中華大學(xué)生物資訊學(xué)系專(zhuān)題報(bào)告-wenkub
2023-04-19 23:07:44 本頁(yè)面
【正文】 碼為WBGene00012015而找出果蠅的同源蛋白擷取碼為FBpp0070368。而如果要利用二分搜尋法，其資料需要經(jīng)過(guò)排序，在處理資料上，我們使用快速排序法(Quick Sort)來(lái)進(jìn)行排序。(二)專(zhuān)題進(jìn)行 本專(zhuān)題為了讓在研究過(guò)程更有計(jì)畫(huà)，並且進(jìn)行重點(diǎn)式的研究，所以製作了專(zhuān)題流程表(表一)。Inparanoid()裡面有物種對(duì)物種的同源蛋白序列資料，本專(zhuān)題由此資料庫(kù)擷取酵母菌()、線蟲(chóng)()、果蠅()、阿拉伯芥( na)、人類(lèi)()、大腸桿菌()的同源蛋白配對(duì)資料。三、專(zhuān)題進(jìn)行方式(一)蒐集資料? 擷取碼就像是資料庫(kù)中的主鍵(Primary Key)，而Primary Key的作用是尋找或查詢資料的主要依據(jù)，任何候選鍵都可當(dāng)主鍵，但只能有一個(gè)主鍵，以鑰匙狀的標(biāo)記表示主鍵值。中華大學(xué)生物資訊學(xué)系專(zhuān)題報(bào)告擷取碼的轉(zhuǎn)換應(yīng)用於同源序列搜尋The application of transformation of accession numbers to homologous sequence searching 專(zhuān)題組員:李昱賢、蔡承錞、張智堯、曹富凱專(zhuān)題編號(hào)：PROJ2008BIOINFO9410指導(dǎo)老師: 侯玉松老師7 / 7一、摘要 每個(gè)蛋白質(zhì)都有其代號(hào)與同源性，而每個(gè)蛋白質(zhì)資料庫(kù)中都有其自家的蛋白質(zhì)擷取碼代號(hào)，其主鍵(Primary Key)不同能應(yīng)用的資料庫(kù)當(dāng)然也不同，為了能轉(zhuǎn)換各個(gè)資料庫(kù)的主鍵，我們收集了各資料庫(kù)的資料與同源資料加以整理並且建立了對(duì)照表，再利用擷取碼對(duì)照表與同源對(duì)照表，建立我們自己的轉(zhuǎn)換程式與同源蛋白搜尋程式，最後為了需求者的方便，我們把上述程式加以整合，並且視窗化，完成了一個(gè)具蛋白質(zhì)擷取碼轉(zhuǎn)換與同源搜尋功能的整合程式。所以每個(gè)擷取碼就像我們的身分證字號(hào)一樣，是獨(dú)一無(wú)二的，我們可以依據(jù)擷取碼，找到我們需要的蛋白質(zhì)序列。共包括了5792個(gè)酵母菌蛋白質(zhì)、26819個(gè)阿拉伯芥蛋白質(zhì)、20084個(gè)線蟲(chóng)蛋白質(zhì)、13854個(gè)果蠅蛋白質(zhì)、22 (圖
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