中華大學(xué)生物資訊學(xué)系專題報(bào)告(存儲版)
【正文】 04208擷取碼與果蠅的FBpp0088443同源。(2)獲得網(wǎng)站提供的資料後，發(fā)現(xiàn)資料過於龐大與雜亂。使用記憶體:使用電腦空間記憶體約20000K五、評估與展望未來希望可以增加更多的資料庫蛋白質(zhì)擷取碼供使用者查詢。七、銘謝本次專題能夠順利完成，要特別感謝我們的指導(dǎo)教授侯玉松老師不厭其煩的耐心教導(dǎo)，在百忙之中抽出時(shí)間來與我們進(jìn)行討論，並且不斷的鼓勵(lì)我們，而當(dāng)我們遇上困難時(shí)會帶領(lǐng)我們思考並找出解決方法，讓我們不僅可以順利的進(jìn)行專題還可以從討論之中獲得更多知識，而在專題之外老師也會關(guān)心我們的生活情況，並且會建議我們畢業(yè)之後的發(fā)展，可謂我們的良師與益友，所以在這送上最誠摯的感謝。圖十: WBGene00006765在Inparanoid中作搜尋的結(jié)果。(三)主要困難與解決之道 (1)專題進(jìn)行初期最大的困難是沒有相關(guān)的資料。圖六:紅框中顯示線蟲與果蠅為同源蛋白的轉(zhuǎn)換表。表一:專題流程圖(1)進(jìn)行資料整合 由於PIR提供的資料過於凌亂(圖一)，所以我們利用程式，先進(jìn)行整理，整理出7個(gè)資料庫對應(yīng)UNIPORT的擷取碼，例如CYGD有6644筆、Wormbase有22833筆、TAIR有26459筆 、Ensembl有223568筆、dictyBase有12750筆、FlyBase有38724筆、ZFIN有18158筆。所以每個(gè)擷取碼就像我們的身分證字號一樣，是獨(dú)一無二的，我們可以依據(jù)擷取碼，找到我們需要的蛋白質(zhì)序列。三、專題進(jìn)行方式(一)蒐集資料? 擷取碼就像是資料庫中的主鍵(Primary Key)，而Primary Key的作用是尋找或查詢資料的主要依據(jù)，任何候選鍵都可當(dāng)主鍵，但只能有一個(gè)主鍵，以鑰匙狀的標(biāo)記表示主鍵值。(二)專題進(jìn)行 本專題為了讓在研究過程更有計(jì)畫，並且進(jìn)行重點(diǎn)式的研究，所以製作了專題流程表(表一)。(4)設(shè)計(jì)搜尋同源資料程式在整理Inparanoid同源資料時(shí)，我
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