中華大學生物資訊學系專題報告(完整版)
【正文】 關係。而如果要利用二分搜尋法，其資料需要經(jīng)過排序，在處理資料上，我們使用快速排序法(Quick Sort)來進行排序。Inparanoid()裡面有物種對物種的同源蛋白序列資料，本專題由此資料庫擷取酵母菌()、線蟲()、果蠅()、阿拉伯芥( na)、人類()、大腸桿菌()的同源蛋白配對資料。中華大學生物資訊學系專題報告擷取碼的轉換應用於同源序列搜尋The application of transformation of accession numbers to homologous sequence searching 專題組員:李昱賢、蔡承錞、張智堯、曹富凱專題編號：PROJ2008BIOINFO9410指導老師: 侯玉松老師7 / 7一、摘要 每個蛋白質都有其代號與同源性，而每個蛋白質資料庫中都有其自家的蛋白質擷取碼代號，其主鍵(Primary Key)不同能應用的資料庫當然也不同，為了能轉換各個資料庫的主鍵，我們收集了各資料庫的資料與同源資料加以整理並且建立了對照表，再利用擷取碼對照表與同源對照表，建立我們自己的轉換程式與同源蛋白搜尋程式，最後為了需求者的方便，我們把上述程式加以整合，並且視窗化，完成了一個具蛋白質擷取碼轉換與同源搜尋功能的整合程式。共包括了5792個酵母菌蛋白質、26819個阿拉伯芥蛋白質、20084個線蟲蛋白質、13854個果蠅蛋白質、22 (圖二)。利用快速排序法，將資料經(jīng)過排序後，再由二分搜尋法來對我們欲搜尋的目標進行搜尋。這樣子我們就能將這些在網(wǎng)站上繁雜的資料搜尋精簡化，增加使用者搜尋的便利性，減少花費把找到後的擷取碼再貼到找同源網(wǎng)站的複雜性與時間。(3) 建立對照表後，某部分資料太龐大，導致程式無法執(zhí)行。 程式視窗化設計方面，仍有一些可以改進的空間。六、結語 每個資料庫都有自己蛋白質序列的編碼方式，若把某個資料庫的蛋白質擷取碼，取到另外的資料庫上搜尋，會因為編碼方式的不同而找不到擷取碼。(4)程式技巧不足 當遇到程式有問
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