功能基因組學(xué)研究概述(編輯修改稿)
2025-06-10 23:39 本頁(yè)面
【文章內(nèi)容簡(jiǎn)介】 Unigene或 cluster的 EST片段歸類在一起 , 并初步拼接和校對(duì) 。 ③ 基于 GenBank完整 EST數(shù)據(jù)庫(kù)的 EST拼接、校對(duì)并盡可能延長(zhǎng)獲得的大片段或全長(zhǎng) cDNA, 稱為 Contig。 ④ Contig輸入 nr數(shù)據(jù)庫(kù)通過(guò) BLAST查新選留新穎 Contig。 ⑤ 再通過(guò) GenBank完整 EST數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)確定最終 cDNA Contig。 ⑥ 分析開(kāi)放閱讀碼框 (ORF)、 Kozak規(guī)則、加尾信號(hào)、多聚腺苷酸 (PolyA) 等 。 ⑦ 獲得新基因全序列 [包括內(nèi)含子 ( intron)和外顯子 (exon) 序列 ], 定位于染色體上并作圖。 3. 功能基因組學(xué)研究的內(nèi)容及策略 ? （基因結(jié)構(gòu)及編碼產(chǎn)物功能預(yù)測(cè) ) ? : ① 對(duì)編碼區(qū)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)特性分析 ②啟動(dòng)子分析 啟動(dòng)子是基因表達(dá)所必需的重要序列信號(hào) , 識(shí)別出啟動(dòng)子對(duì)認(rèn)識(shí)基因組功能、基因表達(dá)調(diào)控機(jī)制以及人類疾病與啟動(dòng)子多態(tài)性或突變有很大的幫助。 ③內(nèi)含子 /外顯子剪接位點(diǎn) (GT/AG規(guī)則 ) ④ 翻譯起始位點(diǎn)（ “ Kozak規(guī)則 ” ） ⑤翻譯終止信號(hào) 3. 功能基因組學(xué)研究的內(nèi)容及策略 ? （基因結(jié)構(gòu)及編碼產(chǎn)物功能預(yù)測(cè) ) ? :序列同源比較 :主要方法有 同源檢索(NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)的 Blastn)和 多序列對(duì)齊 (multiple sequence alignment,MSA) ? ： 從氨基酸組成辨識(shí)蛋白質(zhì) 、 蛋白質(zhì)物理性質(zhì)預(yù)測(cè) (如等電點(diǎn)、分子量、酶切特性、疏水性等 )。 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè) （蛋白質(zhì)二、三級(jí)結(jié)構(gòu)及特殊結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)）、 蛋白質(zhì)功能的預(yù)測(cè) （通過(guò)相似序列的數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)確定功能、確定序列特性、通過(guò)序列模體數(shù)據(jù)庫(kù)等的比對(duì)確定功能） 3. 功能基因組學(xué)研究的內(nèi)容及策略
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