中華大學(xué)生物資訊學(xué)系專題報(bào)告-文庫(kù)吧在線文庫(kù)
【正文】 們?cè)诔淌揭婚_(kāi)始設(shè)計(jì)兩個(gè)2維陣列(設(shè)為buf_worm與buf_yest)，用來(lái)暫存我們搜尋到的擷取碼，接著我們用雙重迴圈寫(xiě)入檔案，以圖六為例線蟲(chóng)()中WBGene00012015的蛋白質(zhì)與果蠅(Fly base)的FBpp0070368經(jīng)程式建立之後為圖七的對(duì)照表(5)同源對(duì)照表範(fàn)例 我們舉一個(gè)例子來(lái)說(shuō)明，假設(shè)使用者想要搜尋線蟲(chóng)()中WBGene00012015擷取碼和果蠅(Fly base)的同源蛋白擷取碼，然後再將這擷取碼輸入程式之中，找到果蠅的同源蛋白擷取碼為FBpp0070368 (圖五)圖五:例如紅框中為線蟲(chóng)蛋白擷取碼為WBGene00012015而找出果蠅的同源蛋白擷取碼為FBpp0070368。 若是使用者想進(jìn)一步了解該擷取碼的同源蛋白，在按同源搜尋鈕，就可以在輸出視窗得到相關(guān)資料。四、主要成果 程式完成之後，在Inparanoid中做搜尋，會(huì)發(fā)生搜尋不到任何東西的情況(圖九)，但經(jīng)由我們所提供的程式轉(zhuǎn)換成WormBase資料庫(kù)中WBGene00006765擷取碼之後，就可以在Inparanoid網(wǎng)頁(yè)中找到該同源蛋白的資料(圖十)，由這個(gè)例子我們可以利用這個(gè)程式在不同的網(wǎng)站，得到不同的應(yīng)用圖九: 。而最後這個(gè)程式除了視窗化蛋白質(zhì)擷取碼的轉(zhuǎn)換，還提供了同源蛋白質(zhì)物種的資料，讓使用者可以大幅減少在網(wǎng)路上查詢蛋白質(zhì)擷取碼轉(zhuǎn)換與同源蛋白質(zhì)物種時(shí)的複雜度與時(shí)間。一些檔案太大的蛋白質(zhì)資料庫(kù)截取碼無(wú)法轉(zhuǎn)換，藉由升級(jí)電腦配備、增加記憶體之後，再修改程式二維陣列大小，讓使用者有更多元、完整的蛋白質(zhì)截取碼可以查詢。 於是我們?cè)O(shè)計(jì)一個(gè)可以建立對(duì)照表的程式，來(lái)建立我們自己所需的轉(zhuǎn)換表，使得資料得到整合。(6)程式視窗化我們將上述的所有方法統(tǒng)整於一個(gè)視窗程式之中，並且利用了C++ Builder中的元件，例如Button、bobox、edit、rich edit元件來(lái)達(dá)成視窗化的目標(biāo)，最後使用者只要輸入蛋白質(zhì)擷取碼，就可以找到想要查詢資料庫(kù)的擷取碼，並且列出其同源
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