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dna和rna的提取與純化(已修改)

2025-05-27 21:22 本頁(yè)面
 

【正文】 第四章 基因工程的主要技術(shù)及其原理 第一節(jié) DNA和 RNA的提取與純化 制備純的高分子量的 DNA 是基因工程操作的基礎(chǔ)之一 一、 DNA提取的基本原理與方法 化學(xué)性質(zhì) 比較穩(wěn)定 潛在的反應(yīng)基團(tuán)隱藏在中央螺旋內(nèi),并經(jīng)氫鍵緊密連接。它的堿基對(duì)外側(cè)受磷酸和糖形成的強(qiáng)大環(huán)層的保護(hù),這種保護(hù)因內(nèi)在的堿基堆積力而進(jìn)一步加強(qiáng)。 1. DNA的性質(zhì): 核苷 核苷酸 堿基 高分子質(zhì)量 DNA長(zhǎng)而彎曲,僅具有極微的側(cè)向穩(wěn)定性,因而容易受到最柔和的流體剪切力的傷害。雙鏈 DNA在溶液中隨機(jī)卷曲,并由于堿基堆積力和 DNA骨架上磷酸基團(tuán)間的靜電排斥力而變得黏滯。 由吸液,振蕩,攪拌所導(dǎo)致的水流對(duì)黏滯的盤繞物產(chǎn)生拖拉力,能切斷 DNA的雙鏈。 DNA分子越長(zhǎng),斷裂所需的力越弱。因此,基因組 DNA容易成片段地獲得,所需分子質(zhì)量越大,獲得的難度也相應(yīng)增加。 物理性質(zhì) 2. 天然 DNA的來(lái)源和用途 ? 天然 DNA包括染色體 DNA,病毒 DNA(噬菌體DNA),質(zhì)粒 DNA,線粒體及葉綠體 DNA等 ,可從不同的生物體中提取 . ?染色體 DNA. 其分子巨大 ,可長(zhǎng)達(dá) 106kb,小的也有 1000kb左右 .是生物界含量最豐富的 DNA資源 ,蘊(yùn)藏著地球上極大部分的遺傳信息 . 是分離目的基因和基因表達(dá)調(diào)控因子的主要材料 ,也可提供構(gòu)建染色體載體和染色體基因整合平臺(tái)系統(tǒng)之用 . ?病毒和噬菌體 DNA. 含 DNA的病毒和噬菌體的種類很多 ,能在相應(yīng)的原核生物和真核生物宿主細(xì)胞內(nèi)大量增殖 .由于此類 DNA可被體外包裝 ,所以主要用于構(gòu)建基因克隆載體 ,承載較大片段的外源DNA,經(jīng)體外包裝 ,導(dǎo)入受體細(xì)胞 .此類 DNA也編碼一些結(jié)構(gòu)基因 ,可作為分離目的基因和基因表達(dá)調(diào)控因子的材料 . ?質(zhì)粒 DNA 很多微生物細(xì)胞內(nèi)含有質(zhì)粒 DNA,游離于細(xì)胞質(zhì)中 ,所以被稱為染色體外遺傳物質(zhì) .每種質(zhì)粒都有復(fù)制起始位點(diǎn) ,能自我復(fù)制 .主要用于構(gòu)建載體 .也要用于分離目的基因和基因表達(dá)調(diào)控因子 . ?線粒體和葉綠體 DNA. 真核生物特有的染色體外遺傳物質(zhì) ,分別含有與呼吸作用和光合作用有關(guān)的基因 .可用于分離目的基因及構(gòu)建載體 不同生物(植物、動(dòng)物、微生物)的基因組 DNA的提取方法有所不同 。 不同種類或同一種類的不同組織因其細(xì)胞結(jié)構(gòu)及所含的成分不同,分離方法也有差異。在提取某種特殊組織的DNA時(shí)必須參照文獻(xiàn)和經(jīng)驗(yàn)建立相應(yīng)的提取方法, 以獲得可用的 DNA大分子。 (一) DNA提取的基本原理 DNA分子是極性分子,溶于水,不溶于乙醇、氯仿等有機(jī)溶劑,其鈉鹽比游離太更易溶于水。 