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醫(yī)學]第一章核酸與分子標志物-資料下載頁

2025-01-08 01:24本頁面
  

【正文】 RNA 環(huán)狀分子;線性分子 ? 什么是正鏈病毒?什么是負鏈病毒? 如果基因組序列與 mRNA相同,稱為正鏈 DNA(+DNA)或正鏈 RNA(+RNA)病毒。 如果與 mRNA互補,則稱為負鏈 DNA(DNA)或負鏈 RNA(RNA)病毒。 ?單鏈正鏈 RNA病毒基因組可直接作為模板功能,翻譯出所編碼的蛋白質(zhì),并復制出病毒核酸,自我組裝成為成熟的病毒顆粒,感染宿主細胞。 ?單鏈負鏈 RNA病毒基因組不能直接作為模板功能,先以基因組 RNA為模板轉(zhuǎn)錄生成互補 RNA,然后以這個互補的 RNA為模板,翻譯出所編碼的蛋白質(zhì)。 這種結(jié)構(gòu)的意義在于使較小的基因組能攜帶較多的遺傳信息,使病毒利用有限的基因,編碼更多的蛋白質(zhì)。 噬菌體 ΦΧ174是單鏈 DNA病毒,含 A、 A*、 B、 C、 D、 E、F、 G、 H、 J及 K共 11個蛋白質(zhì)基因 ,但這些基因卻只能轉(zhuǎn)錄成 3個 mRNA,其中一個從 A基因開始,一個從 B基因開始,另一個從 D基因開始。 :以雙鏈 DNA為常見 : DNA病毒的基因組中,不同基因可以不同的鏈作為轉(zhuǎn)錄模板 : 幾乎所有真核 DNA病毒都是在活宿主細胞核內(nèi)復制 4 .致病性: 較大的雙鏈 DNA病毒可引起多種嚴重疾病,而較小的 DNA病毒會在宿主體內(nèi)誘發(fā)腫瘤。 (二) DNA病毒 5.有的 DNA病毒不能直接通過 DNA復制過程進行基因組復制 : 必須先轉(zhuǎn)錄出一個 RNA中間體(前基因組),然后通過逆轉(zhuǎn)錄過程才能完成基因組復制 (HBV)。 6. DNA病毒一般比 RNA病毒大,生活周期較復雜。 腺病毒基因組 乙型肝炎病毒基因組 ? 基因組長 ,是帶有部分單鏈區(qū)的環(huán)狀雙鏈 DNA分 子,兩條鏈長度不等。 ? 長鏈為負鏈: L() 長度固定,攜帶有病毒全部的編碼信息。 ? 短鏈為正鏈: S(+) 長度不等,約 。 (一)基因組的一般特點 (二)幾種典型的 RNA病毒 (三) RNA病毒 ,但以單鏈 RNA為多見 ,因此病毒 RNA鏈有正負之分 RNA,含有 2個相同的(+ )RNA,屬于雙倍體 ,平均每 103104個 bp中有一個突變 RNA病毒的復制方式不相同,但均需經(jīng)逆轉(zhuǎn)錄完成其基因組的復制 (一)基因組的一般特點 丙型肝炎病毒基因組 ? 病毒呈球型顆粒,直徑約 50nm,有脂質(zhì)包膜 ? 基因組為單鏈正鏈 RNA病毒,鏈長約 ? 整個基因組只有一個 ORF,編碼3011或 3010個氨基酸 人類免疫缺陷病毒基因組 人類免疫缺陷病毒是獲得性免疫缺陷綜合征( AIDS)的病原體,屬于 逆轉(zhuǎn)錄病毒 ? 由 2條相同的正鏈 RNA在 5′端通過氫鍵互相連接形成二聚體 ? 單鏈 RNA含 9749個核苷酸,共有 9個基因: 3個為結(jié)構(gòu)基因( gag、 pol、env), 6個為調(diào)控基因( tat、rev、 nef、 vif、 vpr、 vpu) 三、人類基因組 細胞核基因組 細胞質(zhì)基因組(線粒體基因組) b .散在重復序列 (一)基因組結(jié)構(gòu)特征 Introns are removed to make mRNA from an interrupted gene RNA synthesis Splicing remove introns Protein synthesis mRNA 串聯(lián)重復序列 ? 重復頻率可達 106以上 ? 在基因組中所占比例隨種屬而異,約占10%60% ,在人類基因組中約占 20% ? 復雜度低 ,復性速率快 衛(wèi)星 DNA( satellite DNA) ? 大小不一,成串排列 ? 堿基序列不同于其他部份,等密度梯度離心可將其與主體 DNA分開 小衛(wèi)星 DNA 微衛(wèi)星 DNA DNA指紋用于罪犯識別 DNA指紋用于親子鑒定 ? 多基因家族( multi gene family) 由某一祖先基因經(jīng)過重復和變異所產(chǎn)生的一組基因。 ? 假基因( pseudogene) 多基因家族中不產(chǎn)生有功能的基因產(chǎn)物的某些成員 ,用 ? 表示。 多基因家族的特點: ① 多基因家族 的成員可以 串聯(lián)排列在一起 ,形成基因簇 (gene cluster)或串聯(lián)重復基因,如 rRNA、tRNA和組蛋白的基因; ② 有些多基因家族 的成員也可 位于不同的染色體上 ,如珠蛋白基因; ③有些成員 不產(chǎn)生有功能的基因產(chǎn)物 ,這種基因稱為假基因 (Pseudogene). (二)人類基因組多態(tài)性 ( single nucleotide polymorphism, SNP) ( restriction fragment length polymorphism, RFLP) 多態(tài)性出現(xiàn)在限制性核酸內(nèi)切酶的酶切位點序列中,用某個內(nèi)切酶水解基因組的某段序列時,在同種的不同個體之間該段序列可能被酶解成長短不等的幾個 DNA片段。這段序列在該種生物的群體中形成多態(tài)性。 限制性核酸內(nèi)切酶片段長度多態(tài)性 ? 單個核苷酸的變異,人群中個體差異最具代表性的 DNA多態(tài)性 ? 人類基因組中每 1kb就有一個 SNP位點 ,共約300萬個 ? 變異的 4種形式 ? 三種顛換: C←→ A ( G←→ T ) C←→ G ( G←→ C ) T←→ A ( A←→ T ) ? 一種轉(zhuǎn)換: C←→ T ( G←→ A ) ? 轉(zhuǎn)換的頻率是顛換的 3倍,因此轉(zhuǎn)換是 SNP發(fā)生的主要原因。 第四節(jié) 核酸分子標志物 基因突變、基因多態(tài)性位點、等位基因等分子生物學檢驗的具體內(nèi)容統(tǒng)稱為核酸分子標志物 一、核酸分子標志物的分類 二、分子標志物的未來發(fā)展 一、核酸分子標志物的分類 (一)基因突變 (二)基因多態(tài)性位點 (三)等位基因 (四) RNA (五) 線粒體 DNA (六)病原生物基因組 (七) 循環(huán)核酸 思考題: ? 原核生物基因組和真核生物基因組有什么區(qū)別?
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