微生物的分類和鑒定(1)-資料下載頁
2025-01-13 23:48本頁面
【正文】 ~73 丙酸放線菌 星狀諾卡氏菌 64~ 霉菌 米曲霉 產(chǎn)黃青霉 51~ 大毛霉 二孢蘑菇 44 *DNA 堿基中 G+C比例 ：同種微生物，其種內(nèi)各菌株間的 G+Cmol%值可差 ~%，相差過少（低于 2%）無分類學(xué)上的意義； 若相差在5%以上，可認(rèn)為是不同的種，相差超過 10%應(yīng)屬于不同的屬 。 （ G+C） %=（ ) Tm： 在 DNA加熱變性過程中，紫外吸收增加的中點(diǎn)值對應(yīng)的溫度。 （ 2） DNA雜交試驗(yàn) ? 將不同來源的 DNA在體外加熱解鏈 ， 并在合適條件下 ， 使互補(bǔ)的堿基配對結(jié)合成雙鏈 DNA， 然后根據(jù)能生成雙鏈的情況 ， 測定雜合百分率 。 核酸分子雜交 （ 同源性＞ 60%，屬于同種；同源性＞ 70%，屬于同一亞種；同源性在 20%~60%范圍內(nèi)時(shí)，屬于同一個(gè)屬 ）。 （ 3） rRNA寡核苷酸順序 rRNA核苷酸序列的變化要比 DNA的相應(yīng)變化慢而且保守得多。 16SrRNA和 18rRNA不但核苷酸數(shù)量適中，而且信息量大，易于分析。 締合系數(shù) SAB=2NAB/（ NA+NB） （ 4）微生物全基因組序列的測定 2） 細(xì)胞化學(xué)成分的鑒定 （ 1） 細(xì)胞壁成分分析 （ 2） 全細(xì)胞水解糖型 （ 3）磷酸類脂成分分析 （ 4）枝菌酸的分析 （ 5）醌類的分析 （ 6）氣相色譜技術(shù)的應(yīng)用 3） 數(shù)值分類法： ? 數(shù)值分類法 （ Numerical taxonomy)，又稱統(tǒng)計(jì)分類法（ Taxonometrics）。是根據(jù)與林奈同代人 (1727~1806,法國植物學(xué)家） 200年前發(fā)表的分類原理基礎(chǔ)上借助現(xiàn)代的計(jì)算機(jī)技術(shù)而發(fā)展起來的。 ? 它與傳統(tǒng)分類法的區(qū)別主要是： ? a) 傳統(tǒng)法采用的分類特征有主次之分，而數(shù)值法根據(jù) “ 等重要原則 ” ，不分主次，通過計(jì)算菌株間的總相似值來分群歸類； ? b) 傳統(tǒng)法根據(jù)少數(shù)幾個(gè)特征，采用雙岐法整理實(shí)驗(yàn)結(jié)果，排列出一個(gè)個(gè)分類群，而數(shù)值法采用的特征較多，一般是 50~60個(gè)，多的則達(dá)到 100個(gè)特征以上，進(jìn)行菌株間兩兩比較，數(shù)據(jù)處理量較大，需借助于計(jì)算機(jī)才能實(shí)現(xiàn)。 該方法的基本步驟是： a) 收集 50個(gè)以上 ， 甚至幾百個(gè)數(shù)據(jù) 。 b)按如下公式分別計(jì)算簡單匹配相似系數(shù) Ssm 和Jaccard相似系數(shù) SJ ： Ssm =（ a+ d） /（ a+b+c+d） Sj = a/（ a+b+c） a為兩菌株均呈正反應(yīng)的性狀數(shù) b為菌株甲呈正反應(yīng)而菌株乙呈負(fù)反應(yīng)的性狀數(shù) c 為菌株甲呈負(fù)反應(yīng)而菌株乙呈正反應(yīng)的性狀數(shù) d為兩者均呈負(fù)反應(yīng)的性狀數(shù)。 c) 出相似度矩陣 （ similarity metrices) d) 將矩陣圖轉(zhuǎn)換成樹狀譜 （ dendrogram） 矩陣圖轉(zhuǎn)換成樹狀譜后，為根據(jù)數(shù)值關(guān)系判斷分類關(guān)系提供了更直觀的材料。 10個(gè)菌株間 相似度矩陣 10個(gè)菌株間相似關(guān)系的樹狀譜
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