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g418篩選穩(wěn)定表達(dá)細(xì)胞系經(jīng)驗(yàn)總結(jié)(存儲(chǔ)版)

2025-08-13 14:31上一頁面

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【正文】 護(hù)。既然細(xì)胞表達(dá)neo,從理論上講是否無論多大濃度的G418對(duì)之都無影響?A:,外源基因與宿主染色體之間的整合是隨機(jī)的而且不是單拷貝的,這點(diǎn)我們做過FISH驗(yàn)證過,表達(dá)量與整合數(shù)目,上游序列特性,特定部位DNA立體結(jié)構(gòu)都是相關(guān)的,裝入了SV40只是增加了表達(dá)了數(shù)目,但并不能掩蓋其它因素對(duì)表達(dá)的影響。我們用neo,實(shí)際上是篩選的外源基因整合的數(shù)目,怎么說呢?用剛才的例子來說,如果我們抓著5個(gè)紅球,另一次抓著10個(gè)紅球,可以肯定,的二次抓的球比較多,那么第二次黃球數(shù)目比第一次多的概率就很大了。這就是酶與底物的比例關(guān)系嘛,這回不用數(shù)論的,用米氏方程理解吧。通常用的載體是靠非同源重組隨機(jī)整合的,所以為了獲得高表達(dá)細(xì)胞株,需要對(duì)重組克隆進(jìn)行篩選。:在100ug/ml~1000ug/ml范圍內(nèi)確定幾個(gè)梯度,比如先做個(gè)100ug/ml、400ug/ml、800ug/ml、1000ug/ml,按梯度濃度用培養(yǎng)基稀釋G418制成篩選培養(yǎng)基。這時(shí)你就可以做150ug/ml、200ug/ml、 300ug/ml三個(gè)濃度進(jìn)行篩選。e 單克隆鑒定:細(xì)胞大量擴(kuò)增后,提取總RNA,做RTPCR檢測(cè)目的基因是否存在。我是用適應(yīng)性培養(yǎng)基來解決這一問題的:適應(yīng)性培養(yǎng)基的配制a 培養(yǎng)同源細(xì)胞至半?yún)R合狀態(tài)時(shí),更換一次培養(yǎng)液,再繼續(xù)培養(yǎng)24~48小時(shí)后,吸出所有培養(yǎng)液b 離心:3000~4000rpm 10 min后,吸取上清液c 慮過:,再加入2倍體積的新鮮培養(yǎng)基,低溫凍存?zhèn)溆?。?014天細(xì)胞全部死亡的濃度為篩選濃度。穩(wěn)定轉(zhuǎn)染:24孔板,細(xì)胞密度也較小,轉(zhuǎn)染后第二天1:10稀釋傳代,設(shè)立空白細(xì)胞對(duì)照組,第三天加G418(600μg/ml)。G418是一種氨基糖類抗生素,其結(jié)構(gòu)與新霉素、慶大霉素、卡那霉素相似,它通過影響80S核糖體功能而阻斷蛋白質(zhì)合成,對(duì)原核和真核等細(xì)胞都有毒性 ,包括細(xì)菌、酵母、植物和哺乳動(dòng)物細(xì)胞 ,也包括原生動(dòng)物和蠕蟲。因?yàn)閼c大霉素、鏈霉素、G418均是氨基糖甙類藥物,其藥理作用完全一樣。有精力就比較一下幾種方法,一般的用達(dá)到目的就行了。非脂質(zhì)體是這幾年發(fā)展很快的技術(shù),轉(zhuǎn)染效率低,細(xì)胞毒性小,價(jià)格也不貴,Qiagen就有一個(gè)系列。