞培養(yǎng)與篩選影響不大。有人認(rèn)為用磷酸鈣共沉淀轉(zhuǎn)染法篩選穩(wěn)定整合子較好,但這種觀點(diǎn)是很多年以前的觀點(diǎn)了,而且只是少數(shù)人的觀點(diǎn)。我兩種方法都用過,但沒有特異的比較過,感覺都可以。磷酸鈣便宜,但對(duì)溶液配置和實(shí)驗(yàn)操作要求很高,尤其是溶液的PH值,要求精確到小數(shù)點(diǎn)后2位。脂質(zhì)體是現(xiàn)在主流的轉(zhuǎn)染試劑,從沒有人說這種方法做整合穩(wěn)定表達(dá)不行。非脂質(zhì)體是這幾年發(fā)展很快的技術(shù),轉(zhuǎn)染效率低,細(xì)胞毒性小,價(jià)格也不貴,Qiagen就有一個(gè)系列。我個(gè)人覺得不必要花太多時(shí)間在這方面,自己實(shí)驗(yàn)室用得好的技術(shù)可以堅(jiān)持,沒有經(jīng)驗(yàn)的可以選擇一個(gè)較著名的公司的產(chǎn)品開始,購(gòu)買之前先下載個(gè)說明書看看。有精力就比較一下幾種方法,一般的用達(dá)到目的就行了。關(guān)鍵是實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)
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