動物基因組學基礎ppt課件-閱讀頁
2025-02-01 16:25本頁面
【正文】 tu hybridization,FISH) ? 通過熒光標記的探針與 DNA分子雜交，雜交信號即探針 DNA在染色體上的圖譜位點 ? 步驟：取處于有絲分裂中期的細胞制片，將染色體變性成單鏈，再將標記的 DNA探針變性后雜交到染色體上，保溫處理后，顯微鏡下直接觀察 3） 序列標簽位點 (sequenctagged site， STS) ?STS是一段短的 DNA序列（ 100— 500） bp ? 每個基因組只有一個拷貝 ? 通過 PCR或分子雜交將小段 DNA定位在基因組的 DNA區(qū)段中 STS作圖原理： ? 當兩個片段含有同一STS時，可確認這兩個片段重疊 ? 兩個不同的 STS出現(xiàn)在同一片段的機會取決于它們在基因組中的位置，彼此接近，同時出現(xiàn)在同一片段的機會就大，反之則小 ? 兩個標記間的圖距根據(jù)分離頻率來計算 圖 用 STS標簽技術制作基因組的物理圖 常用的兩大類型： ? 表達的序列標簽（ expressed sequence tag,EST),該序列來自 序后經(jīng)比較分析，其非重復序列可作為 STS DNA片段 ? 輻射雜交系：嚙齒類動物細胞中含有另一個生物染色體片段的細胞株 人類基因組物理圖 ? 1987年， RFLP圖譜， 403個標記， 10Mb ? 1994年， 5800個標記， ? 1996年， 17000多個標記， 100kb ? 完全適應全基因組測序的要求 遺傳圖與物理圖的整合 ? 有些標記既是遺傳標記，又是物理標記 RFLP標記 SSR標記 某些基因序列 ? 借助這些標記可以將遺傳圖和物理圖整合起來 酵母遺傳圖與物理圖比較 A 遺傳圖 B 物理圖 三、轉錄圖 ? 人類的基因轉錄圖（ expression profiling）（ cDNA圖），或者基因的 cDNA片段圖，即表達序列標簽圖（ EST， expressed sequence tag）是人類基因組圖的雛形 ? 分離純化 mRNA（或 cDNA），就是抓住了基因組的主要成分（可轉錄部分） ? 人類基因組中，只有 1%5%的序列編碼了蛋白質，最多可能有 57萬個蛋白質編碼基因 四、人類基因組的序列圖 ? 人類基因組的核苷酸序列圖（ human genome sequence）是分子水平上最高層次的、最詳盡的物理圖。 控制同一性狀的微效基因可能存在于有限的幾個基因群內(nèi)，而一基因群占據(jù)染色體的一定區(qū)域，稱作 QTL QTL定位的概念 確定一個數(shù)量性狀受到多少個 QTL作用的控制，確定它們在染色體上的位置，并估計出它們對數(shù)量性狀的效應大小及其互作效應，該過程稱為 QTL定位 (QTL mapping)。如果證明遺傳標記與性狀連鎖，則可認定標記附近存在一個或幾個 QTL 利用 QTL與遺傳標記之間的連鎖關系，在一個大群體中進行標記基因型和被測數(shù)量性狀表型值記錄，通過統(tǒng)計方法進行連鎖分析，確定連鎖關系。 QTL定位的策略 （ 1）選擇適宜的遺傳標記； （ 2）選擇在所研究數(shù)量性狀上處于分離狀態(tài)的純系或高度近交系； （ 3）進行系間雜交獲得分離世代的 F2個體或者進行回交獲得 BC個體； （ 4）檢測各世代群個體的標記基因型并記錄其數(shù)量性狀表型值； （ 5）分析標記基因型與數(shù)量性狀表型值之間是否存在連鎖關系，確定 QTL連鎖群，估計 QTL效應。 第五節(jié) 功能基因組學 ? 功能基因組學 又稱后基因組學 (postgenomics)，是在完成基因組圖譜構建以及全部序列測定的基礎上，進一步研究 全基因組的基因功能、基因之間的相互關系和調控機制為主要內(nèi)容的學科 ? 完成基因組測序后 ， 更重要的工作在于弄清楚： ① 基因組序列中所包含的全部遺傳信息是什么； ② 基因組作為一個整體如何行使功能 。 這一研究領域叫轉錄組學(transcriptomics) 轉錄組學的研究方法－ DNA芯片技術 ? 同時進行大量分子雜交，以分析比較不同組織或器官的基因表達水平，篩選突變基因，從核酸水平分析基因表達模式 ?面積不大的基片表面分成不同小格 → 有序的點陣排列核苷酸分子 → 將待分析的核苷酸分子標記變性成單鏈，與芯片上的核苷酸分子雜交 → 洗掉芯片上序列不同的核苷酸分子 → 利用高精度的激光掃描儀記錄已雜交分子的熒光信號 → 計算機分析 蛋白質組學 (proteomics) ? 蛋白質組 (proteom)：一個細胞內(nèi)的全套蛋白質。生物信息學是將現(xiàn)代生物技術與計算機科學結合，收集、加工和處理生物資料 比較基因組學 (parative genomics) ? 比較基因組學涉及比較不同物種的整個基因組，以便深入理解每個基因組的功能和進化關系 ? 不僅可以揭示生命的起源、進化等重大生物學問題，還具有潛在的實用價值 ? 如通過細菌和人類的基因組比較研究，有可能篩選出只在細菌中存在的基因，成為新的抗菌素的藥靶
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