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中華大學生物資訊學系專題報告(存儲版)

2025-05-04 23:07上一頁面

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【正文】 04208擷取碼與果蠅的FBpp0088443同源。(2)獲得網(wǎng)站提供的資料後,發(fā)現(xiàn)資料過於龐大與雜亂。使用記憶體:使用電腦空間記憶體約20000K五、評估與展望未來希望可以增加更多的資料庫蛋白質(zhì)擷取碼供使用者查詢。七、銘謝本次專題能夠順利完成,要特別感謝我們的指導教授侯玉松老師不厭其煩的耐心教導,在百忙之中抽出時間來與我們進行討論,並且不斷的鼓勵我們,而當我們遇上困難時會帶領我們思考並找出解決方法,讓我們不僅可以順利的進行專題還可以從討論之中獲得更多知識,而在專題之外老師也會關心我們的生活情況,並且會建議我們畢業(yè)之後的發(fā)展,可謂我們的良師與益友,所以在這送上最誠摯的感謝。圖十: WBGene00006765在Inparanoid中作搜尋的結(jié)果。(三)主要困難與解決之道 (1)專題進行初期最大的困難是沒有相關的資料。圖六:紅框中顯示線蟲與果蠅為同源蛋白的轉(zhuǎn)換表。表一:專題流程圖(1)進行資料整合 由於PIR提供的資料過於凌亂(圖一),所以我們利用程式,先進行整理,整理出7個資料庫對應UNIPORT的擷取碼,例如CYGD有6644筆、Wormbase有22833筆、TAIR有26459筆 、Ensembl有223568筆、dictyBase有12750筆、FlyBase有38724筆、ZFIN有18158筆。所以每個擷取碼就像我們的身分證字號一樣,是獨一無二的,我們可以依據(jù)擷取碼,找到我們需要的蛋白質(zhì)序列。三、專題進行方式(一)蒐集資料? 擷取碼就像是資料庫中的主鍵(Primary Key),而Primary Key的作用是尋找或查詢資料的主要依據(jù),任何候選鍵都可當主鍵,但只能有一個主鍵,以鑰匙狀的標記表示主鍵值。(二)專題進行 本專題為了讓在研究過程更有計畫,並且進行重點式的研究,所以製作了專題流程表(表一)。(4)設計搜尋同源資料程式在整理Inparanoid同源資料時,我
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