蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)(2)(已修改)
2025-05-13 18:19 本頁(yè)面
【正文】 第 5章 蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu) 一、研究蛋白質(zhì)構(gòu)象的方法 (一 )X射線(xiàn)衍射法 基本規(guī)律： X射線(xiàn)穿過(guò)原子平面層時(shí)，當(dāng)光程差等于波長(zhǎng)的倍數(shù)，反射波可以互相疊加形成衍射斑點(diǎn)。如圖 52所示，光程差等于 2dsinθ ,上述規(guī)律可總結(jié)為 Bragg方程： 2dsinθ =nλ (n=177。 1, 177。 2, 177。 3… ) (二 )研究溶液中蛋白質(zhì)構(gòu)象的光譜學(xué)方法 芳香族氨基酸在極性環(huán)境下吸收峰向短波長(zhǎng)移動(dòng)，稱(chēng)作籃移，反之會(huì)紅移。 變性和非變性蛋白質(zhì)熒光峰和熒光偏振的位置會(huì)有特定的變化。 由尼科爾棱鏡產(chǎn)生 由電光調(diào)制器產(chǎn)生 圓偏振光可看成是相位相差 90o的兩個(gè)平面偏振光疊加而成，若左、右圓偏振光因被測(cè)物的吸收而振幅不同，二者疊加會(huì)形成橢圓偏振光。 橢圓率 θ=短軸 /長(zhǎng)軸 =tanθ ≈33cl?ε(適合于小的 θ， ?ε= εR? εL， c為摩爾濃度， l為光程， ε 為摩爾吸光系數(shù) ） 摩爾橢圓率 [θ]λ=θ/cl 100=3300 ?ε (NMR) 二、穩(wěn)定蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)的作用力 （三）疏水作用 (熵效應(yīng) ) （四）鹽鍵 （五）二硫鍵 （一）氫鍵 （二）范德華力 定向效應(yīng) 誘導(dǎo)效應(yīng) 分散效應(yīng) 三、多肽主鏈折疊的空間限制 （一）酰胺平面與α 碳原子的二面角（ φ 和 ψ ）： 規(guī)定鍵兩側(cè)基團(tuán)為順式排列時(shí)為 0o，從 C沿鍵軸方向觀(guān)察，順時(shí)針旋轉(zhuǎn)的角度為正值。 （二）可允許的 φ和 ψ：拉氏構(gòu)象圖 (二 )可允許的φ和 ψ值： 拉氏構(gòu)象圖 由印度學(xué)者Ramachandran制作 四、二級(jí)結(jié)構(gòu)：多肽鏈折疊的規(guī)則方式 (一 )α 螺旋 螺旋
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