【正文】 A的核酸序列和調(diào)控序列。4高度重復(fù)序列：在基因組中重復(fù)頻率高，可達(dá)百萬(106)以上 ，不轉(zhuǎn)錄，多位于著絲粒處，是異染色質(zhì)組分，可能與染色體穩(wěn)定有關(guān)。2★著絲粒：兩條染色單體相連處染色較淺向內(nèi)凹陷的縊痕（主縊痕）3副縊痕：染色體臂上狹窄淺染的縊縮的部分4隨體：位于染色體末端的球形染色體節(jié)段5核仁組織區(qū) ：是核糖體RNA基因所在的區(qū)域，位于副縊痕區(qū) 6復(fù)制子與復(fù)制起始點：7★端粒 （telomere）：由端粒DNA與端粒結(jié)合蛋白形成的、染色體端部的特化部分。通過堿基配對與細(xì)胞內(nèi)核酸特異結(jié)合形成雜交分子，從而在復(fù)制、轉(zhuǎn)錄和翻譯水平調(diào)節(jié)靶基因的表達(dá)反義DNA：與DNA雙鏈中的有義鏈互補(bǔ)結(jié)合的短小DNA分子反義RNA：與mRNA完全互補(bǔ)的小分子RNA或寡聚核苷酸片段 RNAi—在進(jìn)化過程中高度保守的、由雙鏈RNA誘發(fā)的、同源mRNA高效特異性降解的現(xiàn)象 長雙鏈RNA被細(xì)胞源性的雙鏈RNA特異的Dicer成2123個堿基對的短雙鏈RNA—小干擾性RNA（small interfering RNA，siRNA）siRNA與細(xì)胞源性的酶和蛋白質(zhì)形成復(fù)合體—RNA誘導(dǎo)的沉默復(fù)合體（RISC）→識別與siRNA有同源序列的mRNA，并在特異的位點將該mRNA切斷。在反轉(zhuǎn)錄病毒復(fù)制的過程中，tRNA可以作為DNA復(fù)制的引物 rRNA 是核糖體的主要結(jié)構(gòu)組成部分，蛋白質(zhì)合成過程所必需 iRNA(起始RNA） 在DNA合成中作為后滯鏈合成引物的短RNA片段 snRNA(核內(nèi)小RNA) 參與內(nèi)含子的剪切及其他加工過程 scRNA(胞質(zhì)內(nèi)小RNA)是信號肽識別顆粒的組成部分端粒酶RNA 作為形成端粒重復(fù)序列的模板的核RNA，是端粒的組成部分gRNA(指導(dǎo)RNA)在錐蟲動基粒中合成的RNA種類，可作為RNA編輯過程的模板反義RNA 反義RNA與mRNA互補(bǔ)，可與其形成雙螺旋結(jié)構(gòu)阻斷蛋白質(zhì)的合成。帽子 無 有，保護(hù)mRNA及蛋白合成正確起始 339。A＝T，G≡C，每個螺距的距離34 197。第一章 核酸的分子結(jié)構(gòu)、性質(zhì)和功能DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)DNA分子是由兩條互補(bǔ)的多核苷酸鏈組成的。兩條鏈以一定的空間距離，在同一軸上相互盤旋起來構(gòu)成雙螺旋結(jié)構(gòu)。包括10對堿基。尾巴 無 poly A，與mRNA半衰期及核到漿轉(zhuǎn)運(yùn)有關(guān) 內(nèi)含子 無 有 SD序列 有（AGGAGG） 無 稀有堿基 無 有，但極少 生成方式 邊轉(zhuǎn)錄邊翻譯 前體hnRNA修飾后轉(zhuǎn)入胞質(zhì) tRNA 含有稀有堿基 3’末端含有CCA序列 二級結(jié)構(gòu)呈三葉草形 三級結(jié)構(gòu)呈倒L型 蛋白質(zhì)生物合成中識別密碼子，特異性搬運(yùn)氨基酸的作用二級結(jié)構(gòu) 三級結(jié)構(gòu)單鏈、 三葉草葉形、 四臂四環(huán) 