功能基因組學研究概述(編輯修改稿)
2025-06-10 23:39 本頁面
【文章內(nèi)容簡介】 Unigene或 cluster的 EST片段歸類在一起 , 并初步拼接和校對 。 ③ 基于 GenBank完整 EST數(shù)據(jù)庫的 EST拼接、校對并盡可能延長獲得的大片段或全長 cDNA, 稱為 Contig。 ④ Contig輸入 nr數(shù)據(jù)庫通過 BLAST查新選留新穎 Contig。 ⑤ 再通過 GenBank完整 EST數(shù)據(jù)庫比對確定最終 cDNA Contig。 ⑥ 分析開放閱讀碼框 (ORF)、 Kozak規(guī)則、加尾信號、多聚腺苷酸 (PolyA) 等 。 ⑦ 獲得新基因全序列 [包括內(nèi)含子 ( intron)和外顯子 (exon) 序列 ], 定位于染色體上并作圖。 3. 功能基因組學研究的內(nèi)容及策略 ? （基因結(jié)構(gòu)及編碼產(chǎn)物功能預(yù)測 ) ? : ① 對編碼區(qū)進行統(tǒng)計特性分析 ②啟動子分析 啟動子是基因表達所必需的重要序列信號 , 識別出啟動子對認識基因組功能、基因表達調(diào)控機制以及人類疾病與啟動子多態(tài)性或突變有很大的幫助。 ③內(nèi)含子 /外顯子剪接位點 (GT/AG規(guī)則 ) ④ 翻譯起始位點（ “ Kozak規(guī)則 ” ） ⑤翻譯終止信號 3. 功能基因組學研究的內(nèi)容及策略 ? （基因結(jié)構(gòu)及編碼產(chǎn)物功能預(yù)測 ) ? :序列同源比較 :主要方法有 同源檢索(NCBI數(shù)據(jù)庫的 Blastn)和 多序列對齊 (multiple sequence alignment,MSA) ? ： 從氨基酸組成辨識蛋白質(zhì) 、 蛋白質(zhì)物理性質(zhì)預(yù)測 (如等電點、分子量、酶切特性、疏水性等 )。 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測 （蛋白質(zhì)二、三級結(jié)構(gòu)及特殊結(jié)構(gòu)預(yù)測）、 蛋白質(zhì)功能的預(yù)測 （通過相似序列的數(shù)據(jù)庫比對確定功能、確定序列特性、通過序列模體數(shù)據(jù)庫等的比對確定功能） 3. 功能基因組學研究的內(nèi)容及策略
語文相關(guān)推薦
鄂ICP備17016276號-1