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正文內(nèi)容

第三節(jié)代謝網(wǎng)絡(luò)中碳架物質(zhì)流的調(diào)動(dòng)(編輯修改稿)

2024-08-28 12:55 本頁面
 

【文章內(nèi)容簡(jiǎn)介】 ADH不能通過電子傳遞鏈而再生成 NAD+, 只好將電子交給內(nèi)源的有機(jī)化合物乙醛,將乙醛還原成乙醇,從而實(shí)現(xiàn)還原力的平衡。從而導(dǎo)致生成乙醇的溢出代謝。 由此可見,乙醇的溢出代謝實(shí)際上是細(xì)胞內(nèi)生物氧化過程中形成的還原力相對(duì)于電子傳遞鏈的呼吸能力的溢出,推動(dòng)了乙醛還原生成乙醇的發(fā)酵過程。 2022/8/17 張星元:發(fā)酵原理 46 從以上實(shí)例可以看到,溢出代謝的發(fā)生,不但要求微生物本身具有相應(yīng)的遺傳根據(jù),還必須具備相應(yīng)的環(huán)境條件。 對(duì)于工業(yè)發(fā)酵來說,就是特定的生產(chǎn)菌種和與其對(duì)應(yīng)的生產(chǎn)工藝條件。 2022/8/17 張星元:發(fā)酵原理 47 代謝流“治理”的可能性和 現(xiàn)實(shí)性 代謝流具有流體流動(dòng)的基本屬性,因此具有“治理”的可能性;微生物代謝的變動(dòng)性和微生物遺傳的保守性,加上人的主觀能動(dòng)性,能使可能變?yōu)楝F(xiàn)實(shí)。 本課程主要討論初級(jí)代謝產(chǎn)物的過量合成,兼顧次級(jí)代謝產(chǎn)物的合成。 2022/8/17 張星元:發(fā)酵原理 48 現(xiàn)代發(fā)酵工程依靠微生物活細(xì)胞來完成發(fā)酵工廠生產(chǎn)線上不可缺少的加工(或轉(zhuǎn)化)步驟,在這個(gè)意義上, 微生物活細(xì)胞就是工業(yè)發(fā)酵生產(chǎn)線上不可缺少的微生物生物機(jī)器(或稱細(xì)胞機(jī)器) ,是發(fā)酵工廠里關(guān)鍵的生產(chǎn)機(jī)器。 2022/8/17 張星元:發(fā)酵原理 49 細(xì)胞機(jī)器與普通意義上的機(jī)器不同,它們 必須由代謝能 ( metabolic energy) 直接驅(qū)動(dòng) 。在發(fā)酵工廠的生產(chǎn)線上,微生物必須完成微生物細(xì)胞機(jī)器的 在線制造(細(xì)胞增殖)和生產(chǎn)運(yùn)行(目的產(chǎn)物的合成和輸出)的雙重任務(wù)。 2022/8/17 張星元:發(fā)酵原理 50 根據(jù)工業(yè)發(fā)酵的現(xiàn)狀, 把依靠化能異養(yǎng)型微生物合成某最終被分泌到胞外的初級(jí)代謝產(chǎn)物的過程,作為工業(yè)發(fā)酵的典型過程來研究,并把代謝研究的重點(diǎn)放在碳的代謝上。 從而建立了 生物機(jī)器 (又稱 細(xì)胞機(jī)器 )工作的基本模式。在此 工作模式 的基礎(chǔ)上,提出了工業(yè)發(fā)酵中微生物代謝的 五段式 和初級(jí)代謝產(chǎn)物的過量合成的 五字策略 。 2022/8/17 張星元:發(fā)酵原理 51 在物競(jìng)天擇的基礎(chǔ)上建立的細(xì)胞經(jīng)濟(jì)體系已經(jīng)經(jīng)受長(zhǎng)期的實(shí)踐檢驗(yàn),并已成為微生物細(xì)胞生命活動(dòng)的保障體系。微生物通過生存競(jìng)爭(zhēng)而獲得的一整套自我調(diào)節(jié)機(jī)制,原本服務(wù)于微生物的自然競(jìng)爭(zhēng)和生命保障,因此它不會(huì)大量的合成維持自我生存之外的代謝產(chǎn)物。而人類因自我發(fā)展的需要,卻希望微生物能夠大量地合成能滿足人類需求為目的產(chǎn)物(微生物的代謝產(chǎn)物)。 