在二級結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)上進(jìn)一折疊扭曲形成倒L型rRNA與核糖體蛋白構(gòu)成核糖體，是蛋白生物合成的場所mRNA結(jié)合位點、起始部分的識別、密碼子與反密碼子的相互作用肽鍵形成、AAtRNA、肽基tRNA的結(jié)合★核小RNA和胞漿小RNA（snRNA/scRNA） snRNA—核內(nèi)、與蛋白質(zhì)結(jié)合在一起形成小分子核內(nèi)蛋白顆粒，參與mRNA的剪切加工 scRNA—蛋白質(zhì)定位于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的信號肽識別 粒子的組成成分起始RNA—作為DNA生物合成的通用引物指導(dǎo)RNA —RNA編輯的模板端粒酶RNA和核酶端粒：短而數(shù)目精確的串聯(lián)重復(fù)DNA小片段與蛋白質(zhì)夠成的特殊結(jié)構(gòu)端粒酶(telomerase):自身攜帶RNA模板的逆轉(zhuǎn)錄酶，催化端粒DNA合成端粒酶RNA：形成端粒重復(fù)序列的模板RNA核酶(ribozyme)：具有酶作用特征的一類RNA,無需能量可以自我催化和切割，使RNA被降解而無法進(jìn)行轉(zhuǎn)錄和翻譯RNA種類 ★功 能 mRNA 轉(zhuǎn)錄自編碼蛋白質(zhì)基因的RNA，攜帶翻譯信息。核酶指具有化學(xué)催化功能的RNA分子（RNA酶）。 DNA病毒—多數(shù)動物病毒、雙鏈DNA(環(huán)型或線型)RNA病毒—RNA攜帶全部遺傳信息?！锒肆５墓δ?防止染色體DNA降解、融合和缺失，維持染色體的穩(wěn)定性 2穩(wěn)定和保護(hù)染色體的完整性，確保遺傳信息完整復(fù)制3指導(dǎo)染色體與核膜相連4反映細(xì)胞分裂的能力染色質(zhì)和染色體的化學(xué)成分及組成化學(xué)組成(1)DNA：約占30%，每條染色體一個雙鏈DNA分子是遺傳信息的載體。有絲分裂—細(xì)胞間接分裂的一種方式，由多種過程復(fù)合而成，藉此二子核接受原種屬體細(xì)胞的特征，即相等數(shù)的染色體，得以有絲分裂，集體成長并更新細(xì)胞減數(shù)分裂—染色體復(fù)制一次而細(xì)胞連續(xù)分裂兩次的分裂方式 ，其二倍體的原始生殖細(xì)胞染色體復(fù)制一次之后，要經(jīng)過兩次細(xì)胞分裂，結(jié)果子細(xì)胞（即生殖細(xì)胞）所含的染色體數(shù)目比親代細(xì)胞減少一半。特點：1能忠實地復(fù)制自己，以保持生物的基本特征 2能夠“突變” ，致病或給自然選擇帶來原始材料1順反子:可以編碼一條多肽鏈的的一個遺傳功能單位。是具有潛在的促發(fā)腫瘤發(fā)生活性的基因6抑癌基因：是指某種基因當(dāng)其受阻抑、失活、丟失、或其表達(dá)產(chǎn)物喪失功能可導(dǎo)致細(xì)胞惡性轉(zhuǎn)化基因組單倍體細(xì)胞中所含有的全部遺傳信息，包括編碼和非編碼序列在內(nèi)的全部DNA分子。一部分編碼rRNA、tRNA、組蛋白及免疫球蛋白，另一些與基因調(diào)控有關(guān) Alu家族：哺乳動物中含量最豐富，有種屬特異性 KpnI家族：靈長類所特有，用作天然標(biāo)記6基因家族：來源相同、結(jié)構(gòu)相似、功能相關(guān)的基因構(gòu)成 串聯(lián)重復(fù)基因簇：編碼RNA的基因串聯(lián)排列 分散式基因簇：分布在不同部位，編碼干擾素、珠蛋白、 生長激素等 假基因：不能產(chǎn)生有功能基因產(chǎn)物的基因★病毒和噬菌體基因組特征1基因組很小，但是不同的病毒之間其基因組相差大2基因組可以由DNA或RNA組成，但只能是其中之一3 RNA病毒基因組可以由數(shù)條不相連的RNA鏈組成4含有啟動子和操縱基因5存在基因重疊6可以形成多順反子mRNA7噬菌體基因是連續(xù)的，真核細(xì)胞病毒基因是不連續(xù)的 第三章 可移動的遺傳因子（轉(zhuǎn)座子）和染色體外的遺傳因子轉(zhuǎn)座子：是基因組中一段可移動的DNA序列，可以通過切割、重新整合等一系列過程從基因組的一個位置“跳躍”到另一個位置。 （2）含編碼轉(zhuǎn)座酶的基因。在逆轉(zhuǎn)錄酶的作用下首先將RNA轉(zhuǎn)變?yōu)閏DNA，并插入宿主的DNA中，進(jìn)行復(fù)制、轉(zhuǎn)錄、翻譯達(dá)到擴(kuò)增目的2三個結(jié)構(gòu)基因： ★gag編碼核心蛋白、pol編碼逆轉(zhuǎn)錄酶、env編碼被膜糖蛋白 3整合的原病毒是雙鏈DNA序列g(shù)ag 基因編碼病毒的核心蛋白質(zhì)pol基因編碼與核酸合成以及重組相關(guān)的酶類env 基因編碼病毒外殼蛋白質(zhì) 逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子：以RNA為中介，反轉(zhuǎn)錄成DNA而進(jìn)行轉(zhuǎn)座的遺傳元件的轉(zhuǎn)座子1具有與逆轉(zhuǎn)錄病毒類似的長末端重復(fù)結(jié)構(gòu)（LIT）2含gag和pol基因，但無被膜蛋白基因env3不具有LTR但有3’polyA，其中心編碼區(qū)含有g(shù)ag和pol類似的序列，5’端常被截短 逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子的類型1LTR反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子 ：含有與逆轉(zhuǎn)錄病毒相類似的LTRS，編碼逆轉(zhuǎn)錄酶和整合酶，可自主地進(jìn)行轉(zhuǎn)錄。3 col質(zhì)粒：攜帶有產(chǎn)生大腸桿菌素（colicin）酶系基因的質(zhì)粒4 質(zhì)粒噬菌體(phagemid) : ★質(zhì)粒DNA特性1. 質(zhì)粒DNA具有自我復(fù)制的能力，但要由細(xì)菌染色體多種酶系統(tǒng)來完成2．質(zhì)粒DNA所編碼的基因產(chǎn)物賦予細(xì)菌某些性狀特征3．質(zhì)粒可自行丟失與消除4．質(zhì)粒的轉(zhuǎn)移性5．質(zhì)粒具有不相容性 質(zhì)粒的復(fù)制有兩種1嚴(yán)緊型質(zhì)粒：當(dāng)細(xì)胞染色體復(fù)制一次時，質(zhì)粒也復(fù)制一次，每個細(xì)胞內(nèi)只有1～2個質(zhì)粒2松弛型質(zhì)粒：當(dāng)染色體復(fù)制停止后仍然能繼續(xù)復(fù)制，每一個細(xì)胞內(nèi)一般有20個左右質(zhì)粒 質(zhì)粒的不相容性：當(dāng)某種質(zhì)粒在宿主細(xì)胞內(nèi)存在時，將阻止其他類質(zhì)粒進(jìn)入細(xì)胞寄宿質(zhì)粒的轉(zhuǎn)移性：質(zhì)粒通過細(xì)菌的結(jié)合作用，將質(zhì)粒復(fù)制子轉(zhuǎn)移到新的宿主細(xì)菌內(nèi) 質(zhì)粒中的選擇性標(biāo)記鑒定穩(wěn)定接受質(zhì)粒的細(xì)菌群，常用抗生素抗性基因做標(biāo)記1，氨芐青霉素（ampr）2，四環(huán)素 （tetr）3，氯霉素（camr/cat）4，卡那霉素 (Kanr )第四章DNA的復(fù)制、突變、損傷和修復(fù)DNA的復(fù)制★半保留復(fù)制：DNA復(fù)制過程中，兩條鏈分別做模板各自合成一條新的DNA鏈，子代DNA分子中一條鏈來自親代DNA，另一條鏈?zhǔn)切潞铣傻摹NA聚合酶活性；339。雙鏈體的復(fù)制以滾環(huán)復(fù)制方式進(jìn)行線狀DNA的復(fù)制過程1．