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正文內(nèi)容

生物化學(xué)重點(diǎn)分享(編輯修改稿)

2025-07-04 21:15 本頁面
 

【文章內(nèi)容簡介】 形成共價鍵,然后被轉(zhuǎn)移給第二個底物。許多酶催化的基團(tuán)轉(zhuǎn)移反應(yīng)都是通過共價方式進(jìn)行的??拷?yīng)(proximity effect):非酶促催化反應(yīng)或酶促反應(yīng)速度的增加是由于底物靠近活性部位,使得活性部位處反應(yīng)劑有效濃度增大的結(jié)果,這將導(dǎo)致更頻繁地形成過度態(tài)。初速度(initial velocity):酶促反應(yīng)最初階段底物轉(zhuǎn)化為產(chǎn)物的速度,這一階段產(chǎn)物的濃度非常低,其逆反應(yīng)可以忽略不計(jì)。米氏方程(MichaelisMentent equation):表示一個酶促反應(yīng)的起始速度(υ)與底物濃度([s])關(guān)系的速度方程:υ=υmax[s]/(Km+[s])米氏常數(shù)(Michaelis constant):對于一個給定的反應(yīng),異至酶促反應(yīng)的起始速度(υ0)達(dá)到最大反應(yīng)速度(υmax)一半時的底物濃度。催化常數(shù)(catalytic number)(Kcat):也稱為轉(zhuǎn)換數(shù)。是一個動力學(xué)常數(shù),是在底物處于飽和狀態(tài)下一個酶(或一個酶活性部位)催化一個反應(yīng)有多快的測量。催化常數(shù)等于最大反應(yīng)速度除以總的酶濃度(υmax/[E]total)。或是每摩酶活性部位每秒鐘轉(zhuǎn)化為產(chǎn)物的底物的量(摩[爾])。雙倒數(shù)作圖(doublereciprocal plot):那稱為Lineweaver_Burk作圖。一個酶促反應(yīng)的速度的倒數(shù)(1/V)對底物度的倒數(shù)(1/LSF)的作圖。x和y軸上的截距分別代表米氏常數(shù)和最大反應(yīng)速度的倒數(shù)。競爭性抑制作用(petitive inhibition):通過增加底物濃度可以逆轉(zhuǎn)的一種酶抑制類型。競爭性抑制劑通常與正常的底物或配體競爭同一個蛋白質(zhì)的結(jié)合部位。這種抑制使Km增大而υmax不變。非競爭性抑制作用(nonpetitive inhibition): 抑制劑不僅與游離酶結(jié)合,也可以與酶底物復(fù)合物結(jié)合的一種酶促反應(yīng)抑制作用。這種抑制使Km不變而υmax變小。反競爭性抑制作用(unpetitive inhibition): 抑制劑只與酶底物復(fù)合物結(jié)合而不與游離的酶結(jié)合的一種酶促反應(yīng)抑制作用。這種抑制使Km和υmax都變小但υmax/Km不變。絲氨酸蛋白酶(serine protease): 活性部位含有在催化期間起親核作用的絲氨殘基的蛋白質(zhì)。酶原(zymogen):通過有限蛋白水解,能夠由無活性變成具有催化活性的酶前體。調(diào)節(jié)酶(regulatory enzyme):位于一個或多個代謝途徑內(nèi)的一個關(guān)鍵部位的酶,它的活性根據(jù)代謝的需要而增加或降低。別構(gòu)酶(allosteric enzyme):活性受結(jié)合在活性部位以外的部位的其它分子調(diào)節(jié)的酶。別構(gòu)調(diào)節(jié)劑(allosteric modulator):結(jié)合在別構(gòu)調(diào)節(jié)酶的調(diào)節(jié)部位調(diào)節(jié)該酶催化活性的生物分子,別構(gòu)調(diào)節(jié)劑可以是激活劑,也可以是抑制劑。