微生物的生態(tài)與分類-資料下載頁
2025-01-13 23:47本頁面
【正文】 species 縮寫的單數(shù)和復(fù)數(shù)形式） 例如： Saccharomyces sp. 表示酵母菌屬中的一個種。 ?菌株名稱 ——在種名后面自行加上數(shù)字、地名或符號等，如： Bacillus subtilis AS=Academia Sinica Bacillus subtilis BF7658 BF=北紡 Clostridium acetobutylicum ATCC824 丙酮丁醇梭菌 ATCC ＝ American Type Culture Collection美國模式菌種保藏中心 ?當(dāng)文章中前面已出現(xiàn) 過某 學(xué)名時，后面 的 可將其屬名縮寫成 1~3個字母。 如 ： Escherichia coli 可縮寫成 E. coli Staphylococcus aureus可縮寫成 S. aureus ② 三名法 ： 用于對 亞種的命名，這時 在屬和種名后加寫一個 subsp.，然后再附上亞種名稱（斜排體）。 如： Bacillus thuringiensis subsp. galleria 蘇云金芽孢桿菌臘螟亞種 第二節(jié) 細(xì)菌分類鑒定方法 多相分類（ polyphasic taxonomy） 一 . 傳統(tǒng)分類法 二 . 數(shù)值分類法 三 . 化學(xué)分類法 四 . 遺傳學(xué)分類法 一 . 傳統(tǒng)分類法 一）形態(tài)結(jié)構(gòu)特征 1. 個體形態(tài) ：大小、形態(tài)和排列 特殊結(jié)構(gòu) 2. 群體形態(tài) ：培養(yǎng)特征 二）生理生化特征 1. 能量代謝 2. 對氧氣的要求 3. 營養(yǎng)和代謝特征 碳源 氮源 特殊的營養(yǎng)需要 特種酶 三）生態(tài)因子 溫度、酸堿、鹽度、壓力 與其他生物的關(guān)系 四）對噬菌體和藥物的敏感性 五）血清學(xué)反應(yīng) 表面抗原等 可溶性抗原 酶 二 . 數(shù)值分類法 收集菌株： 60～ 150株， 50～ 100個性狀 性狀編碼： 1， 0 相似性計(jì)算，列出矩陣 Ssm＝ , Sj ＝ 系統(tǒng)聚類分析 矩陣圖 → 樹狀圖 a+d a+b+c+d a a+b+c 相似性矩陣 矩陣圖 三 . 化學(xué)分類法 一）細(xì)胞壁組成 肽聚糖、脂多糖、蛋白質(zhì) 二）類脂組成 脂肪酸指紋 三）異戊二烯苯醌組分 四）蛋白質(zhì) 四 . 遺傳學(xué)分類法 1. DNA 堿基組成的測定 3. 16S rRNA或 18SrRNA 核苷酸序列分析 DNA 堿基組成的測定 （每個生物體的（ G+C） mol％是穩(wěn)定的） （細(xì)菌的范圍大： 20％～ 80％） 熱變性法 （ G+C） mol％ ＝ （ ） HPLC法 使用原則： G+C含量的比較主要用于分類鑒定中的 否定 每一種生物都有一定的堿基組成，親緣關(guān)系近的生物， 它們應(yīng)該具有相似的 G+C含量，若不同生物之間 G+C含 量差別大表明它們關(guān)系遠(yuǎn)。 但具有相似 G+C含量的生物并不一定表明它們之間具有近的親緣關(guān)系。 (1) DNA— DNA雜交 親緣關(guān)系相對近的微生物之間的親緣比較 (2) DNA—RNA雜交 親緣關(guān)系相對遠(yuǎn)的微生物之間的親緣比較 (3)核酸探針 利用特異性的探針，用于細(xì)菌等的快速鑒定 核酸的分子雜交 16SrRNA或 18SrRNA的核酸序列分析 16SrRNA被普遍公認(rèn)為是一把好的譜系分析的 “ 分子尺 ” ： 16SrRNA的序列高度保守，可精確指示細(xì)菌之間的親緣關(guān)系 16SrRNA的大小為 1500bp左右，所含信息能反映生物界進(jìn)化關(guān)系，易操作，適用于各級分類單元 目前常用的是建立在 PCR技術(shù)基礎(chǔ)上的 16SrRNA基因的直接測序法，方便快捷。
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