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全基因組檢測與遺傳病篩查-資料下載頁

2025-01-08 06:13本頁面
  

【正文】 D1S1 65l處的多點(diǎn) I OI)值為 ,兩點(diǎn)非參數(shù) LOI)值為 位于 I)1$547與 D1$346之間 。 Barlett等 (2022)用后驗(yàn)概率連鎖 (posterior probability linkage PPI )也得出 l(t23一 q24區(qū)域與孤獨(dú)癥有 明顯連鎖 。 ? Autism 孤獨(dú)癥譜系 — 美國 患病率在 1‰ ~ 2‰ 。 ? AUTsl0、 l2 分別位于 7號(hào)染色體的長臂 (7q36)與 2l號(hào)染色體的 21pl3一 q1l區(qū)域。 Molly等 (2022)對 34個(gè)除有一名孤獨(dú)癥患者外 .還有~孤獨(dú)癥或孤獨(dú)癥譜系疾病親屬、且二者均有退行性病史的家系進(jìn)行了金基因組分析,發(fā)現(xiàn) 7q35一 q36與孤獨(dú)癥 有明顯連鎖, 在 I)7S483附近得到非參數(shù) I OD值為 ,最大多點(diǎn) I OD 值為 。此外 .此表型亞群與 21p13一 ql1也呈現(xiàn)連鎖 .在 21pl3一 ql1區(qū)域的D21S1437位點(diǎn)非參數(shù) LOD值為 LOD值為 3. ? AUTSt3 位于 l2號(hào)染色體的長臂 (12q14)區(qū)域。 Ma等 (2022)在對有 6 名孤獨(dú)癥患者的 26個(gè)家系的研究中 孤獨(dú)癥連鎖, 在 rslt45442處得到多點(diǎn)非參數(shù) LOD值為 。當(dāng)用僅有男性患者的家系分析時(shí), LOD值增至 ,表明性別與患病之問存有特定關(guān)系。 ? AUTS14 位于 l6號(hào)染色體的短臂 ()區(qū)域。 Weiss等 (2022)在對 7j1個(gè)孤獨(dú)癥家系拷貝數(shù)變異 (copy nunJ~er variations CNV)研究中發(fā)現(xiàn) 7個(gè)來自不同家系 (At~lism Geic Resource Ex—change AGRE)的患兒 有缺失或重迭 ,其中麗個(gè)患兒的改變是遺傳自父母。通過一系列研究,最終將這個(gè)缺失和重迭區(qū)域定位于 l ,并且發(fā)現(xiàn) 1% 的孤獨(dú)癥 .與此位點(diǎn)關(guān)聯(lián) l、: 。 Marshall等 (2022)通過基因芯片技術(shù)在 127個(gè)孤獨(dú)癥譜系疾病家系中發(fā)現(xiàn) 189(44 )個(gè)家系有 277個(gè)不平衡 CNV,而這些 CNV并沒有出現(xiàn)在正常人中。雖然 大部分 CNV是遺傳自患音父母,但其中 27個(gè)為新改變 。4名忠哲在 l6pl CNV 在對照組未出現(xiàn)。 ? AU39。TSI5位于 7號(hào)染色體的長臂 (7q35一 q36)區(qū)域。 Alarcon等一 o 9年,對 l 2個(gè)家系進(jìn)行了孤獨(dú)癥三個(gè)亞型的分類 .包括:“說第一個(gè)字的年齡”、“說 一句短語的年齡”、“承復(fù)與刻扳行為”,并 n進(jìn)行了非參數(shù)多極連鎖分析 .結(jié)果顯示“說第一個(gè)字的年齡”與 7q35一 q36相連鎖 .并認(rèn)為在孤獨(dú)癥“說第一個(gè)字的年齡” Autism 孤獨(dú)癥譜系 — 診斷主觀( 患病率 3~ 4/萬深圳高達(dá) %。 ) ? 、“ 說第一句短語的年齡”與 7 c1牛 f1連鎖 “。后來征 2022年又增加丁樣本最,仍然重復(fù)出了上述結(jié)果。 ? 5 AU I39。SX1 位于 X染包體的短臂 (Xpl 3)區(qū)域。 