酸性溶液中, DNA易水解,在中性或弱堿性溶液中較穩(wěn)定。 生物細(xì)胞中大部分 DNA集中在細(xì)胞核,多以脫氧核糖核蛋白(DNP)形式存在。而 DNP在鹽溶液中的溶解度受鹽溶液濃度的顯著影響, mol/L NaCl溶液中最低,僅為水中溶解度的 1%,濃度升高,溶解度增加,到 1 mol/L時(shí),比純水高 2倍。而核糖核蛋白 (RNP)在鹽溶液中的溶解度受鹽濃度的影響較小,在 mol/L NaCl的溶解度較大。據(jù)此,可分享 DNP和 RNP. 一般 DNA提取都分為兩步,即先是溫和或機(jī)制裂解細(xì)胞及溶解 DNA,接著采用幾種化學(xué)和酶學(xué)方法中的任一種, 以去除蛋白、 RNA及其它的大分子。 1生物材料的準(zhǔn)備 選用的材料應(yīng)該是處于提取 DNA得率最高的生長(zhǎng)期 ,或者是DNA容易提取和含量高的組織 .對(duì)于細(xì)菌 ,一般取對(duì)數(shù)生長(zhǎng)后期 .對(duì)于植物一般取幼嫩的植株 ,并且暗培養(yǎng) 12天 ,甚至黃化苗 .提取動(dòng)物肝臟 DNA應(yīng)清除膽囊 ,因其含有多種高活性酶 . 2細(xì)胞的裂解和 DNA的溶解 細(xì)胞不裂解 ,則 DNA釋放不出來(lái) .裂解不完全 ,得率就低 .如果細(xì)胞裂解過(guò)于激烈 ,會(huì)導(dǎo)致 DNA的斷裂 .裂解方法因物種而異 . 對(duì)于原核生物 ,可用溶菌酶處理 .用 NaOH,SDS,用煮沸及冰凍 ,超聲波處理等方法使細(xì)胞裂解 . 對(duì)結(jié)構(gòu)復(fù)雜的動(dòng)植物材料要進(jìn)行磨樣 (粉碎 )。一般方法是將材料放入研缽(放在冰中預(yù)冷),加入液氮,快速磨碎成粉狀。然后再參照裂解原核生物細(xì)胞的方法裂解細(xì)胞 . 一般用 SDS、 CTAB、溶菌酶和蛋白酶 K來(lái)裂解細(xì)胞。 所用緩沖液一般為 TE( TrisCHCl EDTA)緩沖液。 提取緩沖液: 100mmol/L Tris Cl(),50mmol/L EDTA (),500mmol/L NaCl,10mmol/L α巰基乙醇。 在提取時(shí),將 10% SDS加入緩沖液中于 65℃ 預(yù)熱一定時(shí)間。然后加入到裝有樣品的離心管中,于 65℃ 保溫 60- 90min。其間輕輕搖動(dòng)數(shù)次。 4℃ 下 12021rpm離心 10min,將上清轉(zhuǎn)入另一離心管中 ,上清即為DNA的粗提物。 正常條件下,由于細(xì)胞的區(qū)室化隔離, DNA酶,氧化酶等分布于特定 區(qū)隔中,不與 DNA接觸。細(xì)胞破碎,則容易導(dǎo)致 DA N降解。 因此提取過(guò)程中對(duì) DNA 的保護(hù)顯得非常重要。 措施: (1)利用液氮超低溫下研磨,減少損失。 (2)快速加入緩沖液并迅速混勻,對(duì)細(xì)胞溶漿中 DNA進(jìn)行保護(hù)。 加入 EDTA和抗氧化劑及 PVP等 3核酸的純化 主要根據(jù)核酸的性質(zhì) ,使其與細(xì)胞內(nèi)其它成分分離開(kāi)來(lái) ,從中進(jìn)一步抽提 DNA.( 雜質(zhì)的去除 ) 核酸通過(guò)有機(jī)溶劑抽提并進(jìn)行純化 。 污染的 RNA通過(guò)RNase消化清除 。 在粗提物中加入等體積的氯仿/異戊醇 ( 或酚/氯仿/異戊醇 ) 輕輕顛倒混勻 , 12021rpm離心 5min, 上清液為DNA的水溶液
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