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包涵體的純化和復(fù)性總結(jié)最全的前人經(jīng)驗(yàn)-資料下載頁(yè)

2025-06-26 09:11本頁(yè)面
  

【正文】 過(guò)高,研究發(fā)現(xiàn)在低表達(dá)時(shí)很少形成包涵體,表達(dá)量越高越容易形成包涵體。原因可能是合成速度太快,以至于沒(méi)有足夠的時(shí)間進(jìn)行折疊,二硫鍵不能正確的配對(duì),過(guò)多的蛋白間的非特異性結(jié)合,蛋白質(zhì)無(wú)法達(dá)到足夠的溶解度等。 重組蛋白的氨基酸組成:一般說(shuō)含硫氨基酸越多越易形成包涵體,而脯氨酸的含量明顯與包涵體的形成呈正相關(guān)。 重組蛋白所處的環(huán)境:發(fā)酵溫度高或胞內(nèi)pH接近蛋白的等電點(diǎn)時(shí)容易形成包涵體。 重組蛋白是大腸桿菌的異源蛋白,由于缺乏真核生物中翻譯后修飾所需酶類,致使中間體大量積累,容易形成包涵體沉淀。因此有人采用共表達(dá)分子伴侶的方法以增加可溶蛋白的比例。 包涵體表達(dá)的有利因素: 可溶性蛋白在細(xì)胞內(nèi)容易受到蛋白酶的攻擊,包涵體表達(dá)可以避免蛋白酶對(duì)外源蛋白的降解。 降低了胞內(nèi)外源蛋白的濃度,有利于表達(dá)量的提高。 包涵體中雜蛋白含量較低,且只需要簡(jiǎn)單的低速離心就可以與可溶性蛋白分離,有利于分離純化。 對(duì)機(jī)械攪拌和超聲破碎不敏感,易于破壁,并與細(xì)胞膜碎片分離。 破菌: 機(jī)械破碎 超聲破碎 化學(xué)方法破碎 分離: 離心:500020000g15min離心,可使大多數(shù)包涵體沉淀,與可溶性蛋白分離。 過(guò)濾或萃取方法: 洗滌: 由于脂體及部分破碎的細(xì)胞膜及膜蛋白與包涵體粘連在一起,在溶解包涵體之前要先洗滌包涵體,通常用低濃度的變性劑如2M尿素在50mM,1mMEDTA中洗滌。此外可以用溫和去垢劑TritonX100洗滌去除膜碎片和膜蛋白。 溶解: 常用的變性劑有尿素(8M)、鹽酸胍(GdnHCl68M),通過(guò)離子間的相互作用,破壞包涵體蛋白間的氫鍵而增溶蛋白。其中尿素的增溶效果少差,異氰硫酸胍(GdnSCN)最強(qiáng)。 去垢劑:如強(qiáng)的陰離子去垢劑SDS,可以破壞蛋白內(nèi)的疏水鍵,可以增溶幾乎所有的蛋白。問(wèn)題是由于SDS無(wú)法徹底的去除而不允許在制藥過(guò)程中使用。 極端pH:可以破壞蛋白的次級(jí)鍵從而增溶蛋白。如有人在pH。有些蛋白可以溶解在60mMHCl中。這些方法只適合于少部分蛋白的增溶。 變性劑的使用濃度和作用時(shí)間:,尿素在堿性環(huán)境中不穩(wěn)定,一般不要超過(guò)pH10。有些蛋白只能用鹽酸胍如IL4。增溶時(shí)一般室溫過(guò)夜,但鹽酸胍在37度1小時(shí)便可以使多數(shù)蛋白完全變性溶解。 還原劑: 由于蛋白間二硫鍵的存在,在增溶時(shí)一般使用還原劑。還原劑的使用濃度一般是50100mM2BME或DTT,也有文獻(xiàn)使用5mM濃度。在較粗放的條件下,可以使用5ml/l的濃度。還原劑的使用濃度與蛋白二硫鍵的數(shù)目無(wú)關(guān),而有些沒(méi)有二硫鍵的蛋白加不加還原劑無(wú)影響,如牛生長(zhǎng)激素包涵體的增溶。對(duì)于目標(biāo)蛋白沒(méi)有二硫鍵某些包涵體的增溶,有時(shí)還原劑的使用也是必要的,可能由于含二硫鍵的雜蛋白影響了包涵體的溶解。 