6x射線衍射在藥學(xué)中的應(yīng)用-文庫吧資料
2024-10-05 21:01本頁面
【正文】 解釋藥物分子的作用機(jī)理。 5 氫鍵、鹽鍵、配位鍵等的計(jì)算與分子排列規(guī)律 ? 氫鍵、鹽鍵、配位鍵等是研究藥物分子生物活性中的重要信息。 4 構(gòu)象分析 ? 從單晶 X射線衍射分析所得分子的立體結(jié)構(gòu)中 ,可以準(zhǔn)確地計(jì)算出被測化合物的構(gòu)象信息 : 即組成藥物分子骨架各環(huán)的船或椅式構(gòu)象、環(huán)與環(huán)間的順反聯(lián)接方式、環(huán)自身的平面性質(zhì)、環(huán)與環(huán)間的扭轉(zhuǎn)角、側(cè)鏈的相對取向位置、大環(huán)構(gòu)象等。 ?解決方法：可用前面的引入局部已知構(gòu)型、引入重原子或與手性試劑共結(jié)晶等方法，也可降低衍射數(shù)據(jù)收集時(shí)的溫度。 ? 3) 局部 Cuk 輻射數(shù)據(jù)，其最終絕對構(gòu)型因子大于 ，或偏差較大，難以判斷其絕對構(gòu)型。 單晶 X射線衍射測定天然產(chǎn)物絕對構(gòu)型的局限性 ? 能否得到合用的單晶〔制約環(huán)節(jié)〕 第二十五頁，共四十五頁。 產(chǎn)物 4的絕對構(gòu)型分析 Flack parameter x= () 絕對構(gòu)型與產(chǎn)物 3一致 第二十三頁，共四十五頁。 中間產(chǎn)物 2的絕對構(gòu)型分析 Flack parameter x= 3(2) Flack parameter x= 4(2) 第二十一頁，共四十五頁。 例如 : absolute configuration of neostenine，空間群 P212121 Neostenine is an alkaloid isolated from the root tubers of Stemona tuberosa Lour. Flack parameter x= 1(2) Flack parameter x= 0(2) Mok?輻射 第十九頁，共四十五頁。 4) 向天然產(chǎn)物中引入能看出構(gòu)型片段 (S)2methoxy2(1naphthyl)propionic ester of PF1140 Fujita, et al. J. Antibiot. 2024, 58(6): 425–427. 第十七頁，共四十五頁。 But, P. P. H.。 Jiang, R. W.。 當(dāng)分子中不含重原子時(shí) 1) 大多數(shù)天然產(chǎn)物分子由碳、氫、氮、氧組成，不含重原子，采用反常散射能力較強(qiáng)的Cuk 輻射〔可將氮、氧看成較重原子〕，對于大局部結(jié)構(gòu)，仍然可以計(jì)算出正確的絕對構(gòu)型，例如 : 19norbufenolide A Tian et al. Chem. A Eur. J. 2024, 16, 1098910993. 第十四頁，共四十五頁。 當(dāng)分子中含有重原子時(shí)〔原子序數(shù)大于硅原子〕 采用 Cuk?或 Mok?輻射，均可獲得具有顯著意義的絕對構(gòu)型因子，從而可判斷分子的決對構(gòu)型，例如： cycloartan3,29 diol23one 3,29disodium sulfate Jiang, R. W.。 ? Cu靶輻射的反常散射能力強(qiáng)，而 Mo靶輻射的反常散射能力弱 ?測定絕對構(gòu)型因子即可獲得分子的絕對構(gòu)型 第十一頁，共四十五頁。 在重原子存在的條件下 ? Ihkl ≠ Ihkl , ?hkl ≠ ?hkl, ?Fhkl?2≠ ?Fhkl ?2 ? ?Fhkl?2= (1x) ?Fhkl?2 + x?Fhkl ?2 ? 式中 x即為絕對構(gòu)型因子 (Flack parameter)。
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