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微生物的分類和鑒定(2)-資料下載頁

2025-01-13 23:41本頁面
  

【正文】 的親緣關(guān)系。 同一個種內(nèi) 的不同菌株 G+C含量差別應(yīng)在 4~ 5%以下 ; 同屬 不同種的差別應(yīng)低于 10~ 15%; G+C含量已經(jīng)作為建立新的微生物分類單元的一項基本特征,它對于種、屬甚至科的分類鑒定有重要意義。 若二個在形態(tài)及生理生化特性方面及其相似的菌株,如果其 G+C含量的 差別大于 5%,則肯定不是同一個種, 大于 15%則肯定不是同一個屬。 在疑難菌株鑒定、新種命名、建立一個新的分類單位時,G+C含量是一項重要的,必不可少的鑒定指標(biāo)。 其分類學(xué)意義主要是作為建立新分類單元的一項基本特征和把那些 G+C含量差別大的種類排除出某一分類單元。 G+C含量的比較主要用于分類鑒定中的否定 (2) 核酸的分子雜交 不同生物 DNA堿基排列順序的異同直接反映生物之間親緣關(guān)系的遠(yuǎn)近,堿基排列順序差異越小,它們之間的親緣關(guān)系就越近,反之亦然。 核酸分子雜交 (hybridization)間接比較不同微生物 DNA堿基排列順序的相似性 a) DNADNA雜交; (親緣關(guān)系相對近的微生物之間的親緣關(guān)系比較) b) DNArRNA雜交; (親緣關(guān)系相對遠(yuǎn)的微生物之間的親緣關(guān)系比較) c)核酸探針; (利用特異性的探針,用于細(xì)菌等的快速鑒定) 30 2. 核酸分子雜交法 遺傳分類法 31 遺傳分類法 一種通過分析原核或真核細(xì)胞中最穩(wěn)定的 rRNA寡核苷酸序列同源行程度 ,乙確定不同生物間的親緣關(guān)系和進(jìn)化譜系的方法 RNA作為進(jìn)化的指征 16S rRNA被普遍公認(rèn)為是一把好的譜系分析的 “ 分子尺 ” : 1) rRNA具有重要且恒定的生理功能; 2)在 16SrRNA分子中,既含有高度保守的序列區(qū)域,又有中度保守和高度變化的序列區(qū)域,因而它適用于進(jìn)化距離不同的各類生物親緣關(guān)系的研究; 3) 16SrRNA分子量大小適中,便于序列分析; 4) rRNA在細(xì)胞中含量大 (約占細(xì)胞中 RNA的 90%),也易于提?。? 5) 16SrRNA普遍存在于真核生物和原核生物中 (真核生物中其同 源分子是 18SrRNA)。因此它可以作為測量各類生物進(jìn)化的工具。 (3) 16SrRNA或 18SrRNA的核酸序列分析 33 34 細(xì)胞化學(xué)成份用作鑒定指標(biāo) ? 細(xì)胞壁的化學(xué)成份 ? 全細(xì)胞水解液的糖型 ? 磷酸類脂成份 ? 醌類 ? 氣相色譜分析代謝產(chǎn)物如脂肪酸等 35 3.電子計算機在微生物學(xué)中的應(yīng)用 計算機應(yīng)用于微生物分類始于數(shù)值分類法 (numerical taxonomy)。所謂數(shù)值分類法,是通過廣泛比較分類單位的性狀特征,然后計算它們之間的相似性,再根據(jù)相似性的數(shù)值劃分類群的一種分類方法。 計算機在分類中的應(yīng)用,除進(jìn)行數(shù)值分類外,在生物分類的其他方面也發(fā)揮了巨大的作用, 如 rRNA、 DNA或蛋白質(zhì)等序列資料的貯存、分析;制作各類生物分類資料的軟 生物信息學(xué)
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