齊變模式(concerted model):相同配體與寡聚蛋白協(xié)同結(jié)合的一種模式,按照最簡單的齊變模式,由于一個底物或別構(gòu)調(diào)節(jié)劑的結(jié)合,蛋白質(zhì)的構(gòu)相在T(對底物親和性低的構(gòu)象)和R(對底物親和性高的構(gòu)象)之間變換。這一模式提出所有蛋白質(zhì)的亞基都具有相同的構(gòu)象,或是T構(gòu)象,或是R構(gòu)象。序變模式(sequential model):相同配體與寡聚蛋白協(xié)同結(jié)合的另外一種模式。按照最簡單的序變模式,一個配體的結(jié)合會誘導(dǎo)它結(jié)合的亞基的三級結(jié)構(gòu)的變化,并使相鄰亞基的構(gòu)象發(fā)生很大的變化。按照序變模式,只有一個亞基對配體具有高的親和力。同功酶(isoenzyme isozyme):催化同一化學(xué)反應(yīng)而化學(xué)組成不同的一組酶。它們彼此在氨基酸序列,底物的親和性等方面都存在著差異。別構(gòu)調(diào)節(jié)酶(allosteric modulator):那稱為別構(gòu)效應(yīng)物。結(jié)合在別構(gòu)酶的調(diào)節(jié)部位,調(diào)節(jié)酶催化活性的生物分子。別構(gòu)調(diào)節(jié)物可以是是激活劑,也可以是抑制劑。第六章 核 酸本 章 名 詞 解 釋 核苷(nucleoside):是嘌呤或嘧啶堿通過共價鍵與戊糖連接組成的化合物。核糖與堿基一般都是由糖的異頭碳與嘧啶的N1或嘌呤的N9之間形成的βN糖鍵連接。核苷酸(uncleoside):核苷的戊糖成分中的羥基磷酸化形成的化合物。cAMP(cycle AMP):3ˊ,5ˊ環(huán)腺苷酸,是細(xì)胞內(nèi)的第二信使,由于某部些激素或其它分子信號刺激激活腺苷酸環(huán)化酶催化ATP環(huán)化形成的。磷酸二脂鍵(phosphodiester linkage):一種化學(xué)基團(tuán),指一分子磷酸與兩個醇(羥基)酯化形成的兩個酯鍵。該酯鍵成了兩個醇之間的橋梁。例如一個核苷的3ˊ羥基與別一個核苷的5ˊ羥基與同一分子磷酸酯化,就形成了一個磷酸二脂鍵。脫氧核糖核酸(DNA):含有特殊脫氧核糖核苷酸序列的聚脫氧核苷酸,脫氧核苷酸之間是是通過3ˊ,5ˊ磷酸二脂鍵連接的。DNA是遺傳信息的載體。核糖核酸(RNA):通過3ˊ,5ˊ磷酸二脂鍵連接形成的特殊核糖核苷酸序列的聚核糖核苷酸。核糖體核糖核酸(Rrna,ribonucleic acid):作為組成成分的一類 RNA,rRNA是細(xì)胞內(nèi)最 豐富的 RNA .信使核糖核酸(mRNA,messenger ribonucleic acid):一類用作蛋白質(zhì)合成模板的RNA .轉(zhuǎn)移核糖核酸(Trna,transfer ribonucleic acid):一類攜帶激活氨基酸,將它帶到蛋白質(zhì)合成部位并將氨基酸整合到生長著的肽鏈上RNA。TRNA含有能識別模板mRNA上互補(bǔ)密碼的反密碼。轉(zhuǎn)化(作用)(transformation):一個外源DNA 通過某種途徑導(dǎo)入一個宿主菌,引起該菌的遺傳特性改變的作用。轉(zhuǎn)導(dǎo)(作用)(transduction):借助于病毒載體,遺傳信息從一個細(xì)胞轉(zhuǎn)移到另一個細(xì)胞。堿基對(base pair):通過堿基之間氫鍵配對的核酸鏈中的兩個核苷酸,例如A與T或U , 以及G與C配對 。 夏格夫法則(Chargaff’s rules):所有DNA中腺嘌呤與胸腺嘧啶的摩爾含量相等(A=T),鳥嘌呤和胞嘧啶的摩爾含量相等(G=C),既嘌呤的總含量相等(A+G=T+C)。DNA的堿基組成具有種的特異性,但沒有組織和器官的特異性。另外,生長和發(fā)育階段`營養(yǎng)狀態(tài)和環(huán)境的改變都不影響DNA的堿基組成。DNA的雙螺旋(DNAdouble helix):一種核酸的構(gòu)象,在該構(gòu)象中,兩條反向平行的多核甘酸鏈相互纏繞形成一個右手的雙螺旋結(jié)構(gòu)。