中華大學(xué)生物資訊學(xué)系專題報告(已修改)
2025-04-16 23:07 本頁面
【正文】 中華大學(xué)生物資訊學(xué)系專題報告擷取碼的轉(zhuǎn)換應(yīng)用於同源序列搜尋The application of transformation of accession numbers to homologous sequence searching 專題組員:李昱賢、蔡承錞、張智堯、曹富凱專題編號：PROJ2008BIOINFO9410指導(dǎo)老師: 侯玉松老師7 / 7一、摘要 每個蛋白質(zhì)都有其代號與同源性，而每個蛋白質(zhì)資料庫中都有其自家的蛋白質(zhì)擷取碼代號，其主鍵(Primary Key)不同能應(yīng)用的資料庫當(dāng)然也不同，為了能轉(zhuǎn)換各個資料庫的主鍵，我們收集了各資料庫的資料與同源資料加以整理並且建立了對照表，再利用擷取碼對照表與同源對照表，建立我們自己的轉(zhuǎn)換程式與同源蛋白搜尋程式，最後為了需求者的方便，我們把上述程式加以整合，並且視窗化，完成了一個具蛋白質(zhì)擷取碼轉(zhuǎn)換與同源搜尋功能的整合程式。二、簡介 由於有些研究者在研究蛋白序列時，取得了資料庫的蛋白質(zhì)擷取碼後，如果想再另外的資料庫上搜尋時，有時會因為兩種資料庫的命名擷取碼方式不同，造成研究者在不同資料庫中做搜尋時，會發(fā)生擷取碼無法對照或找不到該擷取碼的困擾， 所以本專題主要目的是嘗試用程式來轉(zhuǎn)換擷取碼，讓研究者可以透過程式，來轉(zhuǎn)換自己所需的擷取碼，以便可以在另外的資料庫中使用。 另一方面研究者在轉(zhuǎn)換所需擷取碼之後，我們提供該擷取碼的相關(guān)同源蛋白，讓研究者不僅可以知道各個資料庫的蛋白質(zhì)擷取碼並且可以讓他們進一步了解這些蛋白質(zhì)擷取碼的相關(guān)性，不在需要到網(wǎng)站上做搜尋，只需要藉由程式就可以達(dá)到目的。三、專題進行方式(一)蒐集資料? 擷取碼就像是資料庫中的主鍵(Primary Key)，而Primary Key的作用是尋找或查詢資料的主要依據(jù)，任何候選鍵都可當(dāng)主鍵，但只能有一個主鍵，以鑰匙狀的標(biāo)記表示主鍵值。所以每個擷取碼就像我們的身分證字號一樣，是獨一無二的，我們可以依據(jù)擷取碼，找到我們需要的蛋白質(zhì)序列。PIR(
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