中華大學(xué)生物資訊學(xué)系專題報(bào)告(更新版)
【正文】 題時(shí)，我們利用身邊的書籍查詢，例如C++語言與C++Builder語言，最後再經(jīng)由老師耐心的教導(dǎo)下，讓我們學(xué)到寫程式的技巧，使得專題得以順利進(jìn)行。圖八: 程式執(zhí)行畫面 最後在視窗化後，然後再輸出擷取碼那裡的資料庫類別選Wormbase，最後在執(zhí)行後，成功的再輸出擷取碼畫面裡跑出他在裡的擷取碼為WBGene00012015。(圖四)圖四:例如紅框中得知Ensembl裡。而HOMSA為Homo sapiens的縮寫，縮寫方式為取Homo的前面三個(gè)字母與sapiens前面兩個(gè)字母，其他物種也是以此方式進(jìn)行縮寫。 另一方面研究者在轉(zhuǎn)換所需擷取碼之後，我們提供該擷取碼的相關(guān)同源蛋白，讓研究者不僅可以知道各個(gè)資料庫的蛋白質(zhì)擷取碼並且可以讓他們進(jìn)一步了解這些蛋白質(zhì)擷取碼的相關(guān)性，不在需要到網(wǎng)站上做搜尋，只需要藉由程式就可以達(dá)到目的。PIR(Protein Information Resource)為PIRInternational這個(gè)大分子序列資料收集中心所維持的蛋白質(zhì)序列資料庫此中心包括National BiomediCal Research Foundation (NBRF) Protein Information Resource (PIR)，日本Japan International Protein Information Datebase Martinscried Institute for Protein Sequence (MPS) 提供了我們各個(gè)資料庫轉(zhuǎn)換成uniport的資料。(圖三)圖三:例如紅框中Wormbase裡 WBGene00012015對(duì)應(yīng)uniport擷取碼為Q17761。 在物種的同源蛋白之中有些蛋白會(huì)有一對(duì)一(圖七)同源性。 在不斷的搜尋中，最後在PIR網(wǎng)站與Inparanoid中找到相關(guān)的資料，才得以開始設(shè)計(jì)程式，然後進(jìn)行對(duì)照表建立?；ㄙM(fèi)時(shí)間:在轉(zhuǎn)換擷取碼轉(zhuǎn)換時(shí)，每次執(zhí)行時(shí)間約在一分鐘內(nèi)完成。
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