Auranen等 (2022)對 38個(gè)芬蘭孤獨(dú)癥潞系疾病家系進(jìn)行了兩階段基因組掃描,發(fā)現(xiàn)了 多個(gè)連鎖位點(diǎn) .包括 ( 3q、 7q、 X{t。其中最大多點(diǎn) I O1)值: DXS7132附近,為 。一 Shao等 (2022)進(jìn)行的孤獨(dú)癥兩階段基因組掃描同樣得到多個(gè)易感位 篡,分別在 r{、 1j、 19千 11 X染色 。其 }I X染色體 I1)XS6789位點(diǎn)的懿夫多點(diǎn) I』 )I) 人 i 。, 6 AUTSX2 位于 染包 的題臂 ()區(qū)域。 Fomas等 (1999)報(bào)道了 8名在 缺失的女性,其中有 3人表現(xiàn)為孤獨(dú)癥。怍醬提出了一系列假說,包括: X染色怍鈍化、單倍制量不足以及鑲嵌現(xiàn)象,用以 解釋為什么只有某些女性的單條染色體缺失會(huì)表現(xiàn)出孤獨(dú)癥 。 ? AUTSX3 位于 X染色體的長臂的 Xq28區(qū)域。 I aI39。ll等 (2022)和 Carney等 (2022)分別在孤獨(dú)癥病例中發(fā)現(xiàn)了 MECP2基因的突變 ,此基因位于 Xq28處 L”’“ 。其中, Carney等 (2022)在 69名女性孤獨(dú)癥患者中發(fā)現(xiàn)了其中的 2人有兩個(gè)位于 MECP2基因中的不同的新發(fā)突變。 ? 我們將全基因組關(guān)聯(lián)分析 (Whole GenomeAssociation Study)與 DNA 混合分析 (I) A pooling)兩種方法相結(jié)合,對山東地區(qū) 38家孤獨(dú)癥患者核心家系進(jìn)行研究發(fā)現(xiàn) D7S5l3()與孤獨(dú)癥相關(guān)聯(lián),此位點(diǎn)與孤獨(dú)癥的關(guān)聯(lián)迄今在國內(nèi)外均無報(bào)道,此發(fā)現(xiàn)有助于在其附近尋找孤獨(dú)癥的易感基因。上述方法對其他多基因遺傳性疾病的研究,如:原發(fā)性高血壓、精神分裂癥等的研究同樣取得了好結(jié)果 . 孤獨(dú)癥 全基因組芯片唯一適宜 ? 孤獨(dú)癥易感基因 2q區(qū)域 (A I、 US5), l7q區(qū)域(AUTS6), l7q3l區(qū)域 (AUTS9), 7q36區(qū)域 (AUTS10), 17q21區(qū)域 (AU FS7), 7q35一 q36區(qū)域 (AU FS15), (AUTSX2), Xql3區(qū)域(AUTSX1), 全基因組芯片的技術(shù)局限性 ? 同源性平衡易位檢測較差,主要在少數(shù)淋巴瘤罕稀少同源性平衡易位 進(jìn)一步增高密度解決。 ? 點(diǎn)突變檢測豐度仍然欠缺,主要在少數(shù)未知的罕稀少突變發(fā)現(xiàn)較差 —配合基因測序解決。 MR兒童智力發(fā)育障礙 — 出生即應(yīng)檢測基因 ? 有些先天性代謝異常病,例如苯丙酮尿癥、同型胱氨酸尿癥、楓糖尿癥、組氨酸血癥,半乳糖血癥、先天性甲狀腺功能低下癥(克汀病)等,若能在新生兒期作出診斷及時(shí)治療,多數(shù)病兒智力可免受損害或病情得到控制 ? 苯丙酮尿癥、克汀病生后 3個(gè)月作出診斷及時(shí)治療,多數(shù)智力可以恢復(fù)正常,超過 6個(gè)月治療,幾乎不可避免地智力受到損害,如果 3~ 4歲以后再治療,病孩的身體發(fā)育亦有困難,難于治療的程度,智力障礙很嚴(yán)重。 ? 正常人的平均智商為 100。當(dāng)一個(gè)兒童的智商為 100時(shí)表示智力正常,假如一個(gè)兒章的智商在 70分以下,他的智力就被稱為“顯著低于”平均水平(簡化為“智商低于 70分”)。智商低于 70分的兒童,在 100個(gè)同齡兒童中僅有兩個(gè)。 ? 輕度 MR多用智力測驗(yàn),重度以上 MR依靠行為評定量表,兩種方法對同一例難于配合同時(shí)使用,導(dǎo)致 MR兒童智力發(fā)育障礙發(fā)病率如孤獨(dú)癥一樣在 2%1/萬之間 MR兒童智力發(fā)育障礙 發(fā)病率一般不超過 2%。 ? 智力低下的發(fā)病原因,大致可分為單基因遺傳病、多基因遺傳病、染色體異常及原因不明四種情況。染色體畸變引起的智力低下約占 15%~ 30%,單基因遺傳病引起的智力低下約占 5%,由多基因遺傳和環(huán)境因素(神經(jīng)系統(tǒng)感染,藥物濫用,或腦損傷。 )引起的智力低下約占 50%以上。 ? 單基因遺傳病,遺傳加 CUL4B基因突變, 重度發(fā)病 ? 染色體異常,如唐氏綜合征,其次如脆性 X綜合征X連鎖遺傳,男性發(fā)病,女性雜合子不完全顯性輕度發(fā)病 ? 多基因遺傳 ,分為器官性和非器官性,加上環(huán)境因素占所有 MR的 50% ? 27個(gè)非綜合征型 MR基因被確定 ,其中 23種是 X染色體連鎖致病基因 ,其余的 4個(gè)基因中 ,RSS1 CRBN和CC2D1A為常染色體隱性遺傳基因 ,只有CDKL3(cyclindependent kinaselike 3)是與非綜合征型 MR相關(guān)的常染色體顯性遺傳基因 , 智力低下的遺傳成因 染色體畸變,單基因突變,多基因遺傳,線粒體基因突變,新病因染色體端部的 DNA排列發(fā)生異常重組 ? 染色體數(shù)目畸變 常染色體數(shù)目畸變和性染色體數(shù)目畸變。 21三體綜合征完全型〔核型為47, XX(XY)+21〕、嵌合型〔核型為 47,XX(XY)+21/46, XX(XY)〕和易位型〔核型為46, XX(XY), 14, +t(14q; 21q)〕三種類型。完全型 21三體綜合征病情嚴(yán)重, IQ值在 2035之間,適應(yīng)性行為存在嚴(yán)重缺陷。嵌合型根據(jù)細(xì)胞異??寺∷急壤笮?,智力低下的程度可有所不同, IQ值在 3570之間。易位型雖然染色體總數(shù)正常,但少了一條正常的14號(hào)染色體,多了一條由 14和 21號(hào)染色體長臂組成的易位大染色體,實(shí)際上等于多了一條 21號(hào)染色體,其智力低下的程度類似于完全型 21三體綜合征。除 21三體綜合征外, 13三體綜合征、 18三體綜合征等 C組、 D組、 E組染色體數(shù)目增多都可引起嚴(yán)重的智力低下,且 D組、 E組染色體體積大,攜帶基因數(shù)目多,增加一條會(huì)導(dǎo)致多發(fā)畸形,故患兒存活時(shí) ? 性染色體數(shù)目畸變是指人類的性染色體數(shù)目異常引起,這類病的共同特征是性發(fā)育不全或智力發(fā)育障礙。如先天性卵巢發(fā)育不全綜合征 (核型為 45, X或 46, XX/45, X),先天性睪丸發(fā)育不全綜合征 (核型為 47,XXY或 46, XY/47, XXY),超雌綜合征 (核型為 47, XXX),超雄綜合征 (核型 47, XYY)等等都有輕度的智力低下、人格異常等癥狀。 MR兒童智力發(fā)育障礙 — 遺傳方式 ? 染色體結(jié)構(gòu)畸變 分為常染色體結(jié)構(gòu)畸變和性染色體結(jié)構(gòu)畸變。 ? 貓叫綜合征,為第五號(hào)常染色體短臂部分缺失所致,核型為 46, XX(XY), del(5)(p15)。 IQ值在 20左右,性染色體結(jié)構(gòu)畸變核型可表示為 46, fraX(q27q28),影響大腦的皮質(zhì)和邊緣系統(tǒng)發(fā)育,男性患病率 1/1250 ? 女性攜帶者有輕度智力低下 。另先天性卵巢發(fā)育不全綜合征也可因染色體結(jié)構(gòu)畸變引起,核型有 46, XXp、 46, XXq等。 ? 倒位攜帶者和平衡易位攜帶者, 106對夫妻中就有一方為攜帶者發(fā)生率為 % ? 單基因突變 常染色體隱性遺傳,苯丙酮尿癥、半乳糖血癥、黑朦性白癡、精氨酸血癥、粘多糖累積癥Ⅱ 型、部分白化病等。 ? 常染色體顯性遺傳,慢性進(jìn)行性舞蹈癥、結(jié)節(jié)硬化癥、強(qiáng)直性肌萎縮等都有智力低下的特征。