我看進化生物學(編輯修改稿)
2025-05-04 03:33 本頁面
【文章內容簡介】 合我的研究和閱讀提出的一些思考以及我所關心的一些問題: 1）酶以及代謝途徑的進化因為在做進化方面的計算機模擬，所以一直關心一些酶的進化策略，其中的占主導地位的策略到底是什么？近期研究表明，從別的途徑中引進一種酶是代謝途徑進化的重要推動力。其他進化機理，比如：代謝途徑的復制，酶的特殊化，從頭開始的（de novo）代謝途徑進化或者反向進化（retroevolution）都不是十分常見。20%的酶的超家族（superfamilies）是十分可變的，不僅僅是單單改變化學反應或者是代謝形式，通常是兩者同時發(fā)生變化。這些變化占到了已知反應的一半左右。研究者通常研究一些生物普遍具有的主要代謝途徑的進化，來反映酶的進化。通過計算機的方法，我們可以模擬酶的進化過程，對不同的進化策略采用不同的函數進行模擬。我們假設，自然界中最常運用的策略可以在最短時間內，從一個進化途徑的原始形態(tài)（輸入值），變成現在的最終形態(tài)（輸出值）。那么，我們通過不同的模擬函數達到這個最終值的時間可以估計那種進化策略是自然界中最常見的。2）病毒的起源和進化病毒起源的3種學說:：1,從生物大分子到病毒學說（裸基因說）,既病毒是從無機分子到有機大分子在進化到病毒的，認為最早的病毒可能是裸露的RNA分子。2退化進化學說:既反進化論,由復雜到簡單的過程,”在退化中進化”.3生物大分子到細胞到病毒學說.我認為第3種學說更具有說服力,其原因:,沒有活細胞寄生就不能增殖。2,病毒基因和細胞基因的相似性。3,病毒實際上是生物大分子.從病毒的以上3種特性,沒有細胞之前就不可能有病毒,病毒基因起源于細胞基因(,這些物質脫離了細胞而獨立存在,進一步演化形成寄生性.病毒的進化基礎是變異,來自于病毒基因的各種突變,包括核甘酸的轉換,顛換,插入,缺失,分子內重組,核酸節(jié)段之間的重配,病毒基因和宿主基因的整合等.病毒進化的基本特征:1,新病毒的不斷產生,而且基本上是從另一種宿主的病毒演化而來的.2,新病毒產生后,在新的宿主內以較快的速度進行變異.3,病毒進化既有隨即性,又受到一定的選擇性壓力,而表現方向性和穩(wěn)定性。人類疫苗和藥物的作用下，病毒產生變異進化的可能性大大增加，從而產生抗藥性。這必將是未來人們研究病毒進化的一個重要方向。3）C 值悖論基因組大小、基因數目與生物復雜度的關系是科學家們關注的一個重要問題。每一種生物中其單倍體基因組的DNA總量是特異的，被稱為C值 (C Value)。DNA的長度是根據堿基對的多少推算出來的。各門生物存在著一個C值范圍，在每一門中隨著生物復雜性的增加，其基
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