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分子生物學(xué)第四章生物信息的傳遞下-資料下載頁

2025-01-13 08:04本頁面
  

【正文】 化下, A位點(diǎn)上的 AAtRNA轉(zhuǎn)移到 P位點(diǎn),與 fMettRNAfMet上的氨基酸生成肽鍵。起始 tRNA從核糖體 P位點(diǎn)被擠出。 ⑶移位 核糖體向 mRNA的 3?端方向移動(dòng)一個(gè)密碼子。使第三位的密碼子對(duì)應(yīng)于 A位點(diǎn),準(zhǔn)備接受新的 AAtRNA。 肽鏈合成的終止 ① 釋放因子水解 P位點(diǎn)上多肽鏈與 tRNA之間的二酯鍵; ②新生的肽鏈及 tRNA從核糖體上釋放; ③核糖體兩個(gè)亞基解體,蛋白質(zhì)合成結(jié)束。 蛋白質(zhì)合成 動(dòng)畫 多核糖體循環(huán) ? 多核糖體可以在一條 mRNA鏈上同時(shí)合成多條相同的多肽鏈,這就大大提高了翻譯的效率。 多核糖體循環(huán): 真核生物 蛋白質(zhì)合成的不同點(diǎn): 1. 真核生物 蛋白質(zhì)合成與 mRNA的轉(zhuǎn)錄生成 不偶聯(lián) 2. 真核生物 蛋白質(zhì)合成機(jī)構(gòu)更復(fù)雜,起始步驟 涉及 因子 很多, 過程復(fù)雜 。 3. 真核生物 蛋白質(zhì)合成的調(diào)控復(fù)雜。 4. 真核生物與原核生物 蛋白質(zhì)合成可為 不同的 抑制劑所抑制 (五)蛋白質(zhì)合成后的加工修飾 1. N端 fMet或 Met的切除: ? 二硫鍵的形成: mRNA上沒有胱氨酸的密碼子,在肽鏈合成后通過二個(gè)半胱氨酸的疏基氧化而形成的,二硫鍵的形成對(duì)于許多酶和蛋白質(zhì)的活性是必需的。 3. 特定氨基酸的修飾。 氨基酸的側(cè)鏈修飾作用包括:磷酸化、糖基化、甲基化、乙基化、羥基化、羧基化等。 4. 切除新生肽鏈中非功能片段: 許多新合成的肽鏈要切除非功能段(如信號(hào)肽、 C-肽)才具有活性。 (六)蛋白質(zhì)合成的抑制劑 (一)抗生素類阻斷劑: 抑制細(xì)菌細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)合成而對(duì)人體副作用最小,它們作用主要抑制起始因子、延長(zhǎng)因子及核糖核蛋白體的作用等等。 (六)蛋白質(zhì)合成的抑制劑 (一)抗生素類阻斷劑: 鏈霉素、卡那霉素、新霉素干擾氨基酰 tRNA與核糖體的結(jié)合而發(fā)生讀。 四環(huán)素和土霉素: ①抑制細(xì)菌起始復(fù)合物的形成,②抑制氨酰 tRNA進(jìn) A位,阻滯肽鏈的延伸;③影響終止因子與核糖體的結(jié)合,使多肽鏈不能脫落離核糖體。 氯霉素: ①氯霉素與 A位緊密結(jié)合,阻礙氨基酰 tRNA進(jìn) A位,②抑制轉(zhuǎn)肽酶活性,使肽鏈延伸受到影響,菌體蛋白質(zhì)不能合成。 白喉霉素 它對(duì) 真核生物 的延長(zhǎng)因子 EF2起共價(jià)修飾作用,使 EF2失活,微量就能導(dǎo)致細(xì)胞死亡。 嘌呤霉素 結(jié)構(gòu)與酪氨酰 tRNA相似,當(dāng)延長(zhǎng)肽轉(zhuǎn)入此異常 A位時(shí),易脫落,終止肽鏈合成。因嘌呤霉素對(duì)原核和真核生物均有干擾作用,故難于用做抗菌藥物,有人試用于腫瘤治療。 (二)干擾素 ? 干擾素 (IF)是細(xì)胞感染病毒后產(chǎn)生的一類蛋白質(zhì),可抑制病毒繁殖,保護(hù)宿主。 六、蛋白質(zhì)運(yùn)轉(zhuǎn)機(jī)制 不論原核還是真核生物,所合成的蛋白質(zhì)需定位于細(xì)胞特定的區(qū)域,有些需分泌到胞外,稱分泌蛋白 。 細(xì)菌細(xì)胞內(nèi)起作用的蛋白質(zhì)一般靠 擴(kuò)散作用而分布到它們的目的地。 