復(fù)性: 通過(guò)緩慢去除變性劑使目標(biāo)蛋白從變性的完全伸展?fàn)顟B(tài)恢復(fù)到正常的折疊結(jié)構(gòu),同時(shí)去除還原劑使二硫鍵正常形成。一般在尿素濃度4M左右時(shí)復(fù)性過(guò)程開(kāi)始,到2M左右時(shí)結(jié)束。對(duì)于鹽酸胍而言,可以從4M開(kāi)始,時(shí)復(fù)性過(guò)程已經(jīng)結(jié)束。 復(fù)性中常采用的方法有: 稀釋復(fù)性:直接加入水或緩沖液,放置過(guò)夜,缺點(diǎn)是體積增加較大,變性劑稀釋速度太快,不易控制。 透析復(fù)性:好處是不增加體積,通過(guò)逐漸降低外透液濃度來(lái)控制變性劑去除速度,有人稱易形成沉淀,且不適合大規(guī)模操作,無(wú)法應(yīng)用到生產(chǎn)規(guī)模。 超濾復(fù)性:在生產(chǎn)中較多的使用,規(guī)模較大,易于對(duì)透析速度進(jìn)行控制,缺點(diǎn)是不適合樣品量較少的情況,且有些蛋白可能在超濾過(guò)程中不可逆的變性。 柱上復(fù)性:是最近研究較多并成功的在生產(chǎn)中應(yīng)用的一種復(fù)性方法,如華北制藥的GCSF復(fù)性據(jù)說(shuō)是通過(guò)柱上復(fù)性進(jìn)行的。常用于復(fù)性的層析方法有SEC、HIC等。 還原劑的去除: 還原劑一般和變性劑的去除一起慢慢的氧化去除,使二硫鍵慢慢形成。但是由于二硫鍵的形成并不是蛋白質(zhì)正確折疊所必須的,可以考慮在變性劑完全去除之后,在去除還原劑使已經(jīng)按照正確的結(jié)構(gòu)相互接近的巰基間形成正確的二硫鍵。 常用的氧化方法有: 空氣氧化法:在堿性條件下通空氣,或者加入二價(jià)銅離子,能夠取得更好的效果,缺點(diǎn)是不易控制氧化還原電勢(shì)。 氧化還原電對(duì)(redox):常采用GSSG/GSH,通過(guò)調(diào)整兩者的比例來(lái)控制較精確的氧化還原電勢(shì),也可以在添加了還原劑如BME、DTT的增溶液中直接加入GSSG,如:5mMGSSG/2mMDTT=GSH/GSSG()。 復(fù)性的效率: 復(fù)性是一個(gè)非常復(fù)雜的過(guò)程,除與蛋白質(zhì)復(fù)性的過(guò)程控制相關(guān)外,還很大程度上與蛋白質(zhì)本身的性質(zhì)有關(guān),有些蛋白非常容易復(fù)性,如牛胰RNA酶有12對(duì)二硫鍵,在較寬松的條件下復(fù)性效率可以達(dá)到95%以上,而有一些蛋白至今沒(méi)有發(fā)現(xiàn)能夠?qū)ζ溥M(jìn)行復(fù)性的方法如IL11,很多蛋白的復(fù)性效率只有百分之零點(diǎn)幾。一般說(shuō)來(lái),蛋白質(zhì)的復(fù)性效率在20%左右。影響復(fù)性效率的因素有蛋白質(zhì)的復(fù)性濃度,變性劑的起始濃度和去除速度、溫度、pH、氧化還原電勢(shì)、離子強(qiáng)度、共溶劑和其他添加劑的存在與否等。 復(fù)性過(guò)程的添加劑: 共溶劑:如PEG600020000,據(jù)說(shuō)可以可逆的修飾折疊中間體的疏水集團(tuán),此外由于阻止了蛋白質(zhì)分子間的相互接觸的機(jī)會(huì),也可能對(duì)復(fù)性效率的提高起作用。%左右,具體條件可根據(jù)實(shí)驗(yàn)條件確定。 