基因組學二趙利峰ppt課件(編輯修改稿)
2025-05-25 22:56 本頁面
【文章內(nèi)容簡介】 離的頻率要小。 ? 重組率則可成為測量基因之間相對距離的尺度，只要獲得不同基因之間的重組率，就可繪制一份基因位于染色體上相對位臵的地理圖。 27 由重組率繪制遺傳圖 28 1. 部分連鎖與遺傳作圖 ? 構(gòu)建遺傳圖譜的基本原理 真核生物遺傳過程中會發(fā)生減數(shù)分裂，此過程中染色體要進行重組和交換，這種重組和交換的概率會隨著染色體上任意兩點間相對距離的遠近而發(fā)生相應(yīng)的變化。根據(jù)概率大小，人們就可以推斷出同一條染色體上兩點間的相對距離和位臵關(guān)系。正因為如此，我們得到的這張圖譜也就只能顯示標記之間的相對距離。我們稱這一距離 (概率 )為遺傳距離 (cM)，由此構(gòu)建的圖譜也稱為遺傳圖譜。 29 ? 連鎖遺傳圖的做法 ? 一般以最左端的基因位臵為 0，如發(fā)現(xiàn)有新的基因在更左端的位臵時，把 0點讓給新基因，其余的基因座位作相應(yīng)移動。 ? 重組率在 050%之間，但圖譜上出現(xiàn) 50以上的圖距。這是由于較遠的兩基因之間發(fā)生偶數(shù)次交換，但沒有出現(xiàn)重組類型，所以交換值要大于重組率。繪制連鎖遺傳圖時，需根據(jù)重組率進行圖距的校正。 30 遺傳圖的偏離 遺傳圖偏離的原因： 重組熱點：染色體某些位點之間比其他位點 之間有更高的交換頻率。 同一染色單體發(fā)生多次交換，會產(chǎn)生距離減 少的假像。 31 2. 不同模式生物的連鎖分析 ? 有性雜交實驗 ? 系譜分析 ? DNA轉(zhuǎn)移 32 ? 雜交實驗的連鎖分析 : ? 選擇已知基因型的親本，設(shè)計雜交方案，獲得交配的子代并分析其表型和基因型。 ? 對于高等真核生物的常規(guī)連鎖分析并不是直接檢查配子，而是檢測分別來自兩個親本配子融合形成的二倍體基因型，即進行遺傳雜交。 ? 兩點雜交和多點雜交 也稱兩因子雜交、多因子雜交。 33 ? 系譜分析 ? 系譜分析法即對某家庭性狀相關(guān)成員進行統(tǒng)計，分析性狀之間的連鎖關(guān)系，通過重組率進行相關(guān)基因定位，這種方法又稱 家系分析法 (pedigree method) 。 ? 不能進行有計劃的遺傳實驗，只能收集家系成員的相關(guān)資料進行連鎖分析，主要涉及人類和多年生樹木。 ? 優(yōu)勢對數(shù)值（ lod score）分析： lod值是基因連鎖可能性的對數(shù)，用于判定所研究的兩個標記是否在同一染色體上，換句話說就是基因是否連鎖。如果優(yōu)勢對數(shù)分析確定了連鎖，然后可以提供最可能的重組頻率程度。理想的情況是資料來自不同系譜。 34 ? 細菌的遺傳作圖 ? 轉(zhuǎn)化（ transformation ）： 供體細胞釋放的一段 DNA（通常小于 50kb），經(jīng)受體細胞攝取后整合到基因組中，可借助抗性培養(yǎng)基篩選重組克隆。 ? 轉(zhuǎn)導（ transduction)： 通過噬菌體將小片段DNA從供體細胞轉(zhuǎn)移到受體細胞。 ? 接合轉(zhuǎn)移 (conjugation)： 兩個細菌形成物理接觸， DNA從供體轉(zhuǎn)移到受體。 35 細菌的遺傳重組 36 ? 細菌遺傳作圖中采用的都是 生化標記 （如合成色氨酸的能力、對抗生素的敏感性等），隱性表型（如不能合成色氨酸）是可以互補的性狀。 ? 基因轉(zhuǎn)移在具有 野生 型等位基因的 供體 品系與具有 隱性 等位基因的 受體 品系之間進行，根據(jù)受體細胞是否獲得基因指令的生化功能來監(jiān)測轉(zhuǎn)移的DNA是否進入受體細胞。 ? 接合：根據(jù)野生型基因進入受體的時間表，可以確定基因所在的位置。 ? 轉(zhuǎn)導及轉(zhuǎn)化：依據(jù)所研究的基因是否同時出現(xiàn)在受體細胞中，緊密連鎖的基因總是有最高的機率被同時轉(zhuǎn)移。 37 RFLP連鎖圖 ? 限制性片段多態(tài)性（ RFLP） 是第一種用于研究的DNA標記（ David Bostein， 1980）。 ? 基本設(shè)想： 由于同源染色體同一區(qū)段 DNA順序的差異，用限制酶消化時，會得到長度各不相同的限制性片段。經(jīng)過瓊脂糖凝膠電泳分離，可直接顯示不同個體同一位點 DNA組成的差異。 ? 由于限制酶的專一性，用不同的限制酶處理同一DNA樣品時，可以產(chǎn)生與之對應(yīng)的不同限制性片斷，從而提供大量位點多態(tài)性信息。 38 DNA限制酶分析 39 ? 親本： A1/B1和 A2/B2，個體 231；新組合： A1/B2和A2/B1，個體 39。 ? 交換率： 39/（ 231+39） =14%； A與 B相距 14cM。 40 RFLP連鎖圖 ? 左圖表示三個世代限制圖譜之間的血緣關(guān)系，其 限制片段長度多態(tài)性 (RFLP)可以按孟德爾方式遺傳，四
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