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正文內(nèi)容

[理學]序列分析工具使用簡介(編輯修改稿)

2025-02-17 13:24 本頁面
 

【文章內(nèi)容簡介】 2022/2/16 15 Clustalx的工作界面( 剖面 (profile)比對模式 ) 2022/2/16 16 Clustal的工作原理 Clustal輸入多個序列 快速的序列兩兩比對,計算序列間的距離,獲得一個距離矩陣。 鄰接法 (NJ)構(gòu)建一個樹(引導樹) 根據(jù)引導樹,漸進比對多個序列。 2022/2/16 17 Clustal的應用 。 FASTA , NBRF/PIR, EMBL/Swiss Prot, GDE, CLUSTAL, GCG/ MSF. 。 。 (profile)比對模式。 。 2022/2/16 18 多序列比對實例 輸入文件的格式 (fasta): KCC2_YEAST NYIFGRTLGAGSFGVVRQARKLSTN…… DMK_HUMAN DFEILKVIGRGAFSEVAVVKMKQTGQVYAMKIMNK……. KPRO_MAIZE TRKFKVELGRGESGTVYKGVLEDDRHVAVKKLEN…… DAF1_CAEEL QIRLTGRVGSGRFGNVSRGDYRGEAVAVKVFNALD…… 1CSN HYKVGRRIGEGSFGVIFEGTNLLNN…… 2022/2/16 19 第一步:輸入序列文件。 2022/2/16 20 第二步:設定比對的一些參數(shù)。 2022/2/16 21 參數(shù)設定窗口。 2022/2/16 22 第三步:開始序列比對。 2022/2/16 23 2022/2/16 24 第四步:比對完成,選擇保存結(jié)果文件的格式 2022/2/16 25 2022/2/16 26 更為詳細的教程 可以在這里得到更多關(guān)于 clustal的幫助: 2022/2/16 27
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