蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能(2)-在線(xiàn)瀏覽
2025-06-19 13:42本頁(yè)面
【正文】 amily） 家族（ family） 亞家族（ subfamily） 形狀決定性質(zhì) 膜蛋白？ 對(duì)蛋白質(zhì)家族（ family)和蛋白質(zhì)超家族 (superfamily)的定義并不明確，一般把具有同源性結(jié)構(gòu)域及序列，進(jìn)化上相關(guān)的，功能相同的蛋白質(zhì)歸在同一個(gè)家族，蛋白質(zhì)家族常常是基因家族的同義詞。此后 PIR國(guó)際蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)（ PIRInternational Protein Sequence Database） 對(duì)蛋白質(zhì)進(jìn)行超家族分類(lèi)。 有的數(shù)據(jù)庫(kù)把有結(jié)構(gòu)與功能聯(lián)系的數(shù)個(gè)家族可以歸為蛋白質(zhì)超家族，下含數(shù)個(gè)亞家族（ subfamily)。 ? 形成一級(jí)結(jié)構(gòu)的化學(xué)鍵： 一級(jí)結(jié)構(gòu)是蛋白質(zhì)空間構(gòu)象和特異生物學(xué)功能的基礎(chǔ)，但不是決定蛋白質(zhì)空間構(gòu)象的唯一因素。 ? ?螺旋 ( ? helix ) ? ?折疊 ( ?pleated sheet ) ? ?轉(zhuǎn)角 ( ?turn ) ? 無(wú)規(guī)卷曲 ( random coil ) ? 蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)的主要形式： 維系二級(jí)結(jié)構(gòu)的主要化學(xué)鍵： 氫鍵 （一） 肽鍵是一個(gè)剛性的平面 參與肽鍵的 6個(gè)原子 C? C、 O、N、 H、 C?2位于同一平面 ， C?1和 C?2在平面上所處的位置為反式 (trans)構(gòu)型 ，此同一平面上的 6個(gè)原子構(gòu)成了所謂的肽單元 (peptide unit) 。氨基酸借肽鍵聯(lián)結(jié)成多 肽鏈 。它雖是單鍵，但具有部分雙鍵的性質(zhì)，難以 自由旋轉(zhuǎn) 而有一定的剛性，因此形成 肽鍵平面 ，則包括連接肽鍵兩端的 C═O、Ｎ－Ｈ和 2個(gè) Cα共 6個(gè)原子的空間位置處在一個(gè)相對(duì)接近的平面上，而相鄰2個(gè)氨基酸的側(cè)鏈 R又形成反式構(gòu)型，從而形成肽鍵與肽鏈復(fù)雜的空間結(jié)構(gòu)。 ⑴ 主鏈骨架本身以大約 180176。 （五）模體 是蛋白質(zhì)的超二級(jí)結(jié)構(gòu) 在許多蛋白質(zhì)分子中，可發(fā)現(xiàn)二個(gè)或三個(gè)具有二級(jí)結(jié)構(gòu)的肽段，在空間上相互接近，形成一個(gè)特殊的空間構(gòu)象 ， 并發(fā)揮專(zhuān)一的功能 ，被稱(chēng)為模體 (motif)。 DNA結(jié)合蛋白中的鋅指模體（ αββ組合） 鈣調(diào)素中的 EF 手型模體（ αα螺旋組合） 轉(zhuǎn)錄因子 MyoD的螺旋 環(huán) 螺旋模體 DNA結(jié)合蛋白中的同源異型模體 模體與功能 ? 相同的模體表現(xiàn)出相同的功能，因此，不同蛋白質(zhì)只要有部分相似功能就可能具有相似的模體。 （六） 氨基酸殘基的側(cè)鏈可影響二級(jí)結(jié)構(gòu)的形成 蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)是以一級(jí)結(jié)構(gòu)為基礎(chǔ)的。 這是氨基酸殘基的側(cè)鏈的相互作用可穩(wěn)定或去穩(wěn)定相應(yīng)的二級(jí)結(jié)構(gòu)的原因。 同樣 ， 多個(gè)堿性氨基酸殘基在一肽段內(nèi) ，由于正電荷相斥 ， 也妨礙 α螺旋的形成 。 脯氨酸的結(jié)構(gòu)不利于形成 α螺旋。 五、 多肽鏈在二級(jí)結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)上進(jìn)一步折疊形成蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu) （一）三級(jí)結(jié)構(gòu)是指整條多肽鏈的空間分布 蛋白質(zhì)的三級(jí)結(jié)構(gòu) (tertiary structure)是指 整條肽鏈中全部氨基酸殘基的相對(duì)空間位置 。 雞卵溶菌酶的三級(jí)結(jié)構(gòu) ? 肌紅蛋白 (Mb) 的三級(jí)結(jié)構(gòu) 153 AA 1 Heme （亞鐵血紅素） A~H八段 α螺旋 無(wú) SS鍵 功能：儲(chǔ)存 O2 (二 ) 維持三級(jí)結(jié)構(gòu)穩(wěn)定主要依靠非共價(jià)鍵 ? 蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)的形成和穩(wěn)定主要靠弱的相互作用力或稱(chēng)非共價(jià)鍵、次級(jí)鍵，主要有氫鍵、 Van der Waals力、疏水作用、和離子鍵等。 (四 ) 根據(jù)結(jié)構(gòu)域可對(duì)蛋白質(zhì)進(jìn)行分類(lèi) 根據(jù)結(jié)
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