二硫鍵異構(gòu)酶(PDI)和脯氨酸異構(gòu)酶(PPI):PDI可以使錯(cuò)配的二硫鍵打開(kāi)并重新組合,從而有利于恢復(fù)到正常的結(jié)構(gòu),此外在復(fù)性過(guò)程中蛋白質(zhì)的脯氨酸兩種構(gòu)象間的轉(zhuǎn)變需要較高能量,常常是復(fù)性過(guò)程中的限速步驟,而PPI的作用是促進(jìn)兩種構(gòu)象間的轉(zhuǎn)變,從而促進(jìn)復(fù)性的進(jìn)行。 分子伴侶,即熱休克蛋白(HSP),是一種沒(méi)有蛋白質(zhì)特異性的促進(jìn)折疊的蛋白因子,研究發(fā)現(xiàn)很多蛋白在缺乏分子伴侶時(shí)無(wú)法自己正確的折疊。有人構(gòu)建了與伴侶分子共同表達(dá)的菌株,據(jù)說(shuō)效果不錯(cuò)。不過(guò)在生產(chǎn)中還沒(méi)有看到2和3的應(yīng)用的例子。 :成功的應(yīng)用于很多蛋白如tPA的復(fù)性中,可以抑制二聚體的形成。 甘油等:增加黏度,減少分子碰撞機(jī)會(huì),一般使用濃度在%530%。 一定的鹽濃度,可能是為了降低某些帶電集團(tuán)間的斥力,有利于蛋白質(zhì)的折疊。 輔助因子:添加蛋白質(zhì)活性狀態(tài)必須的輔助因子如輔酶輔基等或蛋白配體等很多時(shí)候?qū)Φ鞍踪|(zhì)正確的折疊是有利的。 色譜法:通過(guò)將目標(biāo)蛋白結(jié)合到層析柱上,減少蛋白分子間的相互影響,該方法得到越來(lái)越多的應(yīng)用,常用的色譜有SEC、HIC、IEC、IMAC等。 當(dāng)然,雖然有很多所謂的理性的復(fù)性方案設(shè)計(jì),目前的復(fù)性工作更多的是一個(gè)經(jīng)驗(yàn)的過(guò)程,沒(méi)有一種通用的方法可以套用。 復(fù)性時(shí)的蛋白濃度: ,太高的濃度容易形成聚體沉淀,太低的濃度不經(jīng)濟(jì),而且很多蛋白在低濃度時(shí)不穩(wěn)定,很容易變性。 復(fù)性效果的檢測(cè): 根據(jù)具體的蛋白性質(zhì)和需要,可以從生化、免疫、物理性質(zhì)等方面對(duì)蛋白質(zhì)的復(fù)性效率進(jìn)行檢測(cè)。 凝膠電泳:一般可以用非變性的聚丙烯酰胺凝膠電泳可以檢測(cè)變性和天然狀態(tài)的蛋白質(zhì),或用非還原的聚丙烯酰胺電泳檢測(cè)有二硫鍵的蛋白復(fù)性后二硫鍵的配對(duì)情況。 光譜學(xué)方法:可以用紫外差光譜、熒光光譜、圓二色性光譜(CD)等,利用兩種狀態(tài)下的光譜學(xué)特征進(jìn)行復(fù)性情況的檢測(cè),但一般只用于復(fù)性研究中的過(guò)程檢測(cè)。 色譜方法:如IEX、RPHPLC、CE等,由于兩種狀態(tài)的蛋白色譜行為不同。 生物學(xué)活性及比活測(cè)定:一般用細(xì)胞方法或生化方法進(jìn)行測(cè)定,較好的反映了復(fù)性蛋白的活性,值得注意的是,不同的測(cè)活方法測(cè)得的結(jié)果不同,而且常常不能完全反映體內(nèi)活性。 黏度和濁度測(cè)定:復(fù)性后的蛋白溶解度增加,變性狀態(tài)時(shí)由于疏水殘基暴露,一般水溶性很差,大多形成可見(jiàn)的沉淀析出。 免疫學(xué)方法:如ELISA、WESTERN等,特別是對(duì)結(jié)構(gòu)決定簇的抗體檢驗(yàn),比較真實(shí)的反映了蛋白質(zhì)的折疊狀態(tài)。 