微生物的進(jìn)化-文庫吧資料
2025-01-01 15:48本頁面
【正文】 學(xué) 和 生態(tài)學(xué)特征 之外，還必須尋找新的特征作為分類鑒定的依據(jù)。 但 70年代以后 ， 對(duì)細(xì)菌進(jìn)行全面分類的 、 影響最大的是 《 伯杰氏手冊(cè) 》 。發(fā)表新名稱時(shí)，應(yīng)在新名稱之后加上所屬新分類等級(jí)的縮寫詞， 如新目“ .”、新屬“ .”、新種“ .”等。 二 . 微生物的命名 3. 新名稱的發(fā)表 根據(jù)細(xì)菌命名法規(guī)的規(guī)定，有效發(fā)表新的細(xì)菌名稱應(yīng)在公開發(fā)行的刊物上進(jìn)行，在菌種目錄、會(huì)議記錄、會(huì)議論文摘要的均不能視為有效發(fā)表。 二 . 微生物的命名 2. 命名模式及其指定 如前所述，由于細(xì)菌分類單元的劃分缺乏一個(gè)易于操作的統(tǒng)一標(biāo)準(zhǔn)，為了減少因采用不同標(biāo)準(zhǔn)界定分類單元所造成的混亂， 細(xì)菌系統(tǒng)分類也像其他生物分類一樣采用 “模式概念” 。 ⑵ 種名 和其他生物一樣，細(xì)菌的種名也用雙名法（ binomial nomenclature）命名，即種的學(xué)名由屬名和種名加詞兩部分組合而成。 ?種（ species),是生物分類中基本的分類單元和分類等級(jí)。 ?菌株（ strain)， 從自然界分離得到的任何一種微生物的純培養(yǎng)物都可以稱為微生物的一個(gè)菌株；用實(shí)驗(yàn)方法（如通過誘變）所獲得的某一菌株的變異型，也可以稱為一個(gè)新的菌株，以便與原來的菌株相區(qū)別。 第三節(jié) 細(xì) 菌 分 類 ?分類（ classification） 是根據(jù)一定的原則（表型特征相似性或系統(tǒng)發(fā)育相關(guān)性）對(duì)微生物進(jìn)行分群歸類，根據(jù)相似性或相關(guān)性水平排列成系統(tǒng)，并對(duì)各個(gè)分類群的特征進(jìn)行描述，以便考察和對(duì)未被分類的微生物進(jìn)行鑒定； ?命名（ nomenclature） 是根據(jù)命名法規(guī)，給每一個(gè)分類群一個(gè)專有的名稱； 第三節(jié) 細(xì) 菌 分 類 ?鑒定（ identification或determination） 則是指借助于現(xiàn)有的微生物分類系統(tǒng)，通過特征測(cè)定，確定未知的、新發(fā)現(xiàn)的或未明確分類地位的微生物所應(yīng)歸屬分類群的過程。我們要認(rèn)識(shí)、研究和利用各種微生物資源也必須對(duì)他們進(jìn)行分類。 五、三界生物的主要特征 （界）域生物的主要特征 三界理論雖然是根據(jù) 16Sr RNA序列 的比較提出的，但其他特征的比較研究結(jié)果也在一定程度上支持了三界生物的劃分。 五、三界生物的主要特征 將生物分成三界 （ Kingdom） （ 后來改稱三個(gè)域 ） ： 古細(xì)菌 、 真細(xì)菌 （ E u b a c t e r i a） 真核生物（ Eukaryotes） 。 ?系統(tǒng)樹可能有時(shí)間比例 ， 或者用兩個(gè)結(jié)之間的分枝長(zhǎng)度變化來表示分子序列的差異數(shù)值 。 ?通過比較生物大分子序列差異的數(shù)值構(gòu)件的系統(tǒng)樹稱為 分子系統(tǒng)樹 。 ?這種方法用反轉(zhuǎn)錄酶和雙脫氧序列分析，可以對(duì)未經(jīng)純化的 rRNA抽提物進(jìn)行直接的序列測(cè)定。 三、 rRNA的順序和進(jìn)化 2. 全序列分析法 ?寡核苷酸編目分析法，只獲得了 16SrRNA分子的大約 30%的序列資料，加上采用的是一種簡(jiǎn)單相似性的計(jì)算方法，所以其結(jié)果有可能出現(xiàn)誤差，應(yīng)用上受到一定限制。 三、 rRNA的順序和進(jìn)化 rRNA序列測(cè)定和分析方法分兩類：寡核苷酸編目法和全序列分析法 。 二、 rRNA作為進(jìn)化的指征 大量的實(shí)驗(yàn)研究表明：在眾多的生物大分子中，最適合于揭示各類生物親緣關(guān)系的是 rRNA,尤其是 16SrRNA。 一、進(jìn)化指征的選擇 ? ③為了鑒定大分子序列的同源位置或同源區(qū)，要求所選擇的分子序列必須能嚴(yán)格線性排列，以便進(jìn)行進(jìn)一步的分析比較。催化不同反應(yīng)的酶的氨基酸序列或者具有不同功能核酸的核苷酸序列不能進(jìn)行比較，因?yàn)楣δ懿幌嚓P(guān)的分子也意味著進(jìn)化過程中來源不同，對(duì)這一類不相關(guān)分子進(jìn)行比較也不期望它們會(huì)表現(xiàn)出序列的相
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