引物設(shè)計實例分析ppt課件-資料下載頁
2025-04-29 01:58本頁面
【正文】 Primer2: 5’ GCGCggatccctCTTGTACAGCTCGTCCATGCC 以基因 GhAGP31為例說明 ， 以下是 GhAGP31的 ORF序列： ATGGGGTTTGCTGTAATAGTACTAGTAGTTAAAGCTGCTTTGCTTGTGCAGCTTTCACTGT TGTTACTGAGCACCTTCACTGTCTCTGCTCCCATTTGGCCTCAGGCTTCTCCTCCTCATTACC ATGCTGTTTCACCTGTAGTCCCGCCTACTCACCCACCAACCCACCACCATCACCACCACCCTCA CCCTCACCCTCACCCCCATCCTCATCCACCCACTAAGCCCCCAACCCCCACTCCTCCTCCAGTTC ATCCACCACCCAAGGCGCCAGTGCAACCACCAACCAAGCCACCAGTTCACCCACCACCCAAGCC ACCAGTTCAACCTCCAACTAAGCCACCAACCAAACCTCCAACTCAACCCCCGACTAAGCCACCA ACTCAGCCCCCGACTAAGCCACCAACCAAGCCTCCAACTCAGCCCCCGACGAAGCCACCAACACA CCCACCATCTCATCCTCCGGCCAAGCCACCTAAATCGAGCCAGGTGGCAGTGCAGGGCGTTGTTT ATTGCAAGTCATGCAAGTACGCCGGAGTCGACACCCTTTTGGGAGCTAAACCAATTCTTAGTGC CACCGTAAGGCTGACATGCAAAGACGCTAAAAACGAATTAACGGTCCAGTTCAAGACTGACAAG AATGGTTATTTCTTCCTGCAAGCACCAATTACCATCTACAATTTTGATCTCCACAATTGCAGCG TCTCCCTCGTATCTTCACCATTGAAAGCATGCAGCAAGCCATCTAATCTAAACGGTGGATTGAA GGGCGCCCCCTTGAAGCCTGAGAAACCATCTACTTCAAAGAAGCTCCCATATGTTCTCTACAGCG TTGGGCCCTTCGCTTTCGAACCCACATGTCACAAGAACTAG GhAGP31Up1: 5’ CTTGGATCCATGGGGTTTGCTGTAATAGTAC3’ BamHI GhAGP31Dn1: 5’ CTTTCTAGAGTTCTTGTGACATGTGGGTTCG3’ XbaI 兩條引物都有 CTT作為保護堿基 ， 同時平衡引物中的 G+C含量 。 CTT后面 6個堿基為酶切位點 ， 分別為 BamHI（ GGATCC） 、 XbaI（ TCTAGA） 酶切位點 ， 接下來 Up1為 ORF內(nèi)一段以 ATG開頭的上游序 列 ， 共 22個堿基 ， Dn1為終止密碼 TAG結(jié)尾的 22個堿基 。 Tm=， （ G+C） %=%。 實際上 ， 設(shè)計引物時應(yīng)根據(jù)實際情況而定 ， 盡量滿足引物設(shè)計原則 ， 但與理想情況會有偏差 。
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