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正文內(nèi)容

[自然科學]雜交技術(shù)(編輯修改稿)

2024-11-12 22:54 本頁面
 

【文章內(nèi)容簡介】 確配對 , 因此復性速度較慢 。 ③ 溫度: 溫度過高 , 有利于 DNA變性而不利于復性;而 溫度過低 , 碰撞機率減少 , 易形成局部錯誤配對 , 適宜的溫度是較 Tm值低 15℃ ~ 25℃ 。 ④ 離子強度: 離子強度過低 , 不利于復性 ⑤ pH值: pH值在 5~ 9范圍內(nèi) , 不影響復性速度 , 過低或過高則影響 。 ⑥ DNA分子的復雜性: DNA總量一定時 , 基因組越復雜 , 其中特定順序的拷貝數(shù)就越少 , 互補順序的濃度就越低 , 因而復性反應速度越慢 。 ( 3) 雜交體系的建立要考慮以下幾因素 ① DNA濃度: DNA濃度越高 , 復性速度越快 。 加入足夠的 DNA并盡量減少雜交的體積 ,一般以每平方厘米濾膜面積加 50~ 100μ l雜交液為宜 。 ② DNA探針的長度: 在雜交過程中 , 待測 DNA固定在膜上 , 只有探針可以自由擴散 ,探針越長 , 擴散越慢 , 變性越慢 。 因此探針的長度不宜過長 , 一般以 10~ 50bp。 ③ 離子強度: 離子強度對變性影響較大 。一 般 常 用 5 或 6 SSC ( 1 SSC 為) 。 ④ 溫度: 溫度對于雜交 ( 復性 ) 反應的快慢和洗膜時去掉非特異雜交是至關(guān)重要的因素 。 一般認為雜交溫度為: 68℃ ( 不含甲酰胺 ) ;當含 50% 甲酰胺時 , 在 42℃ 進行雜交 。 洗膜溫度一般認為 55℃ ~ 65℃ 。 對于寡核苷酸探針的雜交溫度 , 應根據(jù)下列公式推算: Tm=4℃ GC+ 2℃ AT 雜交溫度一般比 Tm值低 5℃ , 55℃ ( 20bp) ⑤ 雜交時間:一般應為 Cot1/2的 1~ 3倍 。 Yz 小時 /Cot1/2= 2 5 10X Co=單鏈 DNA濃度 , t1/2=反應一半的時間 Y為探針 DNA的復雜性 , 即片段大小 ( Kb) Z為雜交體系的體積 (ml)。 經(jīng)驗雜交時間 8~ 16h, 過夜 。 ⑥ 減少或抑制非特性雜交 。 一般在雜交前先進行 預雜交 , 以便將非特異性 DNA位點封閉 ,同時也將膜上非特異性吸附位點封閉 。 ⑦ 促進雜交反應速度: 硫酸葡聚糖(dextran sulfate,Mw 500000)能促進 DNA鏈間的締合 , 其微粒表面可吸附 DNA探針分子 ,從而使 DNA接觸面積增大 , 有利于雜交反應 ,促進雜交反應速度 。 如 10% 硫酸葡聚糖可使雜交反應速度提高 10~ 100倍 。 ① 預雜交: 將膜放在預雜液中 , 即不放探針 , 預雜交液中主要含 Dehardt液和鮭魚精 DNA, 主要是 封閉膜上非特異性的雜交位點 。 ② 雜交: 雜交液中除含封閉物質(zhì)外 , 還含有 10% 硫酸葡聚糖和探針 。 探針 如果是雙鏈 DNA, 則需要進行變性處理 。 溫度68℃ ( 不含甲酰胺 ) , 42℃ ( 含 50% 甲酰胺 ) , 雜交時間: 8~ 16h過夜 。 ( 4) 雜交操作步驟 ③ 洗液: 將膜上未與 DNA雜交的及非特異性雜交的探針從膜上洗去的過程 。 由于非特異性雜交的雜交體穩(wěn)定性較低 , 解鏈溫度較低 , 而特異性雜交體由于穩(wěn)定而保留在濾膜上 。 注意, 洗膜液要換幾次, 要用幾種不同的洗膜液。 離子強度逐漸降低, 而 洗膜溫度逐漸上升( 室溫~ 37℃ ~ 65℃ )。即逐漸增加洗膜的強度。逐漸減少離子強度,為下一步反應(檢測)做好準備。 3.雜交信號的檢測 ⑴ 放射自顯影: 探針標記了放射性核素 , 如 32P、 35S、 125I或 131I。 其具體方法是:在暗盒里將雜交后的濾膜放在 暗盒里的 X光片上 , 蓋上暗盒 ,置- 70℃ 曝光一定時間 。 經(jīng) 顯影 、 定影后 , 可出現(xiàn)黑色曝光斑點 ,根據(jù) 斑點密度及大小 , 判斷被檢測核酸是否有與探針相應序列及大小 。 ⑵ 顯色反應: 探針直接標記酶或間接結(jié)合酶,酶在有特異性底物存在的情況下,可發(fā)生顯色反應。 根據(jù)顯色反應斑點大小判斷結(jié)果。 A B C 酶 +底物 顯色 探針 標記物 (地高辛 ) 抗體 常用的酶 堿性磷酸酶 : 作用底物: BCIP( 5溴 4氯 4吲哚磷酸 ) NBT(硝基藍四氮唑 )。 顯色過程:堿性磷酸酶 → BCIP → 脫磷 , 產(chǎn)生H+ → NBT還原 → 紫色化合物 。 辣根過氧化物酶 ( HRP) : 常用的底物: DAB( 二氨基聯(lián)苯胺 ) , 紅棕色 , 有致癌性 。TMB(
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