堿基位于雙螺旋內(nèi)側(cè),磷酸與糖基在外側(cè),通過磷酸二脂鍵相連,形成核酸的骨架。堿基平面與假象的中心軸垂直,糖環(huán)平面則與軸平行,兩條鏈皆為右手螺旋。雙螺旋的直徑為2nm, 兩核甘酸之間的夾角是36゜,每對螺旋由10對堿基組成,堿基按AT,GC配對互補(bǔ),彼此以氫鍵相聯(lián)系。維持DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定的力主要是堿基堆積力。雙螺旋表面有兩條寬窄`深淺不一的一個大溝和一個小溝。大溝(major groove)和小溝(minor groove):繞BDNA雙螺旋表面上出現(xiàn)的螺旋槽(溝),寬的溝稱為大溝,窄溝稱為小溝。大溝,小溝都、是由于堿基對堆積和糖磷酸骨架扭轉(zhuǎn)造成的。DNA超螺旋(DNAsupercoiling):DNA本身的卷曲一般是DNA雙`螺旋的彎曲欠旋(負(fù)超螺旋)或過旋(正超螺旋)的結(jié)果。拓?fù)洚悩?gòu)酶(topoisomerse):通過切斷DNA的一條或兩條鏈中的磷酸二酯鍵,然后重新纏繞和封口來改變DNA連環(huán)數(shù)的酶。拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅰ、通過切斷DNA中的一條鏈減少負(fù)超螺旋,增加一個連環(huán)數(shù)。某些拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅱ也稱為DNA促旋酶。核小體(nucleosome):用于包裝染色質(zhì)的結(jié)構(gòu)單位,是由DNA鏈纏繞一個組蛋白核構(gòu)成的。染色質(zhì)(chromatin): 是存在與真核生物間期細(xì)胞核內(nèi),易被堿性染料著色的一種無定形物質(zhì)。染色質(zhì)中含有作為骨架的完整的雙鏈DNA,以及組蛋白`非組蛋白和少量的DNA。染色體(chromosome):是染色質(zhì)在細(xì)胞分裂過程中經(jīng)過緊密纏繞`折疊`凝縮和精細(xì)包裝形成的具有固定形態(tài)的遺傳物質(zhì)存在形式。簡而言之,染色體是一個大的單一的雙鏈DNA分子與相關(guān)蛋白質(zhì)組成的復(fù)合物,DNA中含有許多貯存和傳遞遺傳信息的基因。DNA變性(DNAdenaturation):DNA雙鏈解鏈,分離成兩條單鏈的現(xiàn)象。退火(annealing):既DNA由單鏈復(fù)性、變成雙鏈結(jié)構(gòu)的過程。來源相同的DNA單鏈經(jīng)退火后完全恢復(fù)雙鏈結(jié)構(gòu)的過程,同源DNA之間`DNA和RNA之間,退火后形成雜交分子。熔解溫度(melting temperature,Tm):雙鏈DNA熔解徹底變成單鏈DNA的溫度范圍的中點(diǎn)溫度。增色效應(yīng)(hyperchromic effect):當(dāng)雙螺旋DNA熔解(解鏈)時,260nm處紫外吸收增加的現(xiàn)象。減色效應(yīng)(hypochromic effect):隨著核酸復(fù)性,紫外吸收降低的現(xiàn)象。核酸內(nèi)切酶(exonuclease): 核糖核酸酶和脫氧核糖核酸酶中能夠水解核酸分子內(nèi)磷酸二酯鍵的酶。核酸外切酶(exonuclease):從核酸鏈的一端逐個水解核甘酸的酶。限制性內(nèi)切酶(restriction endonuclease):一種在特殊核甘酸序列處水解雙鏈DNA的內(nèi)切酶。Ⅰ型限制性內(nèi)切酶既能催化宿主DNA的甲基化,又催化非甲基化的DNA的水解;而Ⅱ型限制性內(nèi)切酶只催化非甲基化的DNA的水解。限制酶圖譜(restriction map):同一DNA用不同的限制酶進(jìn)行切割,從而獲得各種限制酶的切割位點(diǎn),由此建立的位點(diǎn)圖譜有助于對DNA的結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析。