六、蛋白質(zhì)運(yùn)轉(zhuǎn)機(jī)制 真核細(xì)胞結(jié)構(gòu)更復(fù)雜,因此合成后的蛋白質(zhì)還要面臨跨越不同的膜而到達(dá)細(xì)胞器,有些蛋白質(zhì)在翻譯完成后還要經(jīng)過多種共價(jià)修飾,這個(gè)過程叫做 翻譯后處理 。 幾類主要蛋白質(zhì)的運(yùn)轉(zhuǎn)機(jī)制: 蛋白性質(zhì) 轉(zhuǎn)運(yùn)機(jī)制 主要類型 分泌 在結(jié)合核糖體上合成,以翻譯 轉(zhuǎn)運(yùn)同步機(jī)制運(yùn)輸 免疫球蛋白、卵蛋白、水解酶、激素 細(xì)胞器發(fā)育 在游離核糖體上合成,以翻譯后轉(zhuǎn)運(yùn)機(jī)制運(yùn)輸 核、葉綠體、線粒體、乙醛酸循環(huán)體、過氧化物酶體等細(xì)胞器中的蛋白質(zhì) 膜的形成 兩種機(jī)制都有 質(zhì)膜、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)、類囊體中的蛋白質(zhì) (一)細(xì)菌中蛋白質(zhì)的越膜 絕大多數(shù)越膜蛋白的 N端都具有大約 1530個(gè)以疏水氨基酸為主的 N端信號(hào)序列或稱信號(hào)肽 。信號(hào)肽的疏水段和信號(hào)序列之后的一段 α螺旋 (反平行)組成一個(gè)發(fā)夾結(jié)構(gòu),這樣蛋白易于膜。之后位于內(nèi)膜外表面的信號(hào)肽酶將 信號(hào)肽序列切除 。 (二)真核生物蛋白質(zhì)的分泌 ? 真核蛋白質(zhì) N端也有信號(hào)肽也形成2個(gè) α螺旋的發(fā)夾結(jié)構(gòu) ,這個(gè)結(jié)構(gòu)可插入到內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的膜中,將正在合成中的多肽鏈帶入內(nèi)質(zhì)網(wǎng)內(nèi)腔。 ? 信號(hào)肽識(shí)別顆粒 SRP 和內(nèi)質(zhì)網(wǎng) SRP受體使蛋白質(zhì) (分泌性?) 進(jìn)入內(nèi)質(zhì)網(wǎng)腔。 在蛋白質(zhì)越過內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的轉(zhuǎn)運(yùn)過程中, SRP和船塢蛋白(或 SRP受體)的作用 (三) 蛋白質(zhì)的翻譯-運(yùn)轉(zhuǎn)同步運(yùn)輸 絕大部分被運(yùn)入 ER內(nèi)腔的蛋白質(zhì)都帶有一個(gè)Signal peptide。該序列有3個(gè)特點(diǎn): ( 1)一般帶有 1015個(gè)疏水氨基酸; ( 2)常常在靠近該序列 N端疏水氨基酸區(qū)上游 帶有 1個(gè)或數(shù)個(gè)帶正電荷的氨基酸; ( 3)在 C末端近蛋白酶切割位點(diǎn)處常帶有數(shù)個(gè) 極性氨基酸,離切割位點(diǎn)最近的那個(gè)氨基 酸往往帶有很短的側(cè)鏈( Ala或 Gly)。 ? 研究發(fā)現(xiàn),一旦 信號(hào)肽序列 的 N端暴露在核糖體外,該序列和核糖體迅速與 SRP相結(jié)合,并誘發(fā) SRP與 GTP相結(jié)合,停止新生肽的進(jìn)一步延伸。 ? 受位于 ER外膜上的 SRP受體 及核糖體受體的牽引,該復(fù)合物( GTPSRP核糖體 mRNA新生肽)立即向 ER外膜靠攏,并通過 peptide transport plex進(jìn)入 ER內(nèi)腔。 翻譯 運(yùn)轉(zhuǎn)同步機(jī)制 (分泌蛋白途徑 ) ? 分泌蛋白 : 通過內(nèi)質(zhì)網(wǎng)分泌到 cell外或細(xì)胞間質(zhì) 中的蛋白。 ? 