2022/8/17 張星元:發(fā)酵原理 52 微生物代謝產(chǎn)物的生物合成是系統(tǒng)工程,要完成這一類系統(tǒng)工程,必須依靠微生物的高度有序的生命活動(dòng),決不是打亂它,而是在可能的范圍內(nèi)對(duì)它進(jìn)行有效的引導(dǎo)。 工業(yè)發(fā)酵呼喚人與微生物的合作,而在合作中,人處于主導(dǎo)的地位,人應(yīng)該發(fā)揮主觀能動(dòng)作用。 2022/8/17 張星元:發(fā)酵原理 53 ⑴ 初級(jí)代謝產(chǎn)物的合成 初級(jí)代謝產(chǎn)物是指這樣一些低分子質(zhì)量的合成途徑的終產(chǎn)物,它們 是構(gòu)建生物大分子的分子模塊 ,是微生物營(yíng)養(yǎng)性生長(zhǎng)所必需的生長(zhǎng)因子,如氨基酸、嘌呤和嘧啶的核苷與核苷酸以及維生素。 2022/8/17 張星元:發(fā)酵原理 54 初級(jí)代謝產(chǎn)物都是從中心代謝途徑的中間產(chǎn)物( 12種前體代謝物)開始合成的。 因?yàn)樗鼈兌际俏⑸餇I(yíng)養(yǎng)性生長(zhǎng)所必需的,除了遺傳上有缺陷的菌株外,微生物細(xì)胞具有齊全的初級(jí)代謝途徑基因,也就是說 在合適的環(huán)境條件下它們的初級(jí)代謝途徑是普遍存在的 。初級(jí)途徑上的酶的特異性比次級(jí)代謝的酶的特異性要高。 2022/8/17 張星元:發(fā)酵原理 55 各種微生物的初級(jí)代謝產(chǎn)物的合成途徑基本相同,在同一屬微生物中,初級(jí)代謝產(chǎn)物合成途徑的差異是十分罕見的,但在合成的調(diào)節(jié)機(jī)制上有較大的差異。 初級(jí)代謝產(chǎn)物合成的途徑是穩(wěn)定的,不同微生物物種的調(diào)節(jié)機(jī)制是可以弄清楚或基本弄清楚的,這就是對(duì)這種合成代謝流“治理”的基礎(chǔ)。 這種“治理”要用到遺傳手段( 遺傳脫鉤 ),并輔之以培養(yǎng)條件的優(yōu)化( 環(huán)境協(xié)調(diào) ),以求達(dá)到 初級(jí)代謝產(chǎn)物過量合成的目的。 2022/8/17 張星元:發(fā)酵原理 56 Ⅰ . 初級(jí)代謝產(chǎn)物過量合成的五字策略 在分析細(xì)胞機(jī)器的生產(chǎn)運(yùn)行時(shí),可把它看作是分步進(jìn)行的過程。首先細(xì)胞外的營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)從環(huán)境(培養(yǎng)基)跨膜進(jìn)入細(xì)胞;然后,一般要經(jīng)過向心、中心和離心 3 段連續(xù)的代謝途徑的代謝,才能在胞內(nèi)生成目的產(chǎn)物;最后,目的產(chǎn)物經(jīng)過膜排出細(xì)胞,回到環(huán)境(發(fā)酵醪液)。 2022/8/17 張星元:發(fā)酵原理 57 “載流途徑”泛指承載代謝物流的代謝途徑。 “載流路徑” 泛指由不止一條載流途徑按序首尾銜接而組成的代謝通道。 在發(fā)酵工程領(lǐng)域, “載流路徑”作為發(fā)酵工程的專用術(shù)語,被定義為從主要有機(jī)原料到目的產(chǎn)物一組載流途徑的有序組合。 2022/8/17 張星元:發(fā)酵原理 58 典型的 載流路徑 是指存在于代謝網(wǎng)絡(luò)中的這樣的代謝通道,即 由多至五段承擔(dān)不同代謝分工的、依次銜接的代謝途徑組成的代謝通道。 因此有 載流路徑的五段式 之稱。在這條載流路徑上流動(dòng)的代謝主流對(duì)應(yīng)地也有五段,從而派生出 代謝主流的五段式 。載流途徑的五段式和代謝主流的五段式統(tǒng)稱為 微生物代謝的五段式 。 