反向重復(fù)序列(inverted repeat sequence):在同一多核甘酸內(nèi)的相反方向上存在的重復(fù)的核甘酸序列。在雙鏈DNA中反向重復(fù)可能引起十字形結(jié)構(gòu)的形成。重組DNA技術(shù)(rebination DNA technology):也稱之為基因工程(genomic engineering).利用限制性內(nèi)切酶和載體,按照預(yù)先設(shè)計(jì)的要求,將一種生物的某種目的基因和載體DNA重組后轉(zhuǎn)入另一生物細(xì)胞中進(jìn)行復(fù)制`轉(zhuǎn)錄和表達(dá)的技術(shù)?;颍╣ene):也稱為順反子(cistron).泛指被轉(zhuǎn)錄的一個DNA片段。在某些情況下,基因常用來指編碼一個功能蛋白或DNA分子的DNA片段。第七章 維生素第八章 抗生素第九章 激 素第十章 代謝總論本 章 名 詞 解 釋 分解代謝反應(yīng)(catabolic reaction):降解復(fù)雜分子為生物體提供小的構(gòu)件分子和能量代謝反應(yīng)。合成代謝反應(yīng)(anablic reaction):合成用于細(xì)胞維持和生長所需分子的代謝反應(yīng)。反饋抑制(feedback inbition):催化一個代謝途徑中前面反應(yīng)的酶受到同一途徑終產(chǎn)物抑制的現(xiàn)象前饋激活(feedforward activition):代謝途徑中一個酶被該途徑中前面產(chǎn)生的代謝物激活的現(xiàn)象。標(biāo)準(zhǔn)自由能變化(△GO):相應(yīng)于在一系列標(biāo)準(zhǔn)條件(溫度298K,壓力1atm(=),所有溶質(zhì)的濃度都是不是mol/L)下發(fā)生的反應(yīng)自由能變化。△GO′。標(biāo)準(zhǔn)還原電動勢(EO′):25℃,還原劑和它的氧化形式在1mol/L濃度下表現(xiàn)出的電動勢.第十一章 糖類代謝本 章 名 詞 解 釋 酵解(glycolysis):由10步酶促反應(yīng)組成的糖分解代謝途徑。通過該途徑,一分子葡萄糖轉(zhuǎn)化為兩分子丙酮酸,同時凈生成兩分子ATP和兩分子NADH。發(fā)酵(fermentation):營養(yǎng)分子(Eg葡萄糖)產(chǎn)能的厭氧降解。在乙醇發(fā)酵中,丙酮酸轉(zhuǎn)化為乙醇和CO2。巴斯德效應(yīng)(Pasteur effect):氧存在下,酵解速度放慢的現(xiàn)象。底物水平磷酸化(substrate phosphorlation):ADP或某些其它的核苷5′—二磷酸的磷酸化是通過來自一個非核苷酸底物的磷酰基的轉(zhuǎn)移實(shí)現(xiàn)的。這種磷酸化與電子的轉(zhuǎn)遞鏈無關(guān)。檸檬酸循環(huán)(citric acid cycle):也稱為三羧酸循環(huán)(TAC),Krebs循環(huán)。是用于乙酰CoA中的乙酰基氧化成CO2的酶促反應(yīng)的循環(huán)系統(tǒng),該循環(huán)的第一步是由乙酰CoA經(jīng)草酰乙酸縮合形成檸檬酸?;匮a(bǔ)反應(yīng)(anaplerotic reaction):酶催化的,補(bǔ)充檸檬酸循環(huán)中間代謝物供給的反應(yīng),例如由丙酮酸羧化酶生成草酰乙酸的反應(yīng)。乙醛酸循環(huán)(glyoxylate cycle):是某些植物,細(xì)菌和酵母中檸檬酸循環(huán)的修改形式,通過該循環(huán)可以收乙乙酰CoA經(jīng)草酰乙酸凈生成葡萄糖。乙醛酸循環(huán)繞過了檸檬酸循環(huán)中生成兩個CO2的步驟 戊糖磷酸途徑(pentose phosphare parhway):那
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