第十章微生物的進(jìn)化、系統(tǒng)發(fā)育和分類鑒定-資料下載頁(yè)
2025-10-08 11:54本頁(yè)面
【導(dǎo)讀】數(shù)情況下，導(dǎo)致生物表型改變和對(duì)生存環(huán)境的相對(duì)適應(yīng)。今天仍生存在地球上的生物種類，彼此之間都有或遠(yuǎn)或近的歷史淵源。地球上的物種估計(jì)大約有150萬(wàn)，其中微生物超過10萬(wàn)種，而且其數(shù)目還在不斷增加。物親緣關(guān)系為目標(biāo)；統(tǒng)發(fā)育的分類系統(tǒng)。缺少有性繁殖過程，根據(jù)形態(tài)推斷進(jìn)化關(guān)系往往不準(zhǔn)確；而不斷地被否定了。------------處在同一進(jìn)化水平上。1）在所需研究的種群范圍內(nèi)，它必須是普遍存在的。2）在所有物種中該分子的功能是相同的。1）rRNA具有重要且恒定的生理功能；3）16SrRNA分子量大小適中，便于序列分析；4）rRNA在細(xì)胞中含量大，也易于提取；分類歸屬，或建立新的分類單位。代表生物類群，分枝末端的結(jié)代表仍生存的種類。變化來(lái)表示分子序列的差異數(shù)值。三界理論雖然是根據(jù)16SrRNA序列的比較提出的，微生物進(jìn)行鑒定；地位的微生物所應(yīng)歸屬分類群的過程。以便與原來(lái)的菌株相區(qū)別。
【正文】 GC%測(cè)定主要用于對(duì)表型特征難區(qū)分的細(xì)菌 作出鑒定，并可檢驗(yàn)表型特征分類的合理性， 從分子水平上判斷物種的親緣關(guān)系。 3）使用原則： G+C含量的比較主要用于分類鑒定中的 否定 每一種生物都有一定的堿基組成，親緣關(guān)系近的生物， 它們應(yīng)該具有相似的 G+C含量，若不同生物之間 G+C含 量差別大表明它們關(guān)系遠(yuǎn)。 但具有相似 G+C含量的生物并不一定表明它們 之間具有近的親緣關(guān)系。 同一個(gè)種內(nèi)的不同菌株 G+C含量差別應(yīng)在 4～ 5%以下； 同屬不同種的差別應(yīng)低于 10～ 15%； G+C含量已經(jīng)作為建立新的微生物分類單元的一項(xiàng) 基本特征，它對(duì)于種、屬甚至科的分類鑒定有重要意義。 若二個(gè)在形態(tài)及生理生化特性方面及其相似的 菌株，如果其 G+C含量的差別大于 5%，則肯定 不是同一個(gè)種，大于 15%則肯定不是同一個(gè)屬。 在疑難菌株鑒定、新種命名、建立一個(gè)新的 分類單位時(shí)， G+C含量是一項(xiàng)重要的，必不 可少的鑒定指標(biāo)。 其分類學(xué)意義主要是作為建立新分類 單元的一項(xiàng)基本特征和把那些 G+C含 量差別大的種類排除出某一分類單元。 G+C含量的比較主要用于分類鑒定中的 否定 2. 核酸的分子雜交 不同生物 DNA堿基排列順序的異同直接反映生物之間 親緣關(guān)系的遠(yuǎn)近，堿基排列順序差異越小，它們之間 的親緣關(guān)系就越近，反之亦然。 ? 直接分析比較 DNA的堿基排列順序 ? 核酸分子雜交 (hybridization)間接比較不同微生物 DNA 堿基排列順序的相似性 （參見 P 333） 核酸分子雜交： a） DNADNA雜交； （親緣關(guān)系相對(duì)近的微生物之間的親緣關(guān)系比較） b） DNArRNA雜交； （親緣關(guān)系相對(duì)遠(yuǎn)的微生物之間的親緣關(guān)系比較） c）核酸探針； （利用特異性的探針，用于細(xì)菌等的快速鑒定） （參見 P 333334） 第四節(jié) 微生物的快速鑒定和自動(dòng)化分析 1. 微量多項(xiàng)試驗(yàn)鑒定系統(tǒng) （ 1） API 20 系統(tǒng)：法國(guó) Bio梅里埃公司生產(chǎn)，有 20 種不同的生化反應(yīng)，可鑒定 700 多種細(xì)菌，分不同系列，如 20A—— 厭氧菌， 20E—— 腸道菌 （ 2） Enterotube 系統(tǒng)：羅氏公司生產(chǎn)，有 15 種生化反應(yīng)，專門鑒定腸道菌 （ 3） Biolog 系統(tǒng)：美國(guó)安普公司生產(chǎn)，可自動(dòng)化鑒定，可鑒定 1140 種細(xì)菌 本章小結(jié) 進(jìn)化、菌株、模式菌株、培養(yǎng)物、 種（微生物）、 蛋白質(zhì)和核酸被用作微生物進(jìn)化譜系分析的原因； 16S rRNA被認(rèn)為是譜系分析的“分子尺”的原因；
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