中華大學(xué)生物資訊學(xué)系專題報告(專業(yè)版)
【正文】 花費時間:在轉(zhuǎn)換擷取碼轉(zhuǎn)換時，每次執(zhí)行時間約在一分鐘內(nèi)完成。 在物種的同源蛋白之中有些蛋白會有一對一(圖七)同源性。PIR(Protein Information Resource)為PIRInternational這個大分子序列資料收集中心所維持的蛋白質(zhì)序列資料庫此中心包括National BiomediCal Research Foundation (NBRF) Protein Information Resource (PIR)，日本Japan International Protein Information Datebase Martinscried Institute for Protein Sequence (MPS) 提供了我們各個資料庫轉(zhuǎn)換成uniport的資料。而HOMSA為Homo sapiens的縮寫，縮寫方式為取Homo的前面三個字母與sapiens前面兩個字母，其他物種也是以此方式進(jìn)行縮寫。圖八: 程式執(zhí)行畫面 最後在視窗化後，然後再輸出擷取碼那裡的資料庫類別選Wormbase，最後在執(zhí)行後，成功的再輸出擷取碼畫面裡跑出他在裡的擷取碼為WBGene00012015。六、結(jié)語 每個資料庫都有自己蛋白質(zhì)序列的編碼方式，若把某個資料庫的蛋白質(zhì)擷取碼，取到另外的資料庫上搜尋，會因為編碼方式的不同而找不到擷取碼。(3) 建立對照表後，某部分資料太龐大，導(dǎo)致程式無法執(zhí)行。利用快速排序法，將資料經(jīng)過排序後，再由二分搜尋法來對我們欲搜尋的目標(biāo)進(jìn)行搜尋。中華大學(xué)生物資訊學(xué)系專題報告擷取碼的轉(zhuǎn)換應(yīng)用於同源序列搜尋The application of transformation of accession numbers to homologous sequence searching 專題組員:李昱賢、蔡承錞、張智堯、曹富凱專題編號：PROJ2008BIOINFO9410指導(dǎo)老師: 侯玉松老師7 / 7一、摘要 每個蛋白質(zhì)都有其
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