分子生物學(xué)數(shù)據(jù)庫-在線瀏覽
2025-05-25 03:16本頁面
【正文】 基因的位置進(jìn)到如上界面時(shí)我們可以通過界面看到所有不同結(jié)果（左列）在基因區(qū)域的分布而在這里我們可以選擇想要在界面顯示的序列，每個(gè)父項(xiàng)都可以展開，每個(gè)父項(xiàng)都有許多的子項(xiàng)供選擇 彭思杰IntAct鏈接：介紹：EBI下的一個(gè)蛋白質(zhì)互作信息數(shù)據(jù)庫，里面包含了模式生物以及常見生物的蛋白質(zhì)互作信息。這兩個(gè)軟件以及數(shù)據(jù)庫的資料都可以免費(fèi)在ftp中進(jìn)行下載。里面包括了參與反應(yīng)的兩個(gè)分子以及反應(yīng)類型等信息，左上角也提供了各種格式的結(jié)果下載，可以進(jìn)行批量下載。InterPro 可以提供域、蛋白質(zhì)家族及位點(diǎn)的相關(guān)信息。InterPro 支持搜索的ID 除了其自身數(shù)據(jù)庫的ID，還可以用pfam（蛋白質(zhì)域數(shù)據(jù)庫）或GO（基因注釋）的ID 進(jìn)行搜索。從圖中左側(cè)可以看出InterPro 所包含的信息有四種，包括蛋白質(zhì)家族、域、蛋白質(zhì)重復(fù)和位點(diǎn)。最后，作為作為蛋白質(zhì)序列分析的數(shù)據(jù)庫，InterPro 也支持直接分析蛋白質(zhì)序列，下圖是序列搜索結(jié)果的頁面。 石逸飛Manet數(shù)據(jù)庫Manet數(shù)據(jù)庫的介紹 Manet數(shù)據(jù)庫很小，它的的特點(diǎn)是提供定性和定量的生物系統(tǒng)中分子相互作用的網(wǎng)絡(luò)。而現(xiàn)在，這個(gè)網(wǎng)站和多個(gè)知名的生物代謝網(wǎng)絡(luò)網(wǎng)站都有合作，比如KEGG和SCOP，對(duì)于文獻(xiàn)中每一個(gè)蛋白或者酶，都提供KEGG的具體說明。 。是一個(gè)專門領(lǐng)域研究的人比較常用的數(shù)據(jù)庫。使用比較簡(jiǎn)單。每一個(gè)大的家族下的一個(gè)小的家族為例，對(duì)這些分類也很做的很詳細(xì)，分為了細(xì)菌，真菌，有結(jié)構(gòu)的酶。 楊佳蓓Protein lounge 這是一個(gè)涵蓋了代謝途徑，蛋白質(zhì)，siRNA等的數(shù)據(jù)庫。這個(gè)數(shù)據(jù)庫的特色在于他提供了相關(guān)的圖片和視頻，讓用戶更清晰地看到代謝途徑的過程
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