但有一點(diǎn),其實(shí)我覺得問題也不是很大,那就是:在老外的一本實(shí)驗(yàn)手冊(cè)中提到,在脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染時(shí)所用培養(yǎng)基中最好不加任何抗生素。一般情況下這種新表型由共轉(zhuǎn)染的編碼抗生素抗性基因提供。約一周左右,中濃度的孔中出現(xiàn)死細(xì)胞,低濃度的死細(xì)胞較少,未加G418的孔長(zhǎng)得很密。建議你再多查找一下國(guó)內(nèi)外相關(guān)文獻(xiàn),實(shí)驗(yàn)動(dòng)手之前一定要明白其原理,要不然會(huì)很盲目,充分的準(zhǔn)備可以避免走很多不必要的彎路!問:第二次篩選要怎么做?答:第二次篩選就是將轉(zhuǎn)染好的細(xì)胞接種培養(yǎng)后,向培養(yǎng)液中加入G418以殺傷或抑制其中的未轉(zhuǎn)染成功的細(xì)胞,因?yàn)椴还苻D(zhuǎn)染效率多么高,都不可能是100%,所以要通過G418篩選體系(或者其他篩選體系)來篩掉那些沒有成功轉(zhuǎn)染的細(xì)胞,此時(shí)加入G418的濃度可以略高于你第一次預(yù)實(shí)驗(yàn)時(shí)摸索出來的“最小有效濃度”,實(shí)驗(yàn)中可以再根據(jù)細(xì)胞生長(zhǎng)情況進(jìn)行濃度的調(diào)整!問:第二次篩選是經(jīng)過第一次篩選以后,已經(jīng)篩選出一部分轉(zhuǎn)染細(xì)胞了,但是因?yàn)橛行┘?xì)胞還是會(huì)丟失目的基因所以要得到穩(wěn)定表達(dá)的細(xì)胞還要進(jìn)行23次篩選,這時(shí)候還是用原來預(yù)實(shí)驗(yàn)的濃度,還是要再提高一個(gè)濃度?答:你要在熒光顯微鏡下觀察一下,判斷一下細(xì)胞轉(zhuǎn)染的效率,也就是轉(zhuǎn)染成功的細(xì)胞的比例,再根據(jù)情況選用或高或低的濃度!轉(zhuǎn)染成功的細(xì)胞的比例越高,則加入G418的濃度就可以越低。細(xì)胞越多則其同化作用越強(qiáng),所以細(xì)胞數(shù)目多比數(shù)目少較易生長(zhǎng)。在96孔板中加入培養(yǎng)基150ul/孔,再加入細(xì)胞懸液10ul/孔。假如是400ug/ml不能殺死細(xì)胞,而800ug/ml在第5天就把所有細(xì)胞都?xì)⑺懒?,則可以再用500ug/ml、600ug/ml、700ug/ml進(jìn)一步篩選,以確定最佳篩選濃度!心得:由于特性明確的細(xì)胞系G418的最佳用量還是比較穩(wěn)定的,所以有時(shí)候不需要在這么大范圍內(nèi)進(jìn)行篩選。G418篩選穩(wěn)定表達(dá)細(xì)胞系PROTOCOL: 取1g G418溶于1ml 1M的HEPES液中,加蒸餾水至10ml,過濾消毒,4度保存。僅是我從臨床抗生素和化療藥的使用原則中悟出的道理,實(shí)在是個(gè)人經(jīng)驗(yàn),而且在基礎(chǔ)科學(xué)領(lǐng)域頂多算票友,我還是想聽聽諸位專業(yè)人士的理解和經(jīng)驗(yàn)。 4。打個(gè)比方,一個(gè)大口袋,抓100個(gè)紅球,再抓100個(gè)黃球,然后以從中抓若干個(gè),這些球均為紅球的概率有多大呢?應(yīng)該是很小的。按您的講法,篩選要進(jìn)行10代,那么維持劑量要進(jìn)行多長(zhǎng)時(shí)間?如果我使用對(duì)照組,在對(duì)照組細(xì)胞全部死亡后就用維持劑量進(jìn)行培養(yǎng)行嗎? 3。