2022/8/17 張星元:發(fā)酵原理 59 在此五段式的基礎(chǔ)上,從不同的角度出發(fā),提出能作為一個(gè)整體,用于設(shè)計(jì)育種以及發(fā)酵工藝控制的五字策略(簡(jiǎn)稱 工業(yè)發(fā)酵的五字策略 ):進(jìn)、通、節(jié)、堵、出?!? 五字策略 ” 就是從合作的良好愿望出發(fā),發(fā)揮人的主觀能動(dòng)作用,主動(dòng)與微生物合作實(shí)現(xiàn)工業(yè)發(fā)酵效益的策略。這個(gè)策略來自初級(jí)代謝產(chǎn)物過量合成的研究,故實(shí)際上是 初級(jí)代謝產(chǎn)物過量合成的五字策略 。 2022/8/17 張星元:發(fā)酵原理 60 N P P 進(jìn) 出 通 節(jié) 堵 工業(yè)發(fā)酵的“五字策略” 2022/8/17 張星元:發(fā)酵原理 61 高產(chǎn)菌種的代謝特征:不同來源的碳架物質(zhì)暢通地“注入”載流路徑,高速生成并順利釋出目的產(chǎn)物,如下圖。 2022/8/17 張星元:發(fā)酵原理 62 進(jìn) :在育種和發(fā)酵控制方面都要促進(jìn)細(xì)胞對(duì)營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的吸收。在發(fā)酵過程中,一般都希望菌體能迅速達(dá)到一定的濃度,因此,就必需選用生長(zhǎng)旺盛的菌株,這類菌株吸收營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的能力往往也較強(qiáng)。同時(shí)要選擇適當(dāng)?shù)娜菀孜盏呐囵B(yǎng)基,和適宜的培養(yǎng)條件,以促進(jìn)微生物的生長(zhǎng)。為了消除底物在培養(yǎng)過程中的抑制作用,有的還采用流加的培養(yǎng)方法。為了促進(jìn)微生物的生長(zhǎng)和支持目的產(chǎn)物的合成,還要從代謝生理學(xué)的角度優(yōu)化流加條件。 2022/8/17 張星元:發(fā)酵原理 63 通 :在育種方面,解除對(duì)途徑中某些酶的反饋調(diào)節(jié);在發(fā)酵控制方面,誘導(dǎo)這些酶的合成或激活這些酶,從而使來自各代謝物流(除碳架物流外還包括其他支持生物合成的物流)能夠暢通地注入載流路徑,匯入代謝主流,流向目的產(chǎn)物。特別是當(dāng)發(fā)酵進(jìn)入目的產(chǎn)物合成階段后,必需確保載流路徑暢通,代謝主流優(yōu)勢(shì)明顯。 2022/8/17 張星元:發(fā)酵原理 64 這些酶包括用于目的產(chǎn)物自身合成的酶(如下圖中酶①~⑤)和用于目的產(chǎn)物的前體合成的酶( 如下圖中酶和⑥,用于前體 C的合成,酶⑦⑧,用于前體 D的合成)。 2022/8/17 張星元:發(fā)酵原理 65 例如在谷氨酸的發(fā)酵過程中,作為谷氨酸合成原料的 NH4+ 的缺乏, 就可能使谷氨酸合成途徑的中斷,導(dǎo)致谷氨酸產(chǎn)量下降,大量 α酮戊二酸積累。當(dāng)然,合成途徑中的任何一個(gè)限制因子,都可能產(chǎn)生類似的情況。因此,在發(fā)酵過程中應(yīng)盡可能的使通向載流路徑的代謝途徑暢通無阻,使不同的營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)能順利地注入代謝主流,最終流向目的產(chǎn)物。 2022/8/17 張星元:發(fā)酵原理 66 節(jié) :采用育種或發(fā)酵控制手段,節(jié)制載流路徑上與目的產(chǎn)物的形成無關(guān)或關(guān)系不大的代謝支流,使碳架物質(zhì)相對(duì)集中地流向目的產(chǎn)物。這里所謂的 “ 節(jié)制 ” 是指封閉或削弱以目的產(chǎn)物合成途徑的起始底物(如下圖中的
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