dnastar軟件包的使用-資料下載頁
2025-05-10 12:50本頁面
【正文】 ly將過濾器用于序列分析 —— 然后 OK退出參數(shù)對話框。你將注意到在圖上酶切位點(diǎn)的數(shù)目現(xiàn)在大大地減少了。 應(yīng)用手動過濾器 ,還可以挑選我們一些需要的酶，用來看看切割 TETHIS21序列的情況。 ? 從 MAP MENU選 Linear Minimap。 打開的窗口顯示每個限制酶切割位點(diǎn)的位置。 ? 從 ENZYME MENU， 選 New Filter—— 然后Manual Pick。 打開酶切位點(diǎn)過濾器編輯器。 ? 把 Apo I從右邊的窗口拖進(jìn)左邊的窗口。給過濾器取名。在這我們把過濾器叫做 “ Apo I.”。 ? 點(diǎn)擊 Apply—— 然后 OK， 就保存并應(yīng)用 “ Apo I.”過濾器了。 內(nèi)切酶編輯器（ Enzyme Editor） 使你能夠查看內(nèi)切酶的各種相關(guān)信息，包括其名字，識別序列， isoschisomers， 種類，價格，銷售公司和有效性等詳細(xì)的信息。你對這些信息可以進(jìn)行添加或刪除操作。 ? 打開酶編輯窗（如下），雙擊任意一個酶的名字。 ? 箭頭顯示酶識別序列和切割位點(diǎn)。 ? 你可以按照 “ GeneQuest”上的方法在序列上添加新 Feature， 并作注釋。 ? 從 MAP MENU， 選擇 Circular Illustration，打開左邊的窗口。（如果此時有太多的酶切位點(diǎn)，你可以加入其他的過濾器）。 ? 通過 OPTIONS MENU的 Drawing Size調(diào)整圖畫的大小。 2條紅線相會的角是你可以做的最小圖畫的范圍。在窗口內(nèi)點(diǎn)擊任何位置，圖形大小將顯示為那么大。 ? 單擊同意。 ? 從 MAP MENU， 選 ORF Map打開右邊顯示的六讀框的開放讀框窗口。默認(rèn)的終止和開始 codons可以使用指定的遺傳密碼。方法見 EditSeq。 ? 從 OPTIONS MENU中選擇 ORF Criteria可以設(shè)定參數(shù)。你能調(diào)整最小的 ORF長度，定義上游啟動子和距上游啟動子的距離，選定后單擊同意即可。 ? 放大 ORF以查看翻譯的序列。方法是點(diǎn)擊調(diào)色板工具中 Zoom In（ 有＋的圖標(biāo)），接著，單擊分析界面。重復(fù)這些 2步直到你能看翻譯。 ? 從編輯菜單（ EDIT MENU）， 選保存地圖（ Save Map）。 ? 選擇保存位置，命名。 ? 單擊保存（蘋果計算機(jī)）或同意（視窗）。 ? 從文件菜單（ FILE MEN）， 選擇放棄（蘋果計算機(jī)）或者退出（視窗），電腦提示保存或放棄；選擇保存，則你操作的所有結(jié)果都會保存起來，否則結(jié)果會全部丟失。 四、 DNastar軟件的安裝 使用說明： 1. 將所有文件拷貝到硬盤上臨時建立的文件夾中。 2. 運(yùn)行其中的 ， 將壓縮文件恢復(fù)為正常文件。 3. 運(yùn)行 ， 在打開的文件夾中運(yùn)行 setup， 完成安裝。 4. 安裝結(jié)束后，打開 C盤 \Program Files\Dnastar文件夾。 5. 將臨時文件夾中的應(yīng)用程序 Seqman，GeneQuest， Mapdraw逐個拷貝到Program Files\Dnastar中的相應(yīng)文件夾中，覆蓋原來的應(yīng)用程序。 6. 在“開始”菜單中選擇運(yùn)行相應(yīng)的應(yīng)用程序。 五、相關(guān)資料下載地址 ? DNastar軟件： 1） FTP（ 匿名進(jìn)入） —— 基礎(chǔ)部 —— 微生物教研室 —— 朱軍民 —— 生物信息學(xué) —— DNastar軟件 2）部門網(wǎng)站 —— 微生物 —— 軟件天地 —— 生化軟件 ? 分析序列： 1） FTP—— 基礎(chǔ)部 —— 微生物教研室 —— 朱軍民 ——— 生物信息學(xué) — 2） 部門網(wǎng)站 —— 微生物 —— 軟件天地 —— 生化軟件 六、其他 ? DNAStar軟件網(wǎng)址：p ? 本人的幻燈資料：部門網(wǎng)站 —— 微生物 —— 教案資料 —— 朱軍民 ? 聯(lián)系方法：部門網(wǎng)站 —— 微生物 —— 微生物論壇留言
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