即使對(duì)于同一種細(xì)胞其篩選劑量和篩選時(shí)間也不一樣。三、注意事項(xiàng) 不要移去培養(yǎng)基,逐滴加入100μl 脂質(zhì)體/DNA混合物(從培養(yǎng)孔一邊到另一邊),邊加邊輕搖培養(yǎng)板。(2) (二)以下是一些建議,供參考:首先需要擴(kuò)增細(xì)胞,凍存部分中間產(chǎn)物細(xì)胞后,再做克隆化比較合適,否則一旦污染就會(huì)全軍覆沒。這就是酶與底物的比例關(guān)系嘛,這回不用數(shù)論的,用米氏方程理解吧。打個(gè)比方,一個(gè)大口袋,抓100個(gè)紅球,再抓100個(gè)黃球,然后以從中抓若干個(gè),這些球均為紅球的概率有多大呢?應(yīng)該是很小的。轉(zhuǎn)染后,每個(gè)細(xì)胞內(nèi)目的基因與宿主染色體的整合狀況是不同的,目的蛋白表達(dá)有的多,有的少,外源蛋白表達(dá)少的細(xì)胞由于代謝負(fù)荷較小,所以生長(zhǎng)較快,在生長(zhǎng)若干代之后,表達(dá)少的細(xì)胞會(huì)形成優(yōu)勢(shì),長(zhǎng)期之后,表達(dá)最弱的細(xì)胞會(huì)由于競(jìng)爭(zhēng)優(yōu)勢(shì)占主要,轉(zhuǎn)綠色熒光蛋白基因后,表達(dá)越來越暗就是這個(gè)道理。細(xì)胞越多則其同化作用越強(qiáng),所以細(xì)胞數(shù)目多比數(shù)目少較易生長(zhǎng)。在96孔板中加入培養(yǎng)基150ul/孔,再加入細(xì)胞懸液10ul/孔。假如是400ug/ml不能殺死細(xì)胞,而800ug/ml在第5天就把所有細(xì)胞都?xì)⑺懒?,則可以再用500ug/ml、600ug/ml、700ug/ml進(jìn)一步篩選,以確定最佳篩選濃度!心得:由于特性明確的細(xì)胞系G418的最佳用量還是比較穩(wěn)定的,所以有時(shí)候不需要在這么大范圍內(nèi)進(jìn)行篩選。最全的G418篩選穩(wěn)定表達(dá)細(xì)胞系總結(jié)?。?)Protocal : 取1g G418溶于1ml 1M的HEPES液中,加蒸餾水至10ml,過濾消毒,4度保存。然后刮除隱性克隆,消化陽性克隆后繼續(xù)篩選培養(yǎng);或則用套環(huán)套住陽性克隆,在套環(huán)內(nèi)加胰蛋白酶或EDTA消化,把消化液吸到另外一個(gè)新的孔中培養(yǎng)。這時(shí)藥物濃度可以降至200ug/ml?!斗肿涌寺 方o出了幾個(gè)常用細(xì)胞系所需G418的最佳用量。我個(gè)人覺得不必要花太多時(shí)間在這方面,自己實(shí)驗(yàn)室用得好的技術(shù)可以堅(jiān)持,沒有經(jīng)驗(yàn)的可以選擇一個(gè)較著名的公司的產(chǎn)品開始,購(gòu)買之前先下載個(gè)說明書看看。我想他的想法可能是脂質(zhì)體對(duì)細(xì)胞膜有影響,可能此時(shí)加抗生素對(duì)細(xì)胞損傷較大。,維持篩選壓力。:將培養(yǎng)孔中培養(yǎng)基吸除,PBS洗滌一次,每孔加入不同濃度篩選培養(yǎng)基,隔天更換一次篩選培養(yǎng)基,培養(yǎng)1014天,以最低細(xì)胞全部死亡濃度為基準(zhǔn)。 單克隆化后鑒定:,通過PCR鑒定,發(fā)現(xiàn)目的基因并不上調(diào),瞬時(shí)轉(zhuǎn)染表達(dá)是增高的。