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核酸提取原理及方法(編輯修改稿)

2025-01-04 10:17 本頁面
 

【文章內(nèi)容簡(jiǎn)介】 NA提取 —— 堿裂解法 ? 堿裂解法試劑配方 組分 1 組分 2 Ⅰ 液 25 mM TrisHCl ( pH ) 10 mM EDTA( pH ) Ⅱ 液 M NaOH 1% SDS Ⅲ 液 3 M KAc ( pH ) RNase A 10 μg/ml RNase A 洗脫液 EB 10 mM TrisHCl ( pH ) 1 mM EDTA ( pH ) 2022年 7月 質(zhì)粒 DNA提取 —— 實(shí)驗(yàn)流程 對(duì)數(shù)期菌體 溶液 III中和 溶液 I充分重懸 溶液 II裂解 上清液 過柱 干燥溶解 離心洗滌 質(zhì)粒 DNA溶液 離心 詳細(xì)實(shí)驗(yàn)步驟請(qǐng)參考說明書! 2022年 7月 質(zhì)粒 DNA提取 —— 電泳檢測(cè) ?瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè) 質(zhì)粒 DNA的三種帶型: DNA分子:質(zhì)粒雙鏈沒有斷裂;超螺旋結(jié)構(gòu);泳動(dòng)速度 最快 ; 質(zhì)粒 DNA分子:質(zhì)粒的一條鏈斷裂;松弛的環(huán)狀分子;泳動(dòng)速度 最慢 ; DNA分子:質(zhì)粒的兩條鏈均斷裂;泳動(dòng)速度 居中 。 2022年 7月 質(zhì)粒 DNA提取常見問題 ? RNA殘留 ? 質(zhì)粒斷裂 ? 量少 2022年 7月 質(zhì)粒 DNA提取常見問題分析 ? RNA殘留 ? 忘記加 RNase A? ? I液中 RNase A失效? ? 酶量不夠? 2022年 7月 質(zhì)粒 DNA提取常見問題分析 ? 質(zhì)粒斷裂 ? II 液裂解時(shí)間過長(zhǎng)? ? 裂解時(shí)動(dòng)作過于劇烈? 2022年 7月 質(zhì)粒 DNA提取常見問題分析 ? 量少 ?凝膠是否有問題? ?菌體量少 ?菌體重懸不徹底 ?裂解不完全 ?菌株老化 ?嚴(yán)謹(jǐn)型質(zhì)粒 2022年 7月 質(zhì)粒類型 ? 嚴(yán)謹(jǐn)型: 這些質(zhì)粒的復(fù)制是在寄主細(xì)胞嚴(yán)格控制之下進(jìn)行的,與寄主細(xì)胞的復(fù)制偶聯(lián)同步。所以,往往在一個(gè)細(xì)胞中只有一份或幾份拷貝; ? 松馳型: 這些質(zhì)粒的復(fù)制是在寄主細(xì)胞的松弛控制之下進(jìn)行的,每個(gè)細(xì)胞中含有 10200份拷貝,如果用一定的藥物處理抑制寄主蛋白質(zhì)的合成才會(huì)使質(zhì)??截悢?shù)增至幾千份。如較早的質(zhì)粒 pBR322即屬于松弛型質(zhì)粒,要經(jīng)過氯霉素處理才能達(dá)到更高拷貝數(shù)。 2022年 7月 一. 核酸簡(jiǎn)介 二. 基因組 DNA提取 三. 質(zhì)粒 DNA提取 四. 真核細(xì)胞總 RNA提取 五. 瓊脂糖凝膠電泳 2022年 7月 總 RNA提取 —— 通用方法 ? 異硫氰酸胍 /苯酚法( TRIzol法) 原理: 核酸在中性條件下,因磷酸基解離而帶負(fù)電荷,這一部分由于水化而溶于水。而在酸性條件下,磷酸基的負(fù)電荷消失,水溶性下降。因此,在酸性酚的處理下, DNA向疏水性的酚層移動(dòng),而 RNA由于有 OH的存在有親水性,因此向水層移動(dòng)。 2022年 7月 TRIzol試劑中的主要成分為異硫氰酸胍和苯酚,其中異硫氰酸胍可裂解細(xì)胞,促使核蛋白體的解離,使 RNA與蛋白質(zhì)分離,并將 RNA釋放到溶液中。當(dāng)加入氯仿時(shí),它可抽提酸性的苯酚,而酸性苯酚可促使 RNA進(jìn)入水相,離心后可形成水相層和有機(jī)層,這樣 RNA與仍留在有機(jī)相中的蛋白質(zhì)和 DNA便分離開。水相層主要為 RNA,有機(jī)層主要為 DNA和蛋白質(zhì)。 2022年 7月 總 RNA提取及檢測(cè) —— 實(shí)驗(yàn)準(zhǔn)備 臺(tái)式高速冷凍離心機(jī)、移液器、定時(shí)器、 marker筆、酒精噴壺、 電子天平、電泳設(shè)備、凝膠成像系統(tǒng)(或紫外透射儀)、紫外分光光度計(jì)、微波爐、量筒、試劑瓶、錐形瓶等。 mL EP管( RNase free)、各規(guī)格 Tip ( RNase free) 、 一次性手套、一次性口罩等。 TRIzol 總 RNA提取試劑( YRBIO) 、氯仿、異丙醇、 75%乙醇 ( RNase free)、 DEPC
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