功能基因組學(xué)研究概述-閱讀頁
2025-05-29 23:39本頁面
【正文】 功能獲得 （基因轉(zhuǎn)染和轉(zhuǎn)基因）研究、 ? 功能失活 （基因沉默和基因敲除）研究、 ? 基因編碼產(chǎn)物相互作用蛋白的研究 （免疫共沉淀和酵母雙雜交） ? 基因多樣性研究 （ SNPs分析）等。 ① 從數(shù)據(jù)庫或 PubMed尋找感興趣的 cDNA或氨基酸序列 。 ③ 基于 GenBank完整 EST數(shù)據(jù)庫的 EST拼接、校對并盡可能延長獲得的大片段或全長 cDNA, 稱為 Contig。 ⑤ 再通過 GenBank完整 EST數(shù)據(jù)庫比對確定最終 cDNA Contig。 ⑦ 獲得新基因全序列 [包括內(nèi)含子 ( intron)和外顯子 (exon) 序列 ], 定位于染色體上并作圖。 ③內(nèi)含子 /外顯子剪接位點(diǎn) (GT/AG規(guī)則 ) ④ 翻譯起始位點(diǎn)（ “ Kozak規(guī)則 ” ） ⑤翻譯終止信號 3. 功能基因組學(xué)研究的內(nèi)容及策略 ? （基因結(jié)構(gòu)及編碼產(chǎn)物功能預(yù)測 ) ? :序列同源比較 :主要方法有 同源檢索(NCBI數(shù)據(jù)庫的 Blastn)和 多序列對齊 (multiple sequence alignment,MSA) ? ： 從氨基酸組成辨識蛋白質(zhì) 、 蛋白質(zhì)物理性質(zhì)預(yù)測 (如等電點(diǎn)、分子量、酶切特性、疏水性等 )。新基因在某一特定的正常組織細(xì)胞中的表達(dá)水平高往往提示其在其中發(fā)揮著重要作用 。 SNP (Single Nucleotide Polymorphism)即單核苷酸多態(tài)性， 是由于單個(gè)核苷酸改變而導(dǎo)致的核酸序列多態(tài)性。 的內(nèi)容及策略 ? 由于部分位于基因內(nèi)部的 SNP可能會(huì)直接影響產(chǎn)物蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)或基因表達(dá)水平，因此，侯選基因 SNPs的檢測與基因功能的鑒定密切相關(guān)，屬于基因功能鑒定的一個(gè)非常重要內(nèi)容?；?SNPs與經(jīng)濟(jì)性狀關(guān)聯(lián)分析的結(jié)果又可進(jìn)一步印證基因的生
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