中華大學(xué)生物資訊學(xué)系專題報告-文庫吧在線文庫
【正文】 們在程式一開始設(shè)計兩個2維陣列(設(shè)為buf_worm與buf_yest)，用來暫存我們搜尋到的擷取碼，接著我們用雙重迴圈寫入檔案，以圖六為例線蟲()中WBGene00012015的蛋白質(zhì)與果蠅(Fly base)的FBpp0070368經(jīng)程式建立之後為圖七的對照表(5)同源對照表範(fàn)例 我們舉一個例子來說明，假設(shè)使用者想要搜尋線蟲()中WBGene00012015擷取碼和果蠅(Fly base)的同源蛋白擷取碼，然後再將這擷取碼輸入程式之中，找到果蠅的同源蛋白擷取碼為FBpp0070368 (圖五)圖五:例如紅框中為線蟲蛋白擷取碼為WBGene00012015而找出果蠅的同源蛋白擷取碼為FBpp0070368。 若是使用者想進一步了解該擷取碼的同源蛋白，在按同源搜尋鈕，就可以在輸出視窗得到相關(guān)資料。四、主要成果 程式完成之後，在Inparanoid中做搜尋，會發(fā)生搜尋不到任何東西的情況(圖九)，但經(jīng)由我們所提供的程式轉(zhuǎn)換成WormBase資料庫中WBGene00006765擷取碼之後，就可以在Inparanoid網(wǎng)頁中找到該同源蛋白的資料(圖十)，由這個例子我們可以利用這個程式在不同的網(wǎng)站，得到不同的應(yīng)用圖九: 。而最後這個程式除了視窗化蛋白質(zhì)擷取碼的轉(zhuǎn)換，還提供了同源蛋白質(zhì)物種的資料，讓使用者可以大幅減少在網(wǎng)路上查詢蛋白質(zhì)擷取碼轉(zhuǎn)換與同源蛋白質(zhì)物種時的複雜度與時間。一些檔案太大的蛋白質(zhì)資料庫截取碼無法轉(zhuǎn)換，藉由升級電腦配備、增加記憶體之後，再修改程式二維陣列大小，讓使用者有更多元、完整的蛋白質(zhì)截取碼可以查詢。 於是我們設(shè)計一個可以建立對照表的程式，來建立我們自己所需的轉(zhuǎn)換表，使得資料得到整合。(6)程式視窗化我們將上述的所有方法統(tǒng)整於一個視窗程式之中，並且利用了C++ Builder中的元件，例如Button、bobox、edit、rich edit元件來達(dá)成視窗化的目標(biāo)，最後使用者只要輸入蛋白質(zhì)擷取碼，就可以找到想要查詢資料庫的擷取碼，並且列出其同源
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