遺傳性舞蹈癥常于 3045歲時(shí)緩慢起病,患者有大腦基底神經(jīng)節(jié)的變性,為進(jìn)行性加重的舞蹈樣不自主運(yùn)動(dòng)和智能障礙。 ? X連鎖隱性遺傳,自殘綜合征、眼腦腎綜合征等 ? )X連鎖顯性遺傳,口面指綜合征、色素失禁癥等有明顯的智力低下 ? 多基因遺傳病受遺傳和環(huán)境雙重因素的影響,智力低下的程度有很大不同,智商水平可在 3080之間, ? 線粒體基因突變,肌陣攣性 癲癇 伴碎紅纖維病,線粒體肌病腦病伴乳酸中毒及腦卒中樣發(fā)作綜合征,慢性進(jìn)行性眼外肌麻痹、神經(jīng)病伴共濟(jì)失調(diào)和視網(wǎng)膜色素變性等病智力低下。新病因染色體端部的 DNA排列發(fā)生異常重組 智力低下的再發(fā)風(fēng)險(xiǎn) 群體發(fā)病率 ? 40歲以上正常人生育患兒的比例明顯升高(1∶ 501∶ 100) ? 智力低下平衡易位攜帶者患者的子女將有50%的患病可能。 ? 單基因突變引起智力低下的再發(fā)風(fēng)險(xiǎn) 常染色體隱性遺傳( 隱性純合子)再發(fā)風(fēng)險(xiǎn)是 1/4表型正常的子代是攜帶者的概率是 2/3;一方患病,另一方正常,子代再發(fā)風(fēng)險(xiǎn)是 0,但都是攜帶者;若夫婦一方患病,另一方是攜帶者,子代再發(fā)風(fēng)險(xiǎn)是 1/2。 ? (2)常染色體顯性遺傳雜合子,一方患病,子代每胎的再發(fā)風(fēng)險(xiǎn)都是 1/2。若夫妻雙方都患病,子代的再發(fā)風(fēng)險(xiǎn)為 3/4。夫妻都正常,子代再發(fā)風(fēng)險(xiǎn)為 0。但要注意不規(guī)則顯性遺傳及延遲性顯性遺傳的情 ? , ? X連鎖隱性遺傳男性發(fā)病率高于女性,女性患者都是隱性純合子,男性患者是半合子。若夫患病,妻正常,兒女再發(fā)風(fēng)險(xiǎn)是 0,女兒都是攜帶者;若夫正常,妻患病,兒子再發(fā)風(fēng)險(xiǎn)是 1,女兒都是攜帶者;若夫正常,妻為雜合子,兒子再發(fā)風(fēng)險(xiǎn)是 1/2,女兒表型正常,但有 1/2的可能是攜帶者;若夫患病,妻為雜合子,兒女再發(fā)風(fēng)險(xiǎn)都是 1/2。 ? X連鎖顯性遺傳此類遺傳方式的疾病女性發(fā)病率高于男性,男患者的所有女兒都是患者,兒子正常,女患者的兒女各有 1/2的發(fā)病風(fēng) ? 多基因遺傳病的再發(fā)風(fēng)險(xiǎn)比單基因病復(fù)雜,群體發(fā)病率、親屬等級(jí)、已有患病人數(shù)、遺傳度、病情輕重等因素, ? 線粒體遺傳病的主要特征為母系遺傳,若父患病,母正常,子女均正常;若父正常,母患病,子女均有患病可能。 MR:智力發(fā)育障礙類型和臨床檢查 ? 廣義 MR:自閉癥型 —輕中重 ? Angelman syndrome (Type 1) 智力和發(fā)育遲緩安格爾曼綜合癥,智力和發(fā)育遲緩,睡眠障礙,癲癇發(fā)作 ,拍手 ,微笑 ? Alpha thalassemia mental retardation (OS) α型地中海貧血精神發(fā)育遲滯綜合征 ? Syndrome魯賓斯坦綜合征 :智力和運(yùn)動(dòng)發(fā)育遲緩 ,拇指與 ? Autism, Xlinked, susceptibility to, 2 自閉癥、 X連鎖、易感性相關(guān) ? Xlinked mental retardation21 X連鎖的精神發(fā)育遲滯 21型 ? Xlinked mental retardation54/ lissencephaly / ambiguous genitalia X連鎖的智力缺陷 54型、 X連鎖的無腦回伴隨不明生殖器綜合征、 X連鎖的嬰兒性痙攣 ? Xlinked mental
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