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dna分子標記的種類-資料下載頁

2025-05-10 12:50本頁面
  

【正文】 糖凝膠電泳將 DNA片段分開,用 EB染色,觀察。與 RFLP 技術一樣,CAPS技術檢測的多態(tài)性其實是酶切片段大小的差異。在酶切前進行 RCR產物檢測,其多態(tài)性稱為 ALP。 Neff et at, (1998)在此基礎上又發(fā)展出dCARS技術 (derived CAPS),這是檢測單核苷酸多態(tài)性的一種良好方法。 三、第三代分子標記技術:單核苷酸多態(tài)性 (SNP)技術 ? 單核苷酸多態(tài)性是指基因組 DNA序列中由于單個核苷酸( A, G, C, T)的突變引起多態(tài)性,它是一種單核苷酸的變異。 ? SNP是基因組中最簡單、最常見的多態(tài)性形式,具有很高的遺傳穩(wěn)定性。 ? 隨著計算機和 DNA芯片技術引入分子生物學領域,研究者可同時對成千上萬個克隆測序,用計算機分析數(shù)據(jù)和顯示最終結果。常用方法: 隨即擴增 DNA( RAPD)法; DNA芯片( DNAchip)檢測法 應用 ? 遺傳疾病研究 ? 基因連鎖和關聯(lián)分析 ? 藥物基因組學 ? 藥物發(fā)現(xiàn) /藥靶 ? 農業(yè) /畜牧業(yè)遺傳學 ? 法醫(yī) /個體識別 ? 其它 四、其他幾種分子雜交技術 :多重連接探針擴增技術 多重連接探針擴增技術( multiplex ligationdependent probe amplification ,MLPA)是一種針對待檢DNA序列進行定性和半定量分析的技術。該技術高效、特異,在一次反應中可以檢測 45個核苷酸序列拷貝數(shù)的改變,目前已經應用于多個領域、多種疾病的研究。 標記 ( Resistance Gene Analogs ,抗病基因類似物 ) RGAs 是用基于抗病基因保守序列設計的引物擴增基因組得到的抗病基因類似序列的新型的分子標記。盡管基因間整個序列的同源性不足于用 RFL P 雜交檢測 ,但抗病基因中存在的這些保守區(qū)域為在其它植物中進行 PCR 擴增和分離 RGAs 提供了機會。 (Sequence Related Amplified Polymorphism ,相關序列擴增多態(tài)性 ) SRAP 標記是基于 PCR 技術的新型分子標記技術 ,其原理是利用基因外顯子里 G、 C 含量豐富 ,而啟動子和內含子里 A、 T 含量豐富的特點設計兩套引物 ,對開放閱讀框架進行擴增。 RAPD技術源于 PCR技術,但又不同于 PCR技術,差別主要體現(xiàn)在隨機擴增引物上。首先,隨機擴增引物是單個加入,而不是成對 (正、反向引物 )加入,其次,隨機引物短,一般 RAPD技術采用的引物含 10個堿基,由于隨機引物較短,與常 PCR相比, RAPD退火溫度較低,一般為 35— 45℃ 。 SRAP的技術流程 大小 : 17~18bp 上游引物:在 5’端前 10個是填充序列,接著是 CCGG, 3’端是 3個選擇堿基。 下游引物 :在 5’端前 11個是填充序列,接著是 AATT, 3’端是 3個選擇堿基。 引物的設計原則: 它們不能形成發(fā)夾結構或其他耳機結構 G 、 C含量在 40~50% 上游和下游的填充序列長度在 10或 11個堿基,二者必須不同 模板:基因組 DNA或者 cDNA 方法:復性變溫法 擴增程序: 標記 ( Target Region Amplified Polymorphism ,靶位區(qū)域擴增多態(tài)性 ) TRAP 是由 HUJ G等于 2021 年從 SRAP 技術改進而來的新型分子標記技術 ,其原理是借助大規(guī)模測序技術產生的龐大生物序列信息 ,利用生物信息學工具和表達序列標簽數(shù)據(jù)庫信息設計引物 ,對目標候選基因序列區(qū)進行 PCR 擴增產生多態(tài)性標記。此標記具有操作簡單、重復性好、穩(wěn)定性好、效率高的特點。目前已經成功應用于許多植物的遺傳圖譜構建、重要性狀基因標記、種質資源的多樣性研究及分子標記輔助育種等方面。
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