復(fù)制從DNA中間開始—T7噬菌體復(fù)制起始必需的三個酶：T7RNA聚合酶、T7DNA聚合酶和基因4蛋白(gene product 4, gp4)復(fù)制由轉(zhuǎn)錄開始必需以RNA為引物2．復(fù)制從末端開始—腺病毒, 以單鏈置換形式進(jìn)行復(fù)制逆轉(zhuǎn)錄病毒的復(fù)制逆轉(zhuǎn)錄酶：1．RNA指導(dǎo)的DNA聚合酶（以RNA為模板合成DNA）2．DNA指導(dǎo)的DNA聚合酶（以DNA為模板合成DNA）3．核糖核酸酶H (RNase H)活性基因突變★突變(mutation)—DNA堿基序列發(fā)生可遺傳的改變1．堿基置換：指DNA分子中一個堿基對被另一個不同的堿基對取代所引起的突變，也稱為點突變（point mutation）。 ★1．同義突變：突變沒有引起編碼氨基酸變化，不影響蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)★2．錯義突變：堿基序列的改變引起表達(dá)產(chǎn)物蛋白質(zhì)氨基酸序列的改變★3．無義突變：指某個堿基的改變使編碼某種氨基酸的密碼子變?yōu)榻K止密碼子，使肽鏈過早終止，蛋白產(chǎn)物一般沒有活性 突變的原因1自發(fā)突變（spontaneous mutation)：由于正常的細(xì)胞活動，或細(xì)胞與環(huán)境的隨機(jī)相互作用的過程所引起的生物DNA序列的改變。 10區(qū)：TATA區(qū)(Pribnow box)，RNA聚合酶的牢固結(jié)合位點216。 (ρ)因子的轉(zhuǎn)錄終止 (ρ)因子的轉(zhuǎn)錄終止依賴r因子的終止：有些終止位點不形成強(qiáng)的發(fā)夾結(jié)構(gòu)，需用ρ蛋白來幫助轉(zhuǎn)錄終止r因子：：六聚體蛋白、水解各種核甘三磷酸促使新生RNA鏈從三元轉(zhuǎn)錄復(fù)合物中解離出來，從而終止轉(zhuǎn)錄。2 轉(zhuǎn)錄起始過程需要很多轉(zhuǎn)錄因子（transcription factor, TF ）參與，按一定順序與DNA形成復(fù)合物，協(xié)助RNA pol定位于轉(zhuǎn)錄起始點3 RNApol前移處處都遇上核小體，轉(zhuǎn)錄延長過程中可以觀察到核小體移位和解聚現(xiàn)象真核生物轉(zhuǎn)錄的終止爪蟾轉(zhuǎn)錄終止位點：TT3均含有7個堿基的保守序列5’—GACTTGG—3’T2是前體rRNA轉(zhuǎn)錄的初始終止位點T3是“失敗保險終止位點”轉(zhuǎn)錄的抑制作用 阻斷、抑制或干擾RNA的代謝過程，最終抑制轉(zhuǎn)錄的一類化合物1嘌呤或嘧啶類似物：巰基嘌呤、氟尿嘧啶2通過與DNA結(jié)合改變模板的功能：烷化劑、放線菌素、溴乙錠3與RNA酶結(jié)合影響其活力： 利福平/利福霉素—與原核細(xì)胞RNA聚合酶的β亞基非共價結(jié)合，阻止RNA轉(zhuǎn)錄的起始 α鵝膏蕈堿—真核生物RNA聚合酶Ⅱ的抑制劑轉(zhuǎn)錄后加工及其機(jī)制轉(zhuǎn)錄后加工:將各種前體RNA分子加工為成熟的各種RNA順反子：與多肽鏈相對應(yīng)的DNA片段連同啟動部位和終止部位原核生物mRNA為多順反子，即幾個結(jié)構(gòu)基因，利用共同的啟動子和終止信號經(jīng)轉(zhuǎn)錄成一條mRNA。②初始轉(zhuǎn)錄物多為多順反子rRNA轉(zhuǎn)錄后加工包括:1剪切： 前體被RNaseⅢ、RNaseR等剪切2修飾：修飾酶進(jìn)行堿基修飾3裝配： rRNA與蛋白質(zhì)結(jié)合形成核糖體的大、小亞基3，tRNA的加工 ①tRNA 初始轉(zhuǎn)錄本是多順反子②加工包括：A核酸內(nèi)切酶在tRNA兩端切斷B核酸外切酶從3’端逐個切去附加順序C在3’端加上CCAOHD核苷酸的修飾參與tRNA后加工