幾個(gè)復(fù)性的實(shí)例: MHCIIJBC269(47):1994 增溶:1640mgProtein,8MGdnHCl,1632mMDTT,1mMEDTA,50mMTris. 復(fù)性:816folddilutionto15mg/mlProtein. 增溶:10mMDTT,%SDS,25mMTris,200mMGlucine. 復(fù)性:10倍稀釋到10mMDTT,2mMDodOMalt(dodecylbetaDmaltoside),150mMNaCl,10mMTris,開(kāi)口透析8hr,對(duì)150mMNaCl,10mMTris BovinePrethrombin2,JBC270(1):1990四對(duì)二硫鍵。 增溶:7MGdnHCl,10mMTris,1mMEDTA4mg/ml. 復(fù)性:稀釋到100mMNa2HPO4,2mMEDTA,%PEG,04MGdnHCl,mMGSSG,mMGSH,mg/ml25mMsodiumphosphate,2mMEDTA,%PEG,透析3次,溫度4度。 純化: 一般說(shuō)來(lái),復(fù)性液的體積較大,為了減少處理體積,在進(jìn)行柱純化以前可以先進(jìn)行硫酸銨沉淀,沉淀在低速離心收集后復(fù)溶的鹽濃度較高,可以直接進(jìn)行HIC純化,目標(biāo)峰經(jīng)適當(dāng)稀釋后(cond5mS/cm)進(jìn)行IEX純化,然后通過(guò)SEC脫鹽,更換緩沖液,除菌過(guò)濾后,在質(zhì)量合格的情況下便可以進(jìn)入制劑階段。 當(dāng)然在復(fù)性濃度較高的情況下,也可以直接將復(fù)性液進(jìn)行IEX純化,優(yōu)點(diǎn)是在純化的同時(shí)進(jìn)行體積的濃縮,為以后的精制創(chuàng)造條件。 從生產(chǎn)的角度看,由于每增加一步純化工序便降低很多收率,所以可過(guò)兩到三次柱純化,工藝越簡(jiǎn)單越有利于收率的提高。當(dāng)然這只是一個(gè)一般的原則,對(duì)于純度要求較高的產(chǎn)品如重組人白蛋白,不得不進(jìn)行多次純化。包涵體蛋白的純化和復(fù)性包涵體蛋白的純化和復(fù)性1.菌體的收集和破碎用50 ml離心管分別收集誘導(dǎo)表達(dá)后的培養(yǎng)物,8000 rpm 4℃離心10 min。沉淀用適量的超聲破菌緩沖液重懸。【備注】超聲破菌緩沖液(20 mmol/L TrisHCl 、 mol/L NaCl、1 mmol/L EDTA、1 mg/mL溶菌酶)重懸后的菌液于冰浴中進(jìn)行超聲波破碎,其條件為:功率為300W,占空比50%,每個(gè)循環(huán)30 s,總時(shí)間20 min。破碎后的勻漿, 4℃、 12000 rpm離心15 min。分別取上清液和沉淀進(jìn)行12% SDSPAGE分析,確定目的蛋白是否以包涵體的形式表達(dá)。2.包涵體的處理洗滌:沉淀用適量的包涵體洗滌緩沖液重懸后,攪拌洗滌20~30 min,于4℃,12000 rpm離心15 min,棄去上清液。重復(fù)一次。再用適量的50 mmol/L Tris (以去除殘留的EDTA),于4℃ 12000 rpm離心15 min,棄去上清液。【備注】包涵體洗滌緩沖液(20 mmol/L Tris-HCl pH , mol/L NaCl,2 mol/L尿素,2% Triton)2%Triton X100溶液:量取2mlTriton X100(聚乙二醇辛基苯基醚)液,加M緩沖液98ml即可。溶解:沉淀用適量的包涵體溶解緩沖液重懸,室溫?cái)嚢?6小時(shí)或過(guò)夜。12000 rpm 4℃離心15 min,收集上清液?!