中華大學生物資訊學系專題報告-wenkub
2023-04-19 23:07:44 本頁面
【正文】 碼為WBGene00012015而找出果蠅的同源蛋白擷取碼為FBpp0070368。而如果要利用二分搜尋法，其資料需要經(jīng)過排序，在處理資料上，我們使用快速排序法(Quick Sort)來進行排序。(二)專題進行 本專題為了讓在研究過程更有計畫，並且進行重點式的研究，所以製作了專題流程表(表一)。Inparanoid()裡面有物種對物種的同源蛋白序列資料，本專題由此資料庫擷取酵母菌()、線蟲()、果蠅()、阿拉伯芥( na)、人類()、大腸桿菌()的同源蛋白配對資料。三、專題進行方式(一)蒐集資料? 擷取碼就像是資料庫中的主鍵(Primary Key)，而Primary Key的作用是尋找或查詢資料的主要依據(jù)，任何候選鍵都可當主鍵，但只能有一個主鍵，以鑰匙狀的標記表示主鍵值。中華大學生物資訊學系專題報告擷取碼的轉換應用於同源序列搜尋The application of transformation of accession numbers to homologous sequence searching 專題組員:李昱賢、蔡承錞、張智堯、曹富凱專題編號：PROJ2008BIOINFO9410指導老師: 侯玉松老師7 / 7一、摘要 每個蛋白質(zhì)都有其代號與同源性，而每個蛋白質(zhì)資料庫中都有其自家的蛋白質(zhì)擷取碼代號，其主鍵(Primary Key)不同能應用的資料庫當然也不同，為了能轉換各個資料庫的主鍵，我們收集了各資料庫的資料與同源資料加以整理並且建立了對照表，再利用擷取碼對照表與同源對照表，建立我們自己的轉換程式與同源蛋白搜尋程式，最後為了需求者的方便，我們把上述程式加以整合，並且視窗化，完成了一個具蛋白質(zhì)擷取碼轉換與同源搜尋功能的整合程式。所以每個擷取碼就像我們的身分證字號一樣，是獨一無二的，我們可以依據(jù)擷取碼，找到我們需要的蛋白質(zhì)序列。共包括了5792個酵母菌蛋白質(zhì)、26819個阿拉伯芥蛋白質(zhì)、20084個線蟲蛋白質(zhì)、13854個果蠅蛋白質(zhì)、22 (圖
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