信號(hào)肽 : 進(jìn)入內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的蛋白質(zhì) N端有一段長(zhǎng) 1336個(gè)氨基酸的疏水性肽段(成熟分泌蛋白中不存在),能夠引導(dǎo)多肽鏈穿過 ER膜進(jìn)入 ER腔,稱為 信號(hào)肽 。 信號(hào)肽 的特點(diǎn): ⑴ 整體上是一段疏水的肽段; ⑵信號(hào)肽一般位于 N端,進(jìn)入 ER膜后被信號(hào)肽酶水解; ⑶信號(hào)肽的中部常常由 1015個(gè)殘基構(gòu)成疏水性核,前端常常有幾個(gè)帶正電荷的堿性氨基酸,后端為為含丙氨酸的區(qū)域; ⑷信號(hào)肽酶的水解位點(diǎn)通常是 “ AlaXAla”; ⑸信號(hào)肽可以位于蛋白質(zhì)分子的各個(gè)部位; ⑹普遍適用性。 信號(hào)識(shí)別蛋白( SRP)和 SRP受體蛋白( DP) ? SRP是一個(gè)小的 RNA蛋白質(zhì)復(fù)合體。 ? SRP可以分為兩個(gè)結(jié)構(gòu)域: (1)信號(hào)識(shí)別結(jié)構(gòu)域,由 RNA與蛋白質(zhì)所構(gòu)成。 (2)由其余 RNA和蛋白質(zhì)所構(gòu)成,其功能是使 肽鏈的延伸暫停,因而叫做延伸作用制動(dòng) 結(jié)構(gòu)域。 ? SRP的特性是能夠與核糖體相結(jié)合并使肽鏈的延伸暫時(shí)受阻, SRP對(duì)翻譯的阻斷是暫時(shí)的 ,當(dāng)它碰到DP時(shí),就不再阻止核糖體的翻譯,這時(shí) SRP離開核糖體而去識(shí)別新的信號(hào)序列。 (四)翻譯后運(yùn)轉(zhuǎn)機(jī)制 ? Rough ER上的蛋白質(zhì)常常通過運(yùn)轉(zhuǎn)載體將經(jīng)過修飾的蛋白質(zhì)送入高爾基體,再分別送到各個(gè)亞細(xì)胞位點(diǎn)。 線粒體蛋白質(zhì)跨膜運(yùn)轉(zhuǎn) 葉綠體蛋白質(zhì)跨膜運(yùn)轉(zhuǎn) 蛋白質(zhì)跨線粒體膜運(yùn)輸有如下特點(diǎn): ① 運(yùn)輸?shù)氖欠g結(jié)束后的 完整蛋白質(zhì) ; ②通過線粒體膜的蛋白質(zhì)在運(yùn)送前以前體形式存在,由成熟蛋白質(zhì)加上 N末端的一段前導(dǎo)肽 組成。 ③是一個(gè)需能過程。 ? 蛋白質(zhì)中的 核定位序列一般不被切除。 蛋白質(zhì)的核定位是通過多個(gè)蛋白的共同作用來實(shí)現(xiàn)的。Importin (α,β亞基 )的作用有點(diǎn)像 SRP受體。NLS蛋白 Importin復(fù)合物停留在核孔上,并在 RanGTPase的作用下通過核孔。 核定位蛋白跨核膜運(yùn)轉(zhuǎn)示意圖 (五)蛋白質(zhì)的降解 ? 蛋白質(zhì)降解是一個(gè)有序的過程。 ? 大腸桿菌許多蛋白質(zhì)降解是通過依賴于 ATP的 蛋白酶(稱為 Lon)來實(shí)現(xiàn)的。每切除一個(gè)肽鍵要消耗兩分子 ATP。 (五)蛋白質(zhì)的降解 ? 真核生物蛋白質(zhì)降解依賴于泛素( Ubiquitin)。與泛素相連的蛋白將被送到一個(gè)依賴于 ATP的蛋白質(zhì)降解系統(tǒng)( Proteasome)。 總結(jié)本章重點(diǎn) 1.遺傳密碼的性質(zhì)( 4點(diǎn)) 2. tRNA的三葉草型二級(jí)結(jié)構(gòu)及功能 3. rRNA的種類及核糖體的自我組裝 4.原核生物蛋白質(zhì)生物合成的過程*** 5.信號(hào)肽及其在翻譯 運(yùn)轉(zhuǎn)同步機(jī)制中的作用. 第一次作業(yè) 1. 比較原核生物與真核生物的基因組結(jié)構(gòu)、核糖 體組成以及 DNA復(fù)制、 RNA轉(zhuǎn)錄和翻譯過程主 要異同。
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