緜渥ⅰ堪w溶解緩沖液(20 mmol/L Tris-HCl pH , mol/L NaCl,8 mol/L尿素, mmol/L DTT或100 mmol/L β巰基乙醇,2%Triton)3.目的蛋白的純化 親和層析基于目的蛋白與固相化的配基特異結(jié)合而滯留,其他雜蛋白會(huì)流過(guò)柱子。 另一種可應(yīng)用的親和純化標(biāo)簽是6組氨酸標(biāo)簽,組氨酸的咪唑側(cè)鏈可親和結(jié)合鎳、鋅和鈷等金屬離子,在中性或弱堿性條件下帶組氨酸標(biāo)簽的目的蛋白與鎳柱結(jié)合,在低pH下用咪唑競(jìng)爭(zhēng)洗脫。組氨酸標(biāo)簽與GST相比有許多優(yōu)點(diǎn):首先,由于只有6個(gè)組氨酸,分子量很小,一般不需要用酶切去除;其次,可以在變性條件下純化蛋白,在高濃度的尿素和胍中仍能夠保持結(jié)合力;另外6組氨酸標(biāo)簽無(wú)免疫原性,重組蛋白可直接用來(lái)注射動(dòng)物,也不影響免疫學(xué)分析。雖然有這么多的優(yōu)點(diǎn),但此標(biāo)簽仍有不足,如目的蛋白易形成包涵體、難以溶解、穩(wěn)定性差及錯(cuò)誤折疊等。鎳柱純化時(shí)金屬鎳離子容易脫落漏出混入蛋白溶液,不但會(huì)通過(guò)氧化破壞目的蛋白的氨基酸側(cè)鏈,而且柱子也會(huì)非特異吸附蛋白質(zhì),影響純化效果。若目的蛋白可與某種碳水化合物特異結(jié)合,或者需要某種特殊的輔因子,可將該碳水化合物或輔因子固相化制成親和柱,結(jié)合后目的蛋白可用高濃度的碳水化合物或輔因子洗脫。融合蛋白的表達(dá)和純化過(guò)程: ml 2YT或LB 培養(yǎng)中,37℃過(guò)夜培養(yǎng)。:100的比例取過(guò)夜培養(yǎng)液轉(zhuǎn)接。37℃擴(kuò)大培養(yǎng)至OD ?!?mM/L。 37℃搖床培養(yǎng)4~6h。,去上清。按40ml/100ml菌液加入1Binding Buffer {破碎緩沖液組成: 50mM Tris ~,1mM EDTA ,溶菌酶(10 礸/g cell),;或 20 mmol/l TrisHCl, pH ,1mmol/lEDTA, PMSF, DNAse (10 礸/g cell) }細(xì)胞破碎緩沖液中不含脲等變性劑,故不溶解包涵體?;?PBS重懸細(xì)胞。:占空比50%,超聲15s,停15s,10~20min。破碎后的勻漿在4℃,12,000 rpm下離心30 min,棄去上清液。:2M尿素在50mM Tris ~,1mM EDTA ,10% Triton X100中洗滌。洗滌2~4h 去除膜碎片和膜蛋白。8M尿素在50mM Tris ,1mM EDTA ,10% TritonX100,二硫鍵還原劑中洗滌。洗滌4~8h,使包涵體變性可溶。7. 過(guò)Ni柱:Ni2+親和層析柱純化 包涵體溶解后的上清液,用鎳親和層析柱純化。操作過(guò)程參照Amersham Pharmacia Biotech公司提供的操作指南進(jìn)行。具體過(guò)程如下:轉(zhuǎn)移樹(shù)脂到柱子,待完全沉淀后,用三蒸水洗滌鎳親和層析柱,以除盡基質(zhì)中的乙醇和空氣,并防止下一步Ni2+沉淀;5柱體積的Charge Buffer充電;20柱體積的三蒸水洗滌,去盡游離的Ni2+;10柱體積的Binding Buffer平衡柱子;手工上樣,根據(jù)蛋白的濃度來(lái)確定上樣體
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