dna復(fù)性動力學(xué)ppt課件(已修改)
2025-05-10 22:15 本頁面
【正文】 DNA的復(fù)性動力學(xué) ? DNA復(fù)性過程遵循二級反應(yīng)動力學(xué) ? DNA復(fù)性過程中單鏈消失的速度用公式表示： dC/dt=kC2 其中 ， C是單位時間的單鏈 DNA的濃度 K＝復(fù)性速度常數(shù) ? DNA序列的復(fù)雜性、初始濃度、片段大小、溫度、離子強(qiáng)度 DNA復(fù)性的影響因素： 1/C1/ C0 = Kt dC / dt= KC2 積分 C / C0 = 1 / (1+KC0t ) 當(dāng) C/ C0 = 1/2 時 的 C0t值定義為 C0t1/2 C / C0 = 1/2 = 1 / (1+ KC0t(1/2)) Cot(1/2) = 1/K (mol. Sec / L) 即復(fù)性反應(yīng)完成一半時 dC /C2= Kdt 當(dāng) t=0， C=C0 ? 不同 DNA的 Cot (1/2)值不同 ， 與 K值相關(guān) ? DNA序列的復(fù)雜性影響 K值 : 在控制反應(yīng)條件 （ 初始濃度 、溫度 、 離子強(qiáng)度 、 片段大小 ） 相同的前提下 ， DNA分子的 C0t (1/2)值 ， 取決于核苷酸的排列復(fù)雜性 。 ? DNA序列的復(fù)雜性 (plexity) X： 最長的沒有重復(fù)序列的核苷酸對的數(shù)值 。 X= K Cot1/2 AAAAAAAA X = 1 ATCGATCGATCG X = 4 N 105 X = 105 Cot (1/2) = 1/K 復(fù)雜性 X 1 不同原核生物的 Cot曲線 復(fù)性分?jǐn)?shù)（1c/c0） ? Cot曲線： 表示復(fù)性速度與 DNA順序復(fù)雜性的關(guān)系。 ? 相同核苷酸數(shù)量的 DNA，復(fù)雜性小的 DNA分子濃度高，復(fù)性快， Cot (1/2)值小，復(fù)雜性大的 DNA分子復(fù)性慢， Cot (1/2) 大。 原核生物 Cot曲線的特點(diǎn)： 形狀相似 （ 跨越 23個數(shù)量級 ） ， Cot（ 1／ 2） 不相同 －－單一序列 只是復(fù)雜性不同 高度重復(fù)序列 Cot (1/2)值小 單一排列序列 Cot (1/2)) 大 poly(A) X=1 Cot(1/2)=2x106 T4 X= Cot(1/2)= 不同原核生物的 Cot曲線 P74圖－ 16 真核生物 DNA復(fù)性 曲線的模式圖 基因組為7X108 復(fù)性反應(yīng)分為三相，每相代表不同復(fù)雜長度的序列類型 Cot1/2 所占比例 復(fù)雜性 X 重復(fù)頻率 2 重復(fù)序列 (repetitive sequences) 根據(jù)復(fù)性動力學(xué)研究將真核生物 DNA序列歸類： ? 單拷貝序列 ? 輕度重復(fù)序列 ? 中度重復(fù)序列 ? 高度重復(fù)序列 ? 1）單拷貝序列 (single copy sequences) ? 又稱非重復(fù)序列： ? 一個基因組中只有一個拷貝。 ? 慢復(fù)性速度 ? 單一序列的復(fù)性曲線常只有一個拐點(diǎn)，而重復(fù)序列常有多個拐點(diǎn)。 ? 結(jié)構(gòu)基因 (蛋白質(zhì)基因 )大多是單拷貝序列。
教學(xué)課件相關(guān)推薦
鄂ICP備17016276號-1