除非是類似帶GFP這樣能直接觀察到是否真陽性的基因,我們才用有限稀釋法來作,要不好像也太麻煩了吧?耗時(shí)也多單克隆化后細(xì)胞特點(diǎn)和處理::考慮質(zhì)粒的表達(dá)對(duì)細(xì)胞的生長(zhǎng)有一定的影響,查文獻(xiàn)確認(rèn)一下。4。(在要進(jìn)行操作時(shí),用酒精將手好好擦擦,將顯微鏡用新潔爾滅也擦一下,一般不會(huì)有什么問題),你可以試試,只要小心一些就行了。實(shí)驗(yàn)步驟大致為:預(yù)先對(duì)96孔板除第一排之外的所有孔加含15%胎牛血清的細(xì)胞培養(yǎng)液,并放于細(xì)胞培養(yǎng)箱中溫育,然后胰酶消化穩(wěn)定表達(dá)GFP的細(xì)胞,細(xì)胞液稀釋至密度為1000cell/ml的單細(xì)胞懸浮液,上述細(xì)胞液接種于96孔板的第一排,混合后,……,一直到第八排,操作示意圖見下圖。4,問題4。把細(xì)胞全部消化下來,在96孔板中逐步稀釋獲得單克隆2,問題2。篩選時(shí)的培養(yǎng)液加藥篩選約6天左右,細(xì)胞會(huì)大量死亡,孔中只剩下的細(xì)胞寥寥無幾。隨著細(xì)胞的代謝G418的濃度和活性都會(huì)下降,所以每3~5天都要更換一次含有G418的篩選液。在進(jìn)行轉(zhuǎn)染時(shí)細(xì)胞膜受到影響,抗生素可能對(duì)細(xì)胞產(chǎn)生較大影響,加上G418有殺菌作用,所以有人主張轉(zhuǎn)轉(zhuǎn)染時(shí)不加其它抗生素。有自己的體會(huì)也有其他戰(zhàn)友遇到的情況, 和大家分享. 沒有總結(jié)好的地方,大家補(bǔ)充。一個(gè)具體試驗(yàn):3x106個(gè)細(xì)胞電轉(zhuǎn)后,分別接種1/4000,1/1000,1/300細(xì)胞到24孔板中,48h后加藥篩選,此時(shí)1/300細(xì)胞孔內(nèi)大約50%匯合度。一般是轉(zhuǎn)染48小時(shí)后加入抗生素。再轉(zhuǎn)染后篩選過程中就可以應(yīng)用這種培養(yǎng)基。這個(gè)可能是在染色體上,合適的整合位點(diǎn)太少的緣故。5,從單克隆化時(shí)開始,就要加大營(yíng)養(yǎng),清和生長(zhǎng)因子。我的改進(jìn)之處:我在顯微鏡下觀察,標(biāo)記孔中小于10個(gè)細(xì)胞的孔,然后在顯微鏡下用記號(hào)筆在皿底把單個(gè)熒光細(xì)胞圈住,然后在操凈臺(tái)里用滅過菌底牙簽將圈外的細(xì)胞戳死,這樣留在孔中的就是單克隆了,通過這樣的,我一共獲得了6株單克隆。長(zhǎng)到大概80%以上的時(shí)候作轉(zhuǎn)染。6。復(fù)蘇后加G418傳代2次,然后按部就班。方案二:(1)配制1M HEPES: HEPES(緩沖能力更強(qiáng))粉末溶于100ml ddH2O,10N NaOH(加量較多),過濾除菌(較難過濾),4℃保存,終濃度為1mol/L。 300 ug/ml 500 ug/ml 700 ug/ml 900 ug/ml 1100 ug/ml 992 G418(500mg/ml) 轉(zhuǎn)染24小時(shí)后加最佳篩選濃度培養(yǎng)基,隔天換液。●套環(huán)法:用套環(huán)套住陽性克隆,在